Pirazinamide dirençli mycobacterium tuberculosis kompleks kökenlerinde pncA genindeki mutasyonların araştırılması
Detection of pncA gene mutations in pyrazinamide-resistant mycobacterium tubercilosis complex isolates
- Tez No: 163471
- Danışmanlar: DOÇ.DR. ÖZLEM TANSEL
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Mycobacterium tuberculosis, ilaç direnci, Pirazinamid, PCR-RFLP, pncA mutasyonu 39, Mycobacterium tuberculosis, drug resistance, Pyrazinamide, PCR-RFLP, pncA mutation 40
- Yıl: 2005
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Trakya Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 50
Özet
ÖZET Tüberküloz hala dünyada mortalite ve morbiditerıin en önde gelen nedenlerinden biri olarak bilinmektedir. Mycobacterium tuberculosis'ln ilaç direncinden dolayı tüberküloz kontrolü daha zor olmaktadır. Pirazinamid, tüberküloz tedavisi için kullanılan birinci seçenek ilaçlardan biridir. Mycobacterium tuberculosis pirazinamidi, pirazinamidaz enzimini kullanarak aktif hale çevirir. Bu enzim pncA geninde kodlanır ve pncA genindeki mutasyonlar aktif enzimin yokluğuna ve böylece pirazinamide karşı dirence neden olur. Bu çalışmada, kord oluşumu, NAP testi PCR-RFLP yöntemi ile kökenlerin M. tuberculosis kompleks olduğu gösterilmiştir. BACTEC yöntemiyle ve pirazinamidaz testiyle pirazinamid duyarlılık sonuçları uyumlu bulunan kökenlerde, pncA genindeki mutasyonlar DNA dizi analizi yöntemiyle saptanmıştır. Amacımız klasik duyarlılık testleriyle saptanan pirazinamid dirençli kökenlerdeki pncA gen mutasyonlarını tespit etmek ve literatürdeki mutasyonlarla sonuçlarımızı karşılaştırılmaktır. iki pirazinamid duyarlı kökende ve 10 pirazinamid dirençli kökenin üçünde mutasyon bulunamadı. Pirazinamid dirençli kökenlerin ikisinde aynı bölgede mutasyon(GGC 71 GAC), ikisinde farklı bölgelerde mutasyonlar (ACA479 AAA), (CAC 152 CCC) bulundu. Pirazinamid dirençli kökenlerin üçünde ise aynı bölgede delesyon (CTG-AAT (102-269)) bulundu. Sonuç olarak, çalışmamızda 152. kodondaki mutasyon daha önceki literatürlerde bildirilmişken, iki mutasyon ve bir delesyon daha önceden bildirilmemiştir.
Özet (Çeviri)
SUMMARY Tuberculosis still remains one of the leading causes of morbidity and mortality worldwide. Controlling tuberculosis becomes more difficult because of the drug-resistant Mycobacterium tuberculosis. Pyrazinamide has become one of the first-line drugs for the treatment of tuberculosis. Mycobacterium tuberculosis converts pyrazinamide to its active form by using the enzyme pyrazinamidase. This enzyme is coded for on the pncA gene, and mutations in the pncA gene result in absence of active enzyme, conferring resistance to the drug pyrazinamide. In the present study, the strains were identified as M. tuberculosis complex by cord factor, NAP test and PCR-RFLP. Then, pyrazinamide susceptibility was studied by BACTEC methodology and pyrazinamidase test. The mutations of pncA gene have been detected with DNA sequencing. Our aim was to identify the mutation of pncA gene in pyrazinamide resistant isolates detected by the classical susceptibility tests and to compare our results with the mutations in literature reported before. In two PZA susceptible and in three of 10 pyrazinamide resistant strains, no mutations were determined. Two of the pyrazinamide resistant strains had mutations in the same region (GGC 71 GAC). Two of the pyrazinamide resistant strains had different mutations (ACA 479 AAA), (CAC 152 CCC). Three of the pyrazinamide resistant strains had deletion in the same region (CTG-AAT (102-269)). As a result, mutation in 152. codon was reported in previous studies; two new mutations and a deletion were determined responsible for pyrazinamide resistance in our study.
Benzer Tezler
- Çukurova bölgesindeki pulmoner tüberkülozlu hastaların balgam örneklerinden izole edilen mycobacterium tuberculosis suşlarında pirazinamid direncinin moleküler mekanizmalarının araştırılması
Molecular mechanisms of pyrazinamide resistance among strains of mycobacterium tuberculosis clinical isolates in Cukurova region
AISIKAER TUERXUN
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
BiyoteknolojiÇukurova ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATİH KÖKSAL
- Mycobacterium tuberculosis klinik izolatlarında ilaç direncinin multipleks 'Real-Time PCR' yöntemiyle saptanması
Detection of drug resistance in mycobacterium tuberculosis clinical isolates by multiplex Real-Time PCR
FATMA NUR AKDOĞAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
MikrobiyolojiHacettepe ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ZEYNEP SARIBAŞ
- Primer izoniazid dirençli tüberküloz olgularında uygulanan tedavi rejimleri vetedavi sonuçları arasındaki ilişki
Primary isoniazide resistant tuberculosis treatment regims applied to the case andrelationship between treatment results
İSMAİL ERİKCİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
Göğüs HastalıklarıSağlık Bilimleri ÜniversitesiGöğüs Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SERİR ÖZKAN
- Primer anti-tüberküloz ilaçlara dirençli ve duyarlı mycobacterium tuberculosis izolatlarında Pirazinamid direnci ile ilişkili PNCA, RPSA ve PAND gen mutasyonlarının araştırılması
Investigation of PNCA, RPSA and PAND Gene mutations associated with pyrazinamide resistance in primary anti-tuberculosis drug resistant and susceptible mycobacterium tuberculosis isolates
DİDEM ÖZGÜR
Doktora
Türkçe
2019
MikrobiyolojiMersin ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÖNÜL ASLAN
- Mycobacterium tuberculosis complex suşlarında pirazinamid direncinin genetik mekanizması ve bedakulin direnci arasındaki ilişkinin moleküler yöntemlerle sorgulanması
Investigation of the relationship between the genetic mechanism of pyrazinamide resistance and bedaquiline resistance in Mycobacterium tuberculosis complex strains by molecular methods
HAMDİ GÖKAHMETOĞLU
Doktora
Türkçe
2024
BiyoteknolojiÇukurova ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. IŞIL VAR ÖNGEL