Geri Dön

Targeted disruption of Homoserine dehydrogenase gene in Streptomyces clavuligerus and its effects on cephamycin C production

Streptomyces clavuligerus'da homoserin dehidrogenaz geninin hedeflenmiş blokasyonu ve bunun sefamisin C üretimi üzerine etkileri

PDF İndir

  1. Tez No: 180997
  2. Yazar: AYŞE KOCA ÇAYDAŞI
  3. Danışmanlar: PROF.DR. GÜLAY ÖZCENGİZ, Y.DOÇ.DR. EBRU İNCE YILMAZ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Biology, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Streptomyces clavuligerus, homoserin dehidrogenaz, sefamisinC, aspartat metabolik yolu, gen blokasyonu, Streptomyces clavuligerus, homoserine dehydrogenase, cephamycin C, aspartate pathway, gene disruption
  7. Yıl: 2006
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

ÖZSTREPTOMYCES CLAVULIGERUS'DA HOMOSERİN DEHİDROGENAZGENİNİN HEDEFLENMİŞ BLOKASYONU VE BUNUN SEFAMİSİN CÜRETİMİ ÜZERİNE ETKİLERİKoca Çaydaşı, AyşeYüksek Lisans, Biyoloji BölümüTez Yöneticisi: Prof. Dr. Gülay ÖzcengizYardımcı Tez Yöneticisi: Yrd. Doç. Dr. Ebru İnce YılmazTemmuz 2006, 94 sayfatürleri, yüksek kapasitede protein ve sekonder metabolitStreptomycesüreticisidirler. Bu grubun önemli türlerinden biri olan Streptomyces clavuligerussekonder metabolit olarak tıbbi açıdan oldukça değerli bir β-laktam antibiyotiği olansefamisin C ve güçlü bir β-laktamaz inhibitörü olan klavulanik asit üretmektedir. S.aspartik asit metabolik yolu β-laktam sentezi için öncülclavuligerus'unmetabolitler sağladığı için çok önemlidir. Bu metabolik yoldan L-lizin, L-metiyonin, L-izolösin ve L-treonin gibi 4 temel amino asit sentezlendiği gibi bir çokönemli öncül metabolit de oluşmaktadır. β-laktam sentezi için gerekli bir öncül olanL-α-aminoadipik-asit (α-AAA), aspartat metabolit yolundan sentezlenen L-lizininkatabolik bir ürünüdür. Aspartik asit yolunun L-lizin dalındaki karbon akışının,sefamisin C biyosentezi için hız sınırlayıcı olduğu bilinmektedir. Aspartatsemialdehid (ASA)'den L-homoserin sentezlenmesi, aspartat metabolik yolunun L-treonin, L- metiyonin ve L-izolösin sentezinine giden çatalının ilk enzimatikreaksiyonudur ve homoserin dehidrogenaz (HSD, EC 1.1.1.3) enzimi tarafındankatalizlenmektedir. S. clavuligerus'ta L-lizin ve α-AAA sentezi için gerekli ASAmiktarı, HSD'ın hücredeki biyosentez seviyesi veya aktivitesinin regulasyonu ilekontrol edilir.NRRL 3585'in homoserin dehidrogenaz geni (hom)S. clavuligeruslaboratuvarımızda daha önce klonlanıp karakterize edilmişti. Şimdiki çalışmada, S.clavuligerus'un hom geni, içine kanamisin dirençlilik kaseti sokulmak suretiyletahrip edilmiş ve inaktive edilen gen bir Streptomyces plazmid vektörü olan pIJ486içerisinde S. clavuligerus'a aktarılmıştır. Kromozomal hom geni ve plazmidüzerindeki bloke edilmiş hom geni arasındaki homolog rekombinasyon sonucuoluşan hom okzotrof bir suş (AK39) seçilmiş ve hom geni blokasyonun sefamisin Cüretimine etkisi incelenmiştir. hom geninin blokasyonu sonucunda, kimyasal olaraktanımlanmış (CDM) besiyerinde sefamisin C spesifik üretiminde 1.7 ile 2.0 misliartış gözlenmiştir.

Özet (Çeviri)

ABSTRACTTARGETED DISRUPTION OF HOMOSERINE DEHYDROGENASE GENEIN STREPTOMYCES CLAVULIGERUS AND ITS EFFECTS ONCEPHAMYCIN C PRODUCTIONKoca Çaydaşı, AyşeM. Sc., Department of BiologySupervisor: Prof. Dr. Gülay ÖzcengizCo-Supervisor: Assist. Prof. Dr. Ebru İnce YılmazJuly 2006, 94 pagesThe members of the genus Streptomyces are well-known for their capacity tosynthesize a vast repertoire of secondary metabolites, including many usefulantibiotics and proteins. Streptomyces clavuligerus is the producer of the medicallyimportant β-lactam antibiotics such as cephamycin C and the potent β-lactamaseinhibitor clavulanic acid. The aspartate pathway of S. clavuligerus is an importantprimary metabolic pathway providing substrates for β-lactam synthesis. Thispathway uses L-aspartic acid as the precursor for the biosynthesis of the aminoacids L-lysine, L-methionine, L-isoleucine, L-threonine and several importantmetabolic intermediates. L-α-aminoadipic acid (α-AAA) required for β-lactamsynthesis is a catabolic product of L-lysine produced from the lysine branch of theaspartate pathway. The carbon flow through the L-lysine-specific branch ofaspartate pathway is limiting for the formation of cephamycin C. Formation of L-homoserine from aspartate semialdehyde (ASA) is the first step of the other branchof the aspartate pathway leading to L-threonine, L-isoleucine and L-methioninesynthesis and is catalyzed by homoserine dehydrogenase (HSD, EC 1.1.1.3).Regulation of the activity or biosynthesis of the HSD of S. clavuligerus determinesthe availability of ASA for the biosynthesis of L-lysine and α-AAA.The gene encoding for homoserine dehydrogenase (hom) was previously clonedfrom S. clavuligerus NRRL 3585 and characterized in our laboratory. In this study,the hom gene was disrupted via insertion of a kanamycin resistance cassette intothis gene which was subsequently transferred to S. clavuligerus cells using theStreptomyces plasmid vector pIJ486. A hom mutant of S. clavuligerus (AK39) wasformed through integration into the chromosome by double crossing over and theeffects of hom disruption on cephamycin C yields were investigated. Disruption ofhom gene resulted in a 1.7 to 2.0 fold increase in specific cephamycin C productionin chemically defined medium (CDM).

Benzer Tezler

  1. Tez No

    645037

    Smart polymeric nanocomposites tailored for targeted delivery, protein separation and biofilm disruption

    Hedefli taşıma, protein ayırma ve biyofilm bozulması için tasarlanmış akıllı polimer nanokompozitler

    YAVUZ ÖZ

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2020

    Polimer Bilim ve TeknolojisiBoğaziçi Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AMİTAV SANYAL

  2. Tez No

    595574

    Receptor-targeted carbon nanotubes as nanomaterials for diagnostics and targeted treatment of cancer

    Kanser teşhis ve tedavisi için reseptör-hedefli karbon nanotüp nanomalzemelerin geliştirilmesi

    MEHDI PARTOVI MERAN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2019

    Kimya Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Kimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FATMA SENİHA GÜNER

  3. Tez No

    902351

    İnsani amaçlı ilaca erken erişim programı (compassionate use) ile hedefe yönelik tedavi alan onkoloji hastalarının advers olay profilinin incelenmesi

    Investigation of adverse event profile of oncology patients receiving targeted therapy with compassionate use program

    MÜCAHİDE MİRAC ERGÜN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Farmasötik ToksikolojiAnkara Üniversitesi

    Farmasötik Toksikoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AHMET OĞUZ ADA

  4. Tez No

    983471

    Hedefe yönelik kanser tedavisi için tek zincirli değişken fragman-anti mikrobiyal peptit füzyon proteininin rekombinant üretimi ve karakterizasyonu

    Recombinant production and characterization of single-chain variable fragment-antimicrobial peptide fusion protein for targeted cancer therapy

    SÜMEYYE ELİF ÖZTÜRK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2025

    BiyoteknolojiYıldız Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. EMEL ORDU

  5. Tez No

    517489

    The effects of engineered silica nanoparticles on the cellular behaviours of human hepatocellular carcinoma cell lines

    Biyomühendislik ürünü silika nanoparçaciklarin hepatoselüler karsinom hücre dizilerinin biyolojik davranişlarina etkileri

    ÖZGE TÜNCEL ÇERİK

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2018

    Biyomühendislikİzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SERDAR ÖZÇELİK

    PROF. DR. SAFİYE NEŞE ATABEY

Geri Dön