Hücre duvarı protein profillleri ve pilazmid içeriklerine göre laktik asit bakterilerinin moleküler tanısı
Molecular identification of lactic acid bacteria based on their cell wall protein profiles and plasmid contents
- Tez No: 180739
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ÖZLEM OSMANAĞAOĞLU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Biology, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: LAB, identifikasyon, hücre duvarı proteinleri, pilazmid DNA, LAB, identification, cell wall proteins, plasmid DNA
- Yıl: 2006
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 142
Özet
Hazır gıdalardan izole edilen ve çeşitli kültür koleksiyonlarından temin edilen 88 adet farklı Laktik AsitBakterisinin (LAB) jel elektroforezi ile pilazmid DNA'larının analizi ve Sodyum dodesil sülfat poliakrilamid jelelektroforezi ile (SDS-PAGE) hücre duvarı protein profillerinin analizi; gerçekleştirmiş olduğumuz fizyolojik,biyokimyasal/metabolik ve morfolojik testler üzerine kurulmuş olan geleneksel fenotipik tanımlamayöntemlerini desteklemek ve bu bakterileri tanımlamak amacı ile yapılmıştır.Farklı türlerin hatta aynı tür içindeki suşların değişen ve tipik olan protein bant patternleri sunmasından dolayı,hücre duvarı proteinleri ile tanımlama tür, bazen de suşa spesifik patternlerin tespiti ile mümkündür. Bu yöntemstandartı gerçekleştirilmiş koşullarda; tür ve alttür seviyesinde taksonomik ayrımda iyi sonuçlar vermesindendolayı tüm suşların tiplendirilmesinde ve protein patternlerinin oluşturulmasında dikkate alınabilir. Bu bağlamdahücre duvarı proteinlerinin SDS-PAGE'i birçok tür içeren fazla sayıda Laktik Asit Bakteri izolatlarınıntanımlanmasında kolay, oldukça hızlı ve güvenilir bulunmaktadır.Benzerliklerine bakıldığında pilazmid DNA'nın jel elektroforez bant patternleri; cins ve bazı durumlarda türbazında ayrım için kullanılmıştır. Laktik Asit Bakterilerinde pilazmid DNA profilleri değişkendir ve her cins içinkarakteristlik bantlar gözlenmiştir.2006, 130 sayfa
Özet (Çeviri)
In order to complete and support our performed conventional phenotypic identification based on physiological, biochemical/ metabolic and morphological tests, analysis of cell wall protein profiles by sodium dodecyl sulphatepolyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) and analysis of plasmid DNAs profiles by gel electrophoresisof 88 lactic acid bacteria (LAB) strains, both isolated from several different ready-to-eat foods and differentculture collections, were carried out.Since different species presented varying and typical protein patterns; even among strains belonging to the samespecies, it is possible to identify different cell-wall protein profiles showing species- or sometimes strain-specificpatterns. Using highly standardized conditions the technique seems to have a good level of taxonomic resolutionat species or subspecies level and it seems to possible to generate fingerprints that allow typing of all strainsconsidered. In this sense, SDS-PAGE of cell wall proteins was found to be easy, fairly fast, and reliable way foridentification of large number of LAB isolates belonging to many species.Based on their similarities, agarose gel electrophoresis patterns of plasmid DNAs have been used to distinguishbetween genera and in some cases between species. The profiles of plasmid DNAs in LAB were diverse andcharacteristic patterns in each genus were observed.2006, 130 pages
Benzer Tezler
- Hücre duvarı protein profilleri ve plazmid içerikleri esas alınarak Lactococcus lactis suşlarının tanımlanması
Identification of Lactococcus lactis strains based on their cell wall protein profiles and plasmid contents
MEHTAP ÜSTÜN
- Lactococcus lactis subsp. lactis MPL56 suşunda faj-almaç bölgeyi maskeleyen plazmid kodlu materyalin tanısı
Identification of plasmid encoded material, masking phage-receptor site in lactococcus lactis subsp. lactis MPL56
YASİN TUNCER
Yüksek Lisans
Türkçe
2000
Gıda MühendisliğiAnkara ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUSTAFA AKÇELİK
- Improvement of Bacilysin biosynthesis in Bacillus subtilisPY79 VIA CRISPR/CAS9 technology
Bacillus subtilis PY79 suşunda basilisin biyosentezinin CRISPR/CAS9 teknolojisi ile iyileştirilmesi
HADEEL WALEED ABDULMALEK
Doktora
İngilizce
2023
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYTEN KARATAŞ
- Bor ve 24-epibrassinolid uygulamalarının Arabidopsis thaliana (L.) Heynh'da hücre çeperi ile ilgili bazı genlerin ekspresyon seviyeleri üzerine etkileri
The effects of boron and 24- epibrassinolid treatments on expression levels of some genes related to cell wall in Arabidopsis thaliana (L.) Heynh
RABİA İŞKİL
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
BiyolojiBartın ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. YONCA SURGUN ACAR
- Mesane tümörünü tedavi edici etkiden sorumlu mikobakteri hücre duvarı bileşenlerinin HPLC ile ayrıştırılması
Separation of mycobacterial cell wall extracts with HPLC responsible for therapy of bladder cancer
ZELİHA ERTÜRK
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
BiyokimyaHacettepe ÜniversitesiTıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NACİYE LEYLA AÇAN