Protein engineering applicaitons on NAD+-dependent L-lactate dehydrogenase from Bacillus stearothermophilus
Bacillus stearothermophilus'tan izole edilen NAD+ bağımlı L-LDH enzimine protein mühendisliğinin uygulamaları
- Tez No: 166394
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. NEVİN GÜL KARAGÜLER
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2005
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İstanbul Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Genetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 108
Özet
ÖZET BACILLUS STEAROTHERMOPHİLUS'TAN İZOLE EDİLEN NAD+ BAĞIMLI L- LDH ENZİMİNE PROTEİN MÜHENDİSLİĞİNİN UYGULAMALARI Bacillus stearothermophilus' tan izole edilen NAD+ bağımlı L - LDH enzimi saf kiral hidroksi bileşiklerin üretilmesindeki endüstriyel potansiyelinden dolayı katalitik ve yapısal özellikleri açısından yoğun bir şekilde araştırılmaktadır. Kiral alfa hidroksi asitlerin şimdiki endüstrideki üretimi 10 ton olup, 0.1 M dan daha fazla miktarda substrat (piruvat) kullanımım sağlayabilecek herhangi bir gelişme endüstriyel açıdan oldukça karlı olacaktır. Pirüvatın laktata dönüşümündeki reaksiyon, oxo-asit substratın, karbonil grubunun koenzim olarak kullanılan NADH' ten alınan hidrojen iyonu ile indirgenmesi şeklinde gerçekleşir. LDH'lerin dezavantajları substrat olarak kullanılan pirüvatın aşırı konsantrasyonunda inhibe olması ve geniş bir substrat spesifikliğinin olmayışıdır. LDH'ın endüstriyel kullanımım kısıtlayan bu dezavantaj larının uzaklaştırılmasında protein mühendisliği umut verici bir uygulamadır. Proje süresince, istenilen özelliklerdeki LDH'i üretmek için bölgeye özel mutasyon ve DNA suffling olmak üzere 2 farklı strateji uygulandı. xıv
Özet (Çeviri)
SUMMARY PROTEIN ENGINEERING APPLICATIONS ON NAD+-DEPENDENT L-LACTATE DEHYDROGENASE FROM BACILLUS STEAROTHERMOPHİLUS The NAD+-dependent lactate dehydrogenase (LDH) enzyme from Bacillus stearothermophilus has been the subject of intensive research of its structure and catalytic properties. This has been prompted by its industrial potential in the production of chirally pure hydroxy! compounds. The production of chiral (S) a-hydroxyacids is now at the 10-ton scale in industry and any development facilitating the reduction of pyruvate at concentrations greater than 0.1 M would be profitable. The reaction in the pyruvate to lactate direction is achieved by reducing a carbonyl group of the oxo-acid substrate with a hydride ion donated by NADH (used as a coenzyme) and a proton from the protein. The disadvantages of LDHs are their inhibition of by excess substrate (pyruvate) and also not having very broad substrate specificity. In order to make LDH more suitable enzyme for its industrial applications, protein engineering is a promising approach. Two routes are used in this project to produce LDH enzyme with the desired properties. These are site directed mutagenesis and DNA shuffling. xv
Benzer Tezler
- Development of novel biocatalysts for industrial applications
Endüstriyel uygulamalar için yeni biyokatalizörlerin geliştirilmesi
BARIŞ BİNAY
Doktora
İngilizce
2012
Biyomühendislikİstanbul Teknik Üniversitesiİleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NEVİN GÜL KARAGÜLER
PROF. NICHOLAS JAMES TURNER
- Gossypium hirsutum format dehidrogenaz enzimi üzerine bölge doygunluk mutasyonu uygulamaları
Site saturation mutagenesis applications on Gossypium hirsutum formate dehydrogenase enzyme
KÜBRA ATİK
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
BiyolojiYıldız Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ EMEL ORDU
- Enzim izalasyonu ve katalitik etkisinin incelenmesi
Isolation and characterization of notive lipase
NURSEL ÇERÇİOĞLU
- Protein engineering applications on candida methylica formate dehydrogenase to elucidate folding mechanisms and to increase the thermostability
Protein mühendisliği ile candida methylica format dehidrogenaz enziminin katlanma mekanizmasının aydınlatılması ve termostabilitesinin arttırılması
EMEL ORDU
Doktora
İngilizce
2010
Biyokimyaİstanbul Teknik Üniversitesiİleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. NEVİN GÜL KARAGÜLER
- Protein engineering applications on industrially important enzymes
Endüstriyel öneme sahip enzimlerin protein mühendisliği uygulamaları
GÜLŞAH ÖZGÜN
Doktora
İngilizce
2019
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NEVİN GÜL KARAGÜLER