Pirazinamide dirençli mycobacterium tuberculosis kompleks kökenlerinde pncA genindeki mutasyonların araştırılması
Detection of pncA gene mutations in pyrazinamide-resistant mycobacterium tubercilosis complex isolates
- Tez No: 163471
- Danışmanlar: DOÇ.DR. ÖZLEM TANSEL
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Mycobacterium tuberculosis, ilaç direnci, Pirazinamid, PCR-RFLP, pncA mutasyonu 39, Mycobacterium tuberculosis, drug resistance, Pyrazinamide, PCR-RFLP, pncA mutation 40
- Yıl: 2005
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Trakya Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 50
Özet
ÖZET Tüberküloz hala dünyada mortalite ve morbiditerıin en önde gelen nedenlerinden biri olarak bilinmektedir. Mycobacterium tuberculosis'ln ilaç direncinden dolayı tüberküloz kontrolü daha zor olmaktadır. Pirazinamid, tüberküloz tedavisi için kullanılan birinci seçenek ilaçlardan biridir. Mycobacterium tuberculosis pirazinamidi, pirazinamidaz enzimini kullanarak aktif hale çevirir. Bu enzim pncA geninde kodlanır ve pncA genindeki mutasyonlar aktif enzimin yokluğuna ve böylece pirazinamide karşı dirence neden olur. Bu çalışmada, kord oluşumu, NAP testi PCR-RFLP yöntemi ile kökenlerin M. tuberculosis kompleks olduğu gösterilmiştir. BACTEC yöntemiyle ve pirazinamidaz testiyle pirazinamid duyarlılık sonuçları uyumlu bulunan kökenlerde, pncA genindeki mutasyonlar DNA dizi analizi yöntemiyle saptanmıştır. Amacımız klasik duyarlılık testleriyle saptanan pirazinamid dirençli kökenlerdeki pncA gen mutasyonlarını tespit etmek ve literatürdeki mutasyonlarla sonuçlarımızı karşılaştırılmaktır. iki pirazinamid duyarlı kökende ve 10 pirazinamid dirençli kökenin üçünde mutasyon bulunamadı. Pirazinamid dirençli kökenlerin ikisinde aynı bölgede mutasyon(GGC 71 GAC), ikisinde farklı bölgelerde mutasyonlar (ACA479 AAA), (CAC 152 CCC) bulundu. Pirazinamid dirençli kökenlerin üçünde ise aynı bölgede delesyon (CTG-AAT (102-269)) bulundu. Sonuç olarak, çalışmamızda 152. kodondaki mutasyon daha önceki literatürlerde bildirilmişken, iki mutasyon ve bir delesyon daha önceden bildirilmemiştir.
Özet (Çeviri)
SUMMARY Tuberculosis still remains one of the leading causes of morbidity and mortality worldwide. Controlling tuberculosis becomes more difficult because of the drug-resistant Mycobacterium tuberculosis. Pyrazinamide has become one of the first-line drugs for the treatment of tuberculosis. Mycobacterium tuberculosis converts pyrazinamide to its active form by using the enzyme pyrazinamidase. This enzyme is coded for on the pncA gene, and mutations in the pncA gene result in absence of active enzyme, conferring resistance to the drug pyrazinamide. In the present study, the strains were identified as M. tuberculosis complex by cord factor, NAP test and PCR-RFLP. Then, pyrazinamide susceptibility was studied by BACTEC methodology and pyrazinamidase test. The mutations of pncA gene have been detected with DNA sequencing. Our aim was to identify the mutation of pncA gene in pyrazinamide resistant isolates detected by the classical susceptibility tests and to compare our results with the mutations in literature reported before. In two PZA susceptible and in three of 10 pyrazinamide resistant strains, no mutations were determined. Two of the pyrazinamide resistant strains had mutations in the same region (GGC 71 GAC). Two of the pyrazinamide resistant strains had different mutations (ACA 479 AAA), (CAC 152 CCC). Three of the pyrazinamide resistant strains had deletion in the same region (CTG-AAT (102-269)). As a result, mutation in 152. codon was reported in previous studies; two new mutations and a deletion were determined responsible for pyrazinamide resistance in our study.
Benzer Tezler
- Machine learning assisted force field development for nucleic acids
Nükleik asitler için makine öğrenimi destekli kuvvet alanı geliştirilmesi
GÖZDE İNİŞ DEMİR
Doktora
İngilizce
2024
Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrolİstanbul Teknik ÜniversitesiHesaplamalı Bilimler ve Mühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ADEM TEKİN
- Omurga tüberkülozunda dekompresyon, debridman ve enstrumantasyon sonuçlarının değerlendirmesi: 17 olgu
Evaluation of the results of decompression, debridge and instrumentation in spine tuberculosis: 17 cases
NURİ SERDAR BAŞ
- Mycobacterium tuberculosis izolatlarında pirazinamid direncinin hızlı tespitinde kolorimetrik yöntemlerin etkinliğinin araştırılması
Investigation of the efficacy of colorimetric methods in quick determination of pyrazinamid resistance in mycobacterium tuberculosis isolates
AHMET UĞUR AKBAL
Doktora
Türkçe
2018
MikrobiyolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BELMA DURUPINAR
- Bazı metal iyon komplekslerinin sentezi, XRD, EPR ve UV teknikleri ile yapılarının ve orbital bağ katsayılarının hesaplanması
Synthesis of some metal ion complexes, calculation of their structures and orbital bonding coefficients with XRD, EPR and UV tecniques
YUNUS ÇELİK
Doktora
Türkçe
2022
Fizik ve Fizik MühendisliğiOndokuz Mayıs ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. METİN YAVUZ
- Antitüberküloz ilaçların polimorf nüveli lökosit fonksiyonları üzerine in vitro etkisinin araştırılması
An in vitro investigation of the effect of antituberculous drugs on functions of polymorphonuclear leukocyte
BETÜL OKUYAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2004
Eczacılık ve FarmakolojiMarmara ÜniversitesiFarmakoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FİKRET VEHBİ İZZETTİN
PROF. DR. ADİLE ÇEVİKBAŞ