Dynamic simulations of novel oligomers containing fluorinated segments
Florlu yapı içeren yeni oligomerlerin dinamik simülasyonları
- Tez No: 152820
- Danışmanlar: DOÇ.DR. CANAN BAYSAL
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Kimya, Polimer Bilim ve Teknolojisi, Chemistry, Polymer Science and Technology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2004
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Sabancı Üniversitesi
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 63
Özet
ÖZET Günümüzde güzel uygulamaları olan birçok florlu polimer tasarlanmaktadır. Bu polimerlerin özelliklerini teorik açıdan anlamak için hesaplamasal çalışmalar önemli bir yer teşkil etmektedir. Bu tezde, düzgün ve graft polimerlere kuvantum, atomic ve mezo ölçeklerde bilgisayar simulasyonlan yapıldı. Yan deneysel kuvatum metodu polimerlerin yapışım potansiyel enerji yüzeyindeki global minimum seviyesine kadar optimize etmede başarısız bulunmuştur ve bu metod uzun zincirli polimerlerin konformasyonel araştırma analizleri için uygun değildir. Öbür taraftan yan deneysel kuvatum metotlar 13C kimyasal kaymalan ve oluşma enatlpilerini tahmin etmede kullanılabilir. Güçlü elektrik alammn polimerlein konformasyonel özellikleri üzerindeki etkilerini anlamak için bulk florlu polimer sistemlerine elektirik alanda MD simulasyonlan yapıldı. -CN fonksiyonel gruplannm polar özeliğinden dolayı elektrik alan doğrultusunda yöneldiler ve tam yönelim 1011 V/m mertebesinde gerçekleşti. Polarizasyonun sistemin özkütlesi ve uygulanan elektirik alanla arttığım gözlemledik. Graft ve düzgün polimerlerin polimerlerin değişik oranlardaki polimer-çözücü faz morfolojilerini anlamak için mezo ölçekli simulasyon metodlan kullanıldı (Dissipative Partide Dynamics ve Mesodyn). Çözücü içerisinde iki polimer de küresel morfolojilere sahip olduğu gözlendi, iki metod mezo ölçekte simulasyonlar için farklı yaklaşımlar kullanmasına rağmen benzer sonuçlar verdi ve birbirlerinin yerine kullanılabilirler.
Özet (Çeviri)
ABSTRACT Nowadays, many fluorinated polymers are designed for novel applications. Computational studies are very important in understanding their properties from a theoretical point of view. In this thesis, we carry out computer simulations of linear and graft fluorinated polymers at the quantum level as well as the atomistic and mesoscopic scales. The semiempirical quantum mechanical approach can not optimize the structure of the polymers to their global minima of the potential energy surface and is not an appropriate method for conformational search analysis of the long chain polymers. On the other hand, it can be used to predict 13C chemical shifts and heats of formation. We performed MD simulations on bulk linear fluorinated polymers under external electric field to investigate the effects of strong electric field on the conformational properties of the polymers. Cyanide functional groups in the polymer are aligned along the applied electric field due to their polarity. A total alignment of the cyanide groups is observed only at electric fields on the order of 10 V/m. We observe that polarization increases with increased electric field and density of the system. We also used two mesoscale simulation methods, Dissipative Particle Dynamics (DPD) and MesoDyn, to simulate the polymer-solvent mesophase morphologies of the graft and fluorinated polymers at different concentrations. It is observed that both polymers have spherical morphology in an aprotic solvent. Although DPD and MesoDyn use different approaches for the simulation of mesoscale structures, they give similar results and can be used interchangeably to predict three-dimensional phase behaviour. We predict that the wettability of the linear polymers should be higher than that of the graft, and this is in accordance with experimental findings on these systems. IV
Benzer Tezler
- Computational investigation and modulation of structural and functional properties of proteins for therapeutic purposes
Protein yapı ve dinamiğinin hesaplamalı yöntemler aracılığıyla incelenmesi ve terapötik amaçlar için modülasyonu
SAMMAN MANSOOR
Doktora
İngilizce
2021
Biyofizikİstanbul Medipol ÜniversitesiBiyomedikal Bilimler ve Mühendislik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ÖZGE ŞENSOY
- Conformational and dynamical properties of high performance polymers designed for novel applications
Yeni uygulamalar için dizayn edilmiş yüksek performanslı polimerlerin konformasyonel ve dinamik özellikleri
SERDAL KIRMIZIALTIN
- Kontrollü aktif molekül salımı yapan pektin temelli hidrojellerin geliştirilmesi
Developing pektin-based hydrogels with controlled delivery of active molecules
AYŞE BANU KOCAAĞA
Doktora
Türkçe
2021
Biyomühendislikİstanbul Teknik ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYŞE ÖZGE KÜRKÇÜOĞLU LEVİTAS
PROF. DR. FATMA SENİHA GÜNER
- Structural and thermodynamic analyses of peptide-based nanomaterials via molecular dynamics simulations
Peptit bazlı nanomalzemelerin moleküler dinamik simulasyonlar aracılığı ile yapısal ve termodinamik özelliklerinin analizi
ÖZGE ŞENSOY
Doktora
İngilizce
2011
BiyofizikKoç ÜniversitesiHesaplamalı Bilimler ve Mühendislik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MEHMET SAYAR
- Yeni HSP90 inhibitörlerinin tespiti için in siliko ilaç yeniden kullanım yaklaşımı ve in vitro değerlendirme
In silico drug repurposing approach and in vitro evaluation for determination of novel HSP90 inhibitors
TUĞBA TAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyokimyaAtatürk ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ DERYANUR KILIÇ