Beyincik purkinje nöronlarında bulunan sodyum kanal akımları için geliştirilen bir markov modeli
A markow model developed for sodium channel currents in cerebellar purkinje neurons
- Tez No: 171020
- Danışmanlar: Y.DOÇ.DR. TEMEL KAYIKÇIOĞLU
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Elektrik ve Elektronik Mühendisliği, Electrical and Electronics Engineering
- Anahtar Kelimeler: Purkinje Hücresi, Sodyum Kanalı, Markov Model, Bölmeli Modelleme V, Purkinje Cell, Sodium Cannel, Markov Model, Compartmental Modeling VI
- Yıl: 2005
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Karadeniz Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Elektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 132
Özet
ÖZET Beynin yapısı ve fonksiyonu anlamaya yönelik teorik ve deneysel yaklaşımlar pek çok araştırma alanlarında incelenmektedir. Hesapsal nöroloji bu alanlardan biri olup modelleme ve deneysel veriyi birleştirmektedir. Bu araştırma alanının bazı hedefleri ise, modelleme sonuçlarını deneysel veri ile karşılaştırmak, yeni kestirimler yapmak ve bunları doğrulamaktır. Bu tezde, izole edilmiş beyincik Purkinje nöronlarında bulunan sodyum kanal akımlarının kapı kinetiği için bir Markov modeli geliştirilmiştir. Model makroskobik akımlar olarak bilinin voltaj kenetlemeyle, yeniden dirilen ve aksiyon potansiyel uyarısından elde edilen üç akıma dayalıdır. Bu model daha önce gerçekleştirilen modellerden farklıdır. Bu modelde durum sayılarında ve durum geçiş değerlerinde değişiklikler yapılmıştır. Model parametreleri, model tepkisi ve üç akım tepkisi arasındaki fark en küçüklenecek şekilde deneme yanılma yöntemi kullanılarak belirlenmiştir. Geliştirilen sodyum kanal modeli deneysel veri setlerinin tüm nicel özelliklerini önemsiz farklılıklarla göstermiştir. Model, soma ve dendritten oluşan iki bölmeli bir Purkinje hücre modelinde kullanıldı. Bu hücre modeli diğer mevcut iyonik akımları içermiştir. Hücre modeli değişen alam basamakları ile benzerimi yapılmıştır. Sonuçlar, geliştirilen hücre modelinin deneysel çalışmalardan elde edilen Purkinje hücre aktivitelerinin çoğu özelliklerini ürettiğini göstermiştir.
Özet (Çeviri)
SUMMARY A Markov Model Developed for Sodium Channel Currents in Cerebellar Purkntje Neurons Theoretical and experimental approaches toward the understanding brain structure and function are being investigated in many research areas. One of these areas is computational neuroscience which combines modeling and experimental data. Some goals of this research area are to compare results of modeling with experimental data, to make new predictions and check them. In this dissertation, a Markov model for gating kinetics of sodium channel currents in dissociated cerebellar Purkinje neurons is developed. The model is based on voltage- clamped, resurgent and action potential evoked currents, known as macroscopic currents. It is different from previously developed models. In this model, some modifications are made in the number of states and channel rate constants. The model parameters are determined using trial and error procedure to minimizing the error between model responses and three experimental data sets. The developed sodium channel model reproduces quantitatively all features of the experimental data sets, with minor discrepancies. It was used in a Purkinje cell model which is based on two compartments, soma and dendrite. This cell model also included other existing ionic currents. It was simulated with varying currents step. Results show that the developed cell model produces most features of Purkinje cell activities obtained from the experimental studies.
Benzer Tezler
- 900 MHz elektromanyetik alana maruz bırakılan ratlarda karnozinin beyincikteki hücre sayısı üzerine etkisi
Carnosine effects to the number of purkinje cells in cerebellum following exposure to 900 MHz electromagnetic field
AYLA ARSLAN
- Kronik cep telefonu radyasyonu ve koruma amaçlı kullanılan melatonin'in beyin ve beyincik üzerine etkilerinin farklı inceleme yöntemleri kullanılarak araştırılması
Investigation the effects of chronic mobile phone radiation and melatonin used for protection purpose on the brain by using different methods
CEMİLE MERVE SEYMEN
Doktora
Türkçe
2015
Histoloji ve EmbriyolojiGazi ÜniversitesiHistoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. CELAL ILGAZ
- Farelerde deneysel Streptococcus pneumoniae enfeksiyonunda patolojik bulgular ve patogenezin araştırılması
Pathological findings and pathogenesis in experimental Streptococcus pneumoniae infection in mice
OZAN AHLAT
- Beyincik purkinje hücresinin pasif parametrelerinin aksiyon potansiyelinin ateşleme değerine etkilerinin incelenmesi
Researching passive parameters of cerebellum purkinje cell effect on bursting value of action potential
YUSUF SEVİM
Yüksek Lisans
Türkçe
2003
Elektrik ve Elektronik MühendisliğiKaradeniz Teknik ÜniversitesiElektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. AYTEN ATASOY
- Cep telefonlarının fötal ve postnatal dönemde fare beyincik purkinje hücre sayısı üzerine etkisi: Stereolojik bir çalışma
The effect of mobile phones on purkinje cells number of mouse cerebellum at the fetal and postnatal period: A stereological study
SERDAR ÖZDEMİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2005
MorfolojiYüzüncü Yıl ÜniversitesiTıbbi Histoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MURAT ÇETİN RAĞBETLİ