Batı Akdeniz bölgesinde domates bakteriyel benek hastalığına sebep olan Pseudomonas syringae pv.Tomato izolatlarının elde edilmesi, PCR ile tanıları ve plazmid profillerinin belirlenmesi
Obtaining, identification by PCR and determination of plasmid pforiles of Pseudomonas syringae pv.Tomato isolates, causal agent of tomato bacterial speck disease in western mediterranean region
- Tez No: 172415
- Danışmanlar: PROF.DR. HÜSEYİN BASIM
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2006
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Akdeniz Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 66
Özet
ÖZET BATI AKDENİZ BÖLGESİNDE DOMATES BAKTERIYEL BENEK HASTALIĞINA SEBEP OLAN Pseudomonas syringae pv. tomato İZOLATLARININ ELDE EDİLMESİ, PCR İLE TANILARI VE PLAZMİD PROFİLLERİNİN BELİRLENMESİ DURMUŞ DENİZ Yüksek Lisans Tezi, Bitki Koruma Anabilim Dalı Danışman: Prof. Dr. Hüseyin BASIM Mayıs 2006, 57 sayfa Batı Akdeniz Bölgesi'nde domates bitkisinde ciddi ekonomik kayıplara yol açan ve domates bakteriyel benek hastalığına sebep olan Pseudomonas syringae pv. tomato' nun izolatları elde edilmiş, PCR yöntemiyle kesin tanıları yapılmış, izolalların bakıra dayanıklılıkları test edilmiş ve plazmid profilleri saptanmış olup bu profillerle bakıra dayanıklılık arasındaki ilişkiler ortaya konmuştur. Batı Akdeniz Bölgesinde domates yetiştiriciliği bakımından önemli bir potansiyele sahip olan Antalya ili ve çevresine (Aksu, Serik, Alanya, Kumluca ve Hasyurt'ta) yapılan sörveylerle bakteriyel benek hastalığı simptomları gösteren domates bitki materyalleri toplanmıştır. Bakterilerin izolasyonlarında King's B besi ortamı kullanılmış ve 27 C de 3-5 gün inkübasyona bırakılarak bakteriyel koloniler elde edilmiştir. Hastalık etmeni bakterilerin tanısı, Nutrient Sakkaroz Agar (NSA) ortamında levan oluşumu, oksidaz testi, patates testi, arginini dihidrolaz testi ve tütünde hypersensitif reaksiyon testini içeren LOPAT testleri yapılarak belirlenmiştir. Biyokimyasal testlerle tanısı yapılan hastalık etmenlerinin patojenisite testleri, sağlıklı domates bitkileri kullanılarak yapılmıştır. Pseudomonas syringae pv. tomato izolatlarının kesin tanıları P i ve P II primerleri, kullanılarak Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) yöntemiyle tespit edilmiştir.Pseudomonas syringae pv. tomato izolatlarının bakıra dayanıklılıkları 0, 5, 10, 1 5. 20. 25. 30, 35. 40. 45, 50. 55, 60. 65. 70, 75, 100, 125, 150, 175, 200 ve 225 ug/ml dozlarında bakır sülfat ve bakıroksiklorür içeren CYE, MGY, NA kültür besi ortamlarında saptanmıştır. Pseudomonas syringae pv. tomato izolatlarının plazmid profilleri; izole edilen plazmidlerin elektroforezde yürütülmesi ve U.V. ışıkla görüntülenmesiyle elde edilmiştir. Saptanan profiller, izolatların bakıra dayanıklılıklarıyla ilişkilendirilmiştir. ANAHTAR KELİMELER: Domates, Domates Bakteriyel Benek Hastalığı, Pseudomonas syringae pv. tomato, Bakır Dayanıklılığı, Plazmid Profili, PCR JÜRİ Prof. Dr. Hüseyin BASIM ( Danışman ).....çfc«S-*«-~v.| Prof. Dr. Oktay YEĞEN?APl','ff^T Prof. Dr Hatice ÖZAKTANi
Özet (Çeviri)
ABSTRACT OBTAINING, IDENTIFICATION by PCR and DETERMINATION of PLASMID PFORILES of Pseudomonas syringae pv. tomato ISOLATES, CAUSAL AGENT OF TOMATO BACTERIAL SPECK DISEASE IN WESTERN MEDITERRANEAN REGION DURMUŞ DENİZ M.Sc. in Plant Protection May 2006, 57 Pages Adviser: Prof. Hüseyin BASIM Pseudomonas syringae pv. tomato isolates, causal agents of tomato bacterial speck disease causing serious economical yield losses on tomato, an important agricultural product in Western Mediterranean Region were obtained and the certain identification of the isolates was done by PCR. Copper resistance of the isolates was tested and the interaction between copper resistance and plasmid profiles was determined. Tomato plant materials showing pith necrosis symptoms were collected by surveying to Antalya province and surrounding counties (Aksu, Serik, Alanya, Kumluca and Hasyurt) having an important potential in terms of tomato production in Western Mediterrenean Region. King's B culture medium was used for the isolation of the bacterial isolates from the infected plant materials, and the bacterial colonies were obtained by incubating at 27 C for 3-4 days. The identification of the bacteria was done by performing LOPA T tests including levan occurrence on NSA medium, oxidase test, potato test, arginine dihydrolase test and hypersensitive reaction test on tobacco plant. Pathogenicity tests were done by using healthy tomato plants.Polymerase Chain Reaction (PCR) method using primers. P I and P II done lor certain identification of Pseudomonas syringae pv. tomato isolates. Resistance to copper of Pseudomonas syringae pv. tomato isolates was obtained from different culture media that contain various concentrations (0. 5, 10, 15, 20, 25. 30, 35, 40. 45, 50, 55, 60, 65. 70. 75, 100. 125. 150. 175, 200 and 225 ug/ml ) of two different copper formulations. Plasmid profiles of the isolates were determined b> standart gel electrophoresis of isolated plasmids. I he i teraction between plasmid profile and copper resistance was determined. KE\ WORDS: Tomato. Toman Bacterial Speck Disease, Pseudomonas syringae pv. tomato (upper Resistance, Plasmid Profile. PCR COMMITTEE: Prof. Dr. Hüseyin BASIM ( Adviser ). 5^fb-> p^^y^ 1 _ Prof Dr. Oktay YE?EN,.^^...../rtü \ Prof Dr Hatice UZAKTAN ::^ySp.:
Benzer Tezler
- Batı Akdeniz bölgesinde domates bakteriyel öz nekrozu hastalığında sebep olan Pseudomonas corrugata ve Pseudomanos mediterranea izolatlarının elde edilmesi, multiplex-PCR ve real time PCR (RT-PCR) ile hızlı tanıları
Obtaining and rapid identification of Pseudomonas corrugate and Pseudomonas mediterranea isolates, causal agents of tomato pith necrosis disease in western mediterranean region by multiplex-PCR and real-time PRC
SAFİNAZ YILMAZ
- Batı Akdeniz bölgesi Tuta absoluta (Lepidoptera:Gelechiidae) popülasyonlarında endosimbiyont bakteri türlerinin belirlenmesi
Determination of endosymbiont bacteria species of Tuta absoluta (Lepidoptera:Gelechidae) populations from the West Mediterranean region
MERVE KAVAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
ZiraatIsparta Uygulamalı Bilimler ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ERHAN KOÇAK
- Domates güvesi Tuta absoluta (Meyrick) (Lepidoptera: Gelechiidae)'nın Batı Akdeniz bölgesi domates üretim alanlarında yayılışının ve populasyon dalgalanmasının saptanması
Determination of distribution and population fluctuation of tomato leaf miner Tuta absoluta (Meyrick) (Lepidoptera: Gelechiidae) tomato production areas of the Western Mediterranean region
EMRAH TATLI
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
ZiraatAkdeniz ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HÜSEYİN GÖÇMEN
- Batı Akdeniz bölgesi domates üretim alanlarında domates kloroz virüsü (Tomato Chlorosis Virus; ToCV)'nün biyolojik ve moleküler karakterizasyonu
Molecular chracterization and biological of tomato chlorosis virus (ToCV) in tomato production areas in Western Mediterranean region
NEVİN AKDURA
Doktora
Türkçe
2011
ZiraatSüleyman Demirel ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BAYRAM ÇEVİK
- Madra Dağı ve çevresinin vejetasyon coğrafyası
Vegetation geography of the Madra Mountainand its surroundings
SEMRA SÜTGİBİ