Bioprocess operation parameters for recombinant benzaldehyde lyase production
Rekombinant benzaldehit liyaz üretimi için biyoproses işletim parametrelerinin araştırılması
- Tez No: 153594
- Danışmanlar: DOÇ. DR. PINAR ÇALIK, PROF. DR. AYHAN SITKI DEMİR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Kimya Mühendisliği, Chemical Engineering
- Anahtar Kelimeler: Benzaldehit Liyaz, Üretim, Rekombinant E. coli, Oksijen Aktarımı, pH Etkisi, Benzaldehyde Lyase, Production, Recombinant E. coli, Oxygen Transfer, pH Effects
- Yıl: 2004
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 103
Özet
öz REKOMBİNANT BENZALDEHİT LİYAZ ÜRETİMİ İÇİN BİYOPROSES İŞLETİM PARAMETRELERİNİN ARAŞTIRILMASI Yılgör, Pınar Yüksek Lisans, Kimya Mühendisliği Tez Yöneticisi : Doç. Dr. Pınar Çalık Ortak Tez Yöneticisi : Prof. Dr. Ayhan Sıtkı Demir Ağustos 2004, 85 sayfa Bu çalışmada, biyoproses işletim parametrelerinin benzaldehit liyaz üretimine etkileri sistematik olarak incelenmiştir. Bu amaçla, araştırma programı başlıca dört bölümde yürütülmüştür. Çalışmanın ilk bölümünde, en yüksek benzaldehit liyaz üretim kapasitesine sahip olan Escherichia coli K12 (ATCC 10798), konak hücre olarak seçilmiştir. Daha sonra, seçilen bu mikroorganizma kullanılarak, karbon ve azot kaynaklarının etkisinin araştırılmasıyla ortam tasarımı yapılmıştır. İncelenen koşullarda, en yüksek hücre derişimi ve enzim aktivitesi sırasıyla 1.8 kg m“3 ve 745 U cm”3 olarak; 8.0 kg m“3 glukoz, 5.0 kg m”3 (NH4)2HP04 ve tuz çözeltisi içeren ortamda elde edilmiştir. Tasarlanan üretim ortamı kullanılarak, biyoreaktör işletim parametrelerinden oksijen aktarımı ve pH etkileri; fermantasyon ve oksijen aktarım karakteristikleri pilot ölçek biyoreaktörde incelenmiştir. Benzaldehit liyaz üretiminde oksijen aktarımının etkileri, hava giriş hızı Q0/VR=0.5 vvm; karıştırma hızları N = 250, 375, 500, 625, 750 dk1 ve Q0/VR=0.7 vvm, N=750 dk1 koşullarında incelenmiştir. İncelenen koşullar arasında en yüksek hücre derişimi ve enzim aktivitesine sırasıyla 2.3 kg m“3 ve 860 U cm 3 olarak ulaşılmıştır. Son olarak benzaldehit liyaz üretiminde pH etkileri en uygun oksijen aktarım koşulu olarak belirlenmiş olan 0.5 vvm, 500dk”1 koşulunda incelenmiştir. Bu amaçla altı ayrı kontrollü pH deneyi pHc=5.0, 6.4, 6.7, 7.0, 7.2, 7.8 koşullarında gerçekleştirilmiştir. En yüksek hücre derişimi ve enzim aktivitesine sırasıyla 2.1 kg m3 ve 775 U cm"3 olarak, pHc=7.0 koşulunda ulaşılmıştır; ancak, bu değerler pHuc=7.2 pH kontrolsüz koşulda ulaşılan değerlerden düşüktür. Bu nedenlerle, benzaldehit liyaz üretiminde orta oksijen aktarım koşulu ve kontrolsüz pH koşulu uygulanmasına karar verilmiştir.
Özet (Çeviri)
ABSTRACT BIOPROCESS OPERATION PARAMETERS FOR RECOMBINANT BENZALDEHYDE LYASE PRODUCTION Yılgör, Pınar M.S., Department of Chemical Engineering Supervisor : Assoc. Prof. Dr. Pınar Çalık Co-Supervisor : Prof. Dr. Ayhan Sıtkı Demir August 2004, 85 pages In this study, the effects of bioprocess operation parameters on benzaldehyde lyase production were systematically investigated. For this purpose, the research program was carried out in mainly four parts. In the first part of the study, Escherichia coli K12 (ATCC 10798), having the highest benzaldehyde lyase production capacity, was selected as the host microorganism. Next, using the selected microorganism, the production medium was designed in terms of its carbon and nitrogen sources. Among the investigated media, the highest cell concentration and benzaldehyde lyase activity were obtained as 1.8 kg m“3 and 745 U cm”3, respectively, in the medium containing 8.0 kg m“3 glucose, 5.0 kg m”3 (NH4)2HP04 and the salt solution. Thereafter, by using the designed medium, the effects of bioreactor operation parameters, i.e., oxygen transfer and pH, were investigated in pilot scale bioreactor. Oxygen transfer effects on benzaldehyde lyase production were investigated at Qo/VR=0.5 vvm; N = 250, 375, 500, 625, 750 min1 and at qo/Vr=0.7 vvm, N = 750 min-1 conditions. The highest cell concentration and benzaldehyde lyase activity were obtained at 0.5 vvm, 500 min1 condition as 2.3 kg m 3 and 860 U cm“3, respectively. IVFinally, the effect of pH was investigated for benzaldehyde lyase production process at Qo/VR=0.5 vvm, N = 500 min”1 condition, at pHc=5.0, 6.4, 6.7, 7.0, 7.2 and 7.8 values. Among the investigated pH values, the highest cell concentration and enzyme activity were obtained at pHc=7.0 condition as 2.1 kg rrf3; 775 U cm"3. However, the values obtained at this condition, were lower than the values obtained at pHuc=7.2 uncontrolled pH operation. Hence, medium oxygen transfer condition and uncontrolled pH operation are found to be favorable for benzaldehyde lyase production.
Benzer Tezler
- Recombinant therapeutic protease production by Bacillus sp.
Terapatik rekombinant proteaz streptokinazın Bacillus türleriyle üretimi
NURİYE KORKMAZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2007
BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. PINAR ÇALIK
PROF. DR. SEMRA KOCABIYIK
- Extracellular recombinant human growth hormone production by Pichia pastoris
Pichia pastoris ile hücredışı insan büyüme hormonu üretimi
MEHMET ALİ ORMAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2007
BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. PINAR ÇALIK
PROF. DR. TUNÇER H. ÖZDAMAR
- Production of recombinant antibody fragments in bacteria and their development towards medical diagnosis
Rekombinant antikor fragmanlarının bakterilerde üretimi ve tıbbi tanıya yönelik geliştirilmesi
İLKAY KOÇER KULOĞLU
Doktora
İngilizce
2021
Kimya MühendisliğiHacettepe ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. EDA ÇELİK AKDUR
PROF. DR. MATTHEW P. DELISA
- Kesikli-biyoreaktör işletim türlerinin terapatik protein üretimine etkilerinin incelenmesi
Influences of batch bioreactor operation modes in therapeutic protein production
HANDE AFŞAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
Kimya MühendisliğiAnkara ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HASAN TUNÇER ÖZDAMAR
- Metabolik mühendislik ve reaksiyon mühendisliği prensipleriyle hücre-dışı rekombinant insan büyüme hormonu üretimi
Extracellular recombinat human growth hormone production by metabolic engineering and reaction engineering principles
ÖZGE DENİZ YILMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2008
Kimya MühendisliğiAnkara ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜZİDE ÇALIK
PROF. DR. H. TUNÇER ÖZDAMAR