Geri Dön

Elucidation of R gene mediated yellow rust disaesa resistance mechanism in wheat by dual bait yeast two-hybrid analysis

Buğdayda R geni ile kontrol edilen sarı pas hastalığı dirençlilik mekanizmasının maya ikili hibrid yöntemi ile aydınlatılması

  1. Tez No: 167390
  2. Yazar: FİGEN YILDIRIM
  3. Danışmanlar: PROF. DR. GÜLAY ÖZCENGİZ, PROF. DR. GÜLAY ÖZCENGİZ
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Maya ikili hybrid analizi, YrlO, Rad6, hastalık direçliliği, buğdayda sarı pas. vıı, Yeast two-hybrid analysis, YrlO, Rad6, disease resistance, wheat yellow rust
  7. Yıl: 2005
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 297

Özet

oz BUĞDAYDA R GENİ İLE KONTROL EDİLEN SARI PAS HASTALIĞI DİRENÇLİLİK MEKANİZMASININ MAYA İKİLİ HİBRİD YÖNTEMİ İLE AYDINLATILMASI Yıldırım, Figen Doktora, Biyoteknoloji Bölümü Bölümü Tez Yöneticisi : Prof. Dr. Mahinur S. Akkaya Ortak Tez Yöneticisi: Prof. Dr. Gülay Özcengiz Ağustos 2005, 272 sayfa Puccinia striiformis Westend. f. sp. tritici Eriksson tarafından oluşturulan sarı pas, buğdayın en ölümcül yaprak hastalıklarından biridir. Bu çalışmanın amacı buğdayda pas enfeksiyonuna karşı oluşan dirençlilik alt sinyal mekanizmasının aydınlatılması, böylece dirençlilik mekanizmasında rol alan genlerin anlaşılmasıdır. Çalışmada kullanılan, maya ikili-hibrid analizi hücre içinde protein-protein etkileşimlerini saptamak için en kuvvetli yöntemlerden biridir. Çalışmada yem olarak kullanılan proteinler; i) YrlO sarı pas dirençlilik geninin parçaları, ii) R geni ile kontrol edilen sinyal mekanizmasında kritik rolü olduğu düşünülen Rad6 geni, iii) vıprogramlanmış hücre ölümü ile ilişkili aktivitesi bulunan WD40 tekrarı içeren proteinler ile homoloji gösteren ve henüz fonksiyonu bilinmeyen WR5 gen parçasıdır. Bu yem proteinleri kullanılarak maya av kütüphanesinin taranması sonucunda; programlı hücre ölümü ile ilişkili fonksiyonları bulunan proteinler (SRP72, PORİ, CSE1), stres koşullarında translasyon başlangıcını kontrol eden proteinler (Gcn2p, Eaplp), fosforilasyon (SKY1) ve defosforilasyon (GAC1) aktivitesi gösteren proteinler, hücre döngüsü kontrolü ile ilişkili protein (FARI), oksidatif stres kontrolü ile ilişkili protein (OXR1), protein parçalanmasını kontrol eden protein (TOMİ), protein katlanması ile ilgili protein (CPR7) ve hücrede iyon dengesi kontrolü ile ilişkili proteinler (PORİ, GAC1) saptanmıştır. Yapılan çalışmanın önemi i) buğday R geni ile yapılan ilk maya ikili hybrid analizi olması, ii) tahmin edilen fonksiyonlarda etkileşimlerin saptanması, iii) en önemlisi anahtar etkileşimlerin detaylı olarak incelenmesi için yeni çalışmalara olanak sağlaması, olarak özetlenebilir.

Özet (Çeviri)

ABSTRACT ELUCIDATION OF R GENE MEDIATED YELLOW RUST DISEASE RESISTANCE MECHANISM IN WHEAT BY DUAL BAIT YEAST TWO-HYBRID ANALYSIS Yıldırım, Figen Ph. D., Department of Biotechnology Supervisor : Prof. Dr.Mahinur S. Akkaya Co-Supervisor: Prof. Dr. Gülay Özcengiz August 2005, 272 pages Yellow rust, caused by Puccinia striiformis Westend. f. sp. tritici Eriksson is one of the most severe leaf diseases of wheat. Aim of this study is to illuminate the downstream signaling pathways upon incompetible infection of rust pathogen in wheat, thus to understand the genes involved in resistance mechanism. The strategy used is the dual bait yeast two-hybrid analysis which is the most powerful method for in vivo detection of protein-protein interactions. The bait proteins used are; the domains of YrlO yellow rust resistance gene, Rad6 gene which is considered to have a critical role in R gene mediated signaling pathway, and WR5 gene fragment which is an unknown IVprotein having homology to the WD40 repeat containing protein with apoptosis related activity Screening of a yeast prey library with these baits revealed proteins having mostly apoptosis related functions (SRP72, POR1, CSE1), translation initiation control in response to stress conditions (Gcn2p, Eaplp), phosphorylation (SKY1) and dephosphorylation activities (GAC1), cell cycle control (FARI), oxidative stress control (OXR1), protein degradation control (TOM1), protein folding control (CPR7) and ion homeostasis in the cell (POR1, GAC1). The significance of the study can be summarized as i) being the first yeast two hybrid analysis of a wheat R gene, ii) being able to detect interacting partners with anticipated functions, iii) most importantly, initiating further detailed analysis of the key interactors.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    313723

    Elucidation of the role of GCN2 gene in response to powdery mildew infection

    Arpada küf hastalığına karşı GCN2 gen rolünün açıklanması

    İBRAHİM KUTAY ÖZTÜRK

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2012

    BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MAHİNUR S. AKKAYA

    YRD. DOÇ. DR. FİGEN ERSOY

  2. Tez No

    612123

    Atlarda rhodococcus equi' nin tespiti ve genotiplendirilmesi

    Detection and genotyping of rhodococcus equi in horses

    ZEYNEP YERLİKAYA

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    MikrobiyolojiFırat Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ADİLE MUZ

  3. Tez No

    359615

    Mir-96 ifadesinin otofaji üzerinde etkisinin meme kanseri hücre hatlarında araştırılması

    Investigation of the effect of mir-96 expression on autophagy in breast cancer cell lines

    SEVİL KIRKBEŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Tıbbi BiyolojiGaziantep Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. MUSTAFA ULAŞLI

  4. Tez No

    520474

    Tricholoma caligatum (Viv.) Ricken ve T. fracticum (Britzelm.) Kreisel türlerinden biyoaktivite gösteren sekonder metabolitlerin izolasyonu ve yapılarının aydınlatılması

    Isolation and structure elucidation of bioactive secondary metabolites from Tricholoma caligatum (Viv.) Ricken and Tricholoma fracticum (Britzelm.) Kreisel

    EBRU EROL

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Eczacılık ve FarmakolojiMuğla Sıtkı Koçman Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MEHMET ÖZTÜRK

  5. Tez No

    485040

    Rhodobacter sphaeroides'e özgü indüklenebilir özellikte bir ekspresyon vektörünün geliştirilmesi ve yeşil floresan protein geninin ifade edilmesi

    Construction of a new inducible expression vector for Rhodobacter sphaeroides and expression of the green flourescent protein gene

    VAHİDE COŞKUN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    BiyoteknolojiSelçuk Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HASAN HÜSEYİN DOĞAN

Geri Dön