Geri Dön

Solunumsal patojen virusların IFAT ve multiplex PCR yöntemleri ile tanısı

Diagnosis of respiratory pathogen viruses by the methods of multiplex PCR and IFAT

PDF İndir

  1. Tez No: 194630
  2. Yazar: ÖMER KANDEMİR
  3. Danışmanlar: DOÇ.DR. MUSTAFA ALTINDİŞ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Respiratory viruses, IFAT, Multiplex PCR
  7. Yıl: 2007
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Afyon Kocatepe Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 99

Özet

XIIÖZETAntiviral tedavinin planlanmas›, hastane içi yay›l›m› önlemek, enfeksiyontakibi ve gözetimini sağlamak, hastane giderlerini ve hastanın hastanede kalış süresiniazaltmak gibi sebeplerden dolay› respiratuvar viruslerin taranmas› ve tan›s›n›nkonmas› oldukça önemlidir. Solunum yolu enfeksiyonu semptomlar› gösterençocuklarda, floresan antikor tekniği veya kültürle izolasyon gibi standart laboratuvarmetotlar› ile viruslar % 13- % 45 oranlar› aras›nda tespit edilebilmektedir. Buçalışmada, akut solunumsal hastalık semptomları gösteren çocuklardan alınannazofarengial sürüntü ve kan örneklerinde iki farkl› yöntemle solunumsal viruslar veonlara karşı gelişen IgM antikorlarının araştırması ile klinik tanının desteklenmesiamaçlanmıştır.Yeni geliştirilmiş ve kullanıma girmiş olan Multipleks kantitatif ReversTranskriptaz (RT) PCR Enzim Hibridizasyon Assay (Hexaplex Plus; Prodesse, USA)yöntemi ile nazofarengeal örneklerden tek tüpte Respiratuvar Sinsityal Virus (RSV),İnfluenza Virus Tip A (FluA), İnfluenza Virus Tip B (FluB), Parainfluenza Virus Tip1, 2 ve 3 (PIV1, PIV2 ve PIV3) ve Human Metapneumo Virus (hMPV) araştırılmıştır.Bu test yedi farklı solunumsal virusun araştırılması ve kantitasyonunda her virus içinkorunmuş bölgelerden hazırlanmış altı ve yarım primerler karıştırılarakhazırlanmıştır. Floresan antikor tekniği (FAT-Euroimmun GmbH, Almanya) ile deRSV, FluA H1N1, FluA H3N2, FluB, PIV1, PIV2, PIV3 ve Adenovirus (AdV)'ekarşı kanda oluşmuş IgM antikorları araştırılmıştır.Çalışma, bir yıllık dönemde, 46 hastadan alınan kan örnekleri venazofarengial sürüntü örnekleri ile gerçekleştirilmiştir. Örnek toplanan hastalarınyaşları 1 ay- 13 yaş arasındadır (ortalama 16.4 ± 4.5 ay). Örneklerin % 52'si erkek, %48'i bayan hastalardan oluşmaktadır.Alınan 46 kan örneğinden 13 tanesi (% 28.3) FAT ile (MPV hariç), aynısayıda nazofarengial sürüntü örneğinden 8 tanesi (% 17.4) multiplex PCR yöntemi ile(AdV hariç) bir veya daha fazla say›da respiratuvar virus aç›s›ndan pozitif olaraksaptanmıştır (P

Özet (Çeviri)

XIVSUMMARYAccurate detection of respiratory viruses is important to guide antiviraltherapy, prevent nosocomial spread, provide surveillance and in some cases, decreasehospital costs and lengths of stay. By using standard laboratory methods, such asstaining with fluorescent antibodies (FAT) and isolation by culture, viruses have beendetected in 13 to 45 % of children with symptoms of respiratory illness. In this study;two diagnostic methods used for respiratory viruses have shown acute respiratorytract infection symptoms in childrens.Detection of IgM antibodies from blood by fluorescent-antibody (FAT-Euroimmun GmbH Germany) and Multiplex RT PCR assays (Hexaplex Plus,Prodesse Inc. USA) for detection of respiratory syncytial virus (RSV), influenza virustype A (FluA), influenza virus type B (FluB), parainfluenza virus types 1, 2, and 3(PIV1, PIV2, and PIV3), human metapneumovirus (MPV) and adenovirus (AdV)from nasopharyngeal samples. A multiplex quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction-enzyme hybridization assay (RT-PCR) was developed andused to rapidly detect and quantitative RNA of seven viruses in nasopharyngealspecimens in a single test. Primers and probes originated from highly conservedregions of each viral genome. Six and a half primer pairs were mixed for thesimultaneous detection and quantitation of RNA from seven different respiratoryviruses. This was carried out in 46 nasopharyngeal and bloods specimens fromchildren with respiratory illnesses collected over a 1-year period.The median age of the patients from whom the specimens were collected was16.4 ± 4.5 months (range 2 months to 13 years); Fifty-two percent of samples werefrom male patients, and 48 % were from female patients. Of these 46 bloodspecimens, 13 (28.3 %) were positive by FAT (2 for RSV, 9 for FluA-H1N1, H3N2,8 for FluB, 3 for PIV3). Of these 46 nasopharyngeal specimens, 8 (17.4 %) werepositive by Multiplex PCR (1 for RSV, 8 for FluA, 1 for FluB, 3 for PIV3, 5 forMPV, and 1 for both FluA and 5 for hMPV, AdV absent in Hexaplex Plus). Thenumber of specimens positive only by PCR among specimens positive by PCR and/orFAT was 1 (50.0 %) of 2 for RSV, 8 (88.9 %) of 9 for FluA, 3 (100 %) of 3 for PIV3(P < 0.001).Use of both Multiplex PCR and FAT to identify viral respiratory pathogens inchildren will lead to improved diagnosis of respiratory illness.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    281883

    Solunumsal patojen viruslar ve influenza A H1N1(domuz gribi)'nin multiplex PZR yöntemleri ile tanısı

    İdentification of respiratory pathogen viruses and Influenza A H1N1 (Swine flu) by multiplex PCR assay

    KÜBRA ÇALIŞKAN ERYEĞEN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    MikrobiyolojiAfyon Kocatepe Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MUSTAFA ALTINDİŞ

  2. Tez No

    11285

    Kardiyopulmoner by-pass yöntemi ile ameliyat edilen kalp cerrahisi hastalarında ameliyat sonrası gelişen hastane infeksiyonlarının nedenlerinin, kaynaklarının ve etkenlerinin araştırılması

    Başlık çevirisi yok

    BEKİR KOCAZEYBEK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1990

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÖZDEM ANĞ

  3. Tez No

    374907

    Solunumsal yoğun bakım Ünitesinde ventilatör ilişkili pnömoni: Üç yılda neler değişti

    Ventilatory Associated Pneumonia in a Pulmonary Critical Care Unit: What has changed during three years period

    ZEHRA NUR TÖREYİN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Göğüs HastalıklarıEge Üniversitesi

    Göğüs Cerrahisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FEZA BACAKOĞLU

  4. Tez No

    248678

    Solunumsal yoğun bakım ünitesinde izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotik direnç durumları

    Microorganisms isolated from patients of respiratory intensive care unit and their antibiotic resistance

    HÜSEYİN BEYAZIT

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    Göğüs HastalıklarıDicle Üniversitesi

    Göğüs Hastalıkları ve Tüberküloz Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. GÜNGÖR ATEŞ

  5. Tez No

    420010

    Çocuk kistik fibrozis hastalarında gastroözofageal reflü özellikleri ve gastrik boşalma zamanı ile ilişkisi

    Characteristics of gastroesophageal reflux in children with cystic fibrosis and relation with gastric emptying time

    AYŞE İREM ZÖHRE

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıMarmara Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ENGİN TUTAR

Geri Dön