Geri Dön

Gene expression profiling of hedgehog pathway genes in epithelial cancers

Epitel kanserlerde hedgehog yolağı genlerinin gen ifade profili

PDF İndir

  1. Tez No: 180645
  2. Yazar: ÖZLEM AKILLI ÖZTÜRK
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. IŞIK YULUĞ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2006
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi
  10. Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 147

Özet

Hedgehog (Hh) sinyal yolu birçok kanser tipinde incelenmiş ve önemli etkileri olduğugösterilmiştir ama meme, kolon ve karaciğer kanserlerinde kapsamlı olarakçalışılmamıştır. Bu çalışmada BCL2, SHH, SMO, IHH, PTCH1, GLI1, GLI2 ve GLI3 genifadesi profili 15 meme, 14 kolon ve 15 hepatoselüler karsinom (HSK) hücre hattında, 29primer meme tümörü örneğinde ve 3 eşleştirilmiş normal doku örneği havuzunda nicelgerçek zamanlı RT-PCR ile analiz edilmiştir. Meme hücresi hatlarının Hh yolundakihedef gen ifadesi düzeyi farklıdır ve bu yol sadece bazı meme karsinomu hücre hatlarındamuhtemelen liganddan bağımsız bir yolla aktive edilir. Çalışılan tüm meme kanserihatlarında PTCH1, SMO, GLI3 ve BCL2 ifadesi yüksek bulunmuştur. Hedef genlerinifade profilleri çalışılan meme hücresi hatlarının %93'ünde estrojen reseptörü durumunudoğru tahmin etmiştir. HSK hücre hatlarında Hh yolu gen ifadesi profili iyifarklılaşmamış HSK hücre hatlarını iyi farklılaşmış olanlardan Ayırdedici FonksiyonAnalizi (DFA) kullanıldığında kusursuz olarak ayırmıştır. Yüksek SMO ve IHHifadelerinin iyi farklılaşmış HSK hücre hatlarında normal dışı Hh yolu aktivitesi içinbelirteçler olduğu bulunmuştur. Kolon kanseri hücre hatlarında bazı genler içindüzenlemesi bozulmuş ifade profili gözlenmiştir. Primer meme tümörü örneklerindeörneklerin ER durumunun öngörülmesi ile bu çalışmaya dahil edilen genlerin ifadesiarasında çok kuvvetli bir ilişki bulunmuştur.Bu çalışma kanser hücre hatları ve meme kanseri doku örneklerinde Hh yolunun anahedef genlerinin transkripsiyonel gen ifadesi profillerini gösteren ilk kapsamlı çalışmadır.

Özet (Çeviri)

The Hedgehog (Hh) pathway has been investigated in many cancer types and shown tohave important effects, but not effectively studied in breast, colon and liver cancers. Inthis study, gene expression profile of Hh pathway was analyzed in breast, colon, andhepatocellular carcinoma (HCC) cell lines and primary breast tumor samples byquantitative real-time RT-PCR. Breast cell lines have different levels of target geneexpression in the Hh pathway, such that this pathway is activated only in some of the celllines possibly through a ligand-independent pathway. In the breast cancer cell lines,PTCH1, SMO, GLI3 and BCl2 had high expression. Expression profiles predictedestrogen receptor status correctly in 93% of the cell lines. Hh pathway gene expressionprofile differentiates poorly differentiated HCC cell lines from well differentiated ones inDiscriminant Function Analysis (DFA) perfectly. High SMO and IHH expressions havebeen found to be markers for aberrant Hh pathway activity in the well differentiated HCCcell lines. In colon cancer cell lines deregulated expression profile among the genes wereobserved. In primary breast tumor samples, there was a very strong prediction for ERstatus of the samples. This is the first comprehensive study that shows the geneexpression profiles of the main target genes of the Hh pathway in cancer cell lines andbreast cancer tissue samples.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    641884

    Glioblastoma multiforme ve glioblastoma multiforme kanser kök hücreleri ile astrosit ko-kültürlerinde, siklopamin inhibisyonu ile sonıc hedgehog sinyal yolağı ve ilişkili mekanizmalarda karşılıklı bağlantıların moleküler yöntemlerle araştırılması

    Investigation of sonic hedgehog signaling pathway with cylopamin inhibition and relationship between related mechanisms with molecular methods on glioblastoma multiforme and glioblastoma multiforme cancer stem cells and astrocyte co-cultures

    DUYGU KOCATÜRK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Histoloji ve EmbriyolojiEge Üniversitesi

    Histoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYŞEGÜL UYSAL

  2. Tez No

    695269

    Differentiation of thyroid cells to parathyroid cells in coculture environment

    Kokültür ortamında tiroid hücrelerinin paratiroid hücrelerine dönüştürülmesi

    GÜLÇİN DELAL NOZHATZADEH

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2021

    BiyolojiYeditepe Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GAMZE TORUN KÖSE

  3. Tez No

    779247

    Foliküler lenfomalarda sirtuin gen ifade profili

    Gene expression profiling of sirtuins in follicular lymphoma

    LALEH MADAYEN SHISHEVAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    BiyoteknolojiAnkara Üniversitesi

    Temel Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜLŞAH KAYGUSUZ

  4. Tez No

    895758

    MiRNA expression profiling of ovine mammary epithelial cells using RNA-seq technology with staphylococcus aureus-induced mastitis

    Staphylococcus aureus kaynakli mastitisin mirna ekspresyon profilinin koyun meme epitel hücrelerinde RNA-seq teknolojisi kullanilarak araştirilmasi

    GHULAM ASGHAR SAJID

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    ZiraatErciyes Üniversitesi

    Zootekni Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET ULAŞ ÇINAR

  5. Tez No

    658073

    In vitro fertilizasyon sonrası tekrarlayan implantasyon başarısızlığı ile ilişkili endometriyal gen anlatımı analizi

    Endometrial gene expression profiling of recurrent implantation failure after in vitro fertilization

    İREM GÜLFEM ALBAYRAK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Genetikİstanbul Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. TUBA GÜNEL

Geri Dön