Identification of upstream conserved noncoding sequences for the analysisof transcriptional activation on IL-7 receptor alpha gene
IL-7 reseptör alfa geninin üzerindeki transkripsyonel aktivasyon analizi için kodlamayan korunmuş üst sekansların belirlenmesi
- Tez No: 197656
- Danışmanlar: DOÇ. DR. BATU ERMAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2005
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Sabancı Üniversitesi
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 116
Özet
lökin-7 (IL-7) B- ve T-lenfositlerin gelişiminde anahtar rol alan bir sitokindir.Lenfosit populasyonlarının IL-7'ye duyarlılığı, IL-7 reseptörünün (IL-7R) zamana vehücre tipine bağlı ekspresyonu ile kontrol edilir. IL-7R geninin transkripsyonel kontrolüile ilgili bir takım çalışmalar yapılmış olsa da, edinilen bulgular bu geninin üzerindekisıkı kontrolü açıklamak için yeterli değildir.Bu çalışmada, fare IL-7R alfa lokusunda, transkripsyon başlangıç noktasındanönde bulunan, korunmuş diziler aranmıştır. Fare ve insan genomunun bu bölgedekidizileri ikili genel hizalama yöntemine göre karşılaştırılmış olup, yedi tane yüzde 85'inüzerinde korunmuş kodlamayan dizi bulunmuştur. Bu diziler polimeraz zincirreaksyonu ile, spesifik bakteriyel yapay kromozomundan çoğaltılıp lusiferaz haberciplazmidlerine klonlanmıştır. Klonlanan korunmuş dizilerin fare T-lenfomahücrelerindeki transkripsyonel aktivasyon özelliklerini araştırmak için, lusiferaz geninedayanan bir genetik haberci stratejisi tasarlanmıştır.Belirlenen lusiferaz yöntemi, insan böbrek fibroblast hücrelerinde ve fare CD4pozitif T-lenfoma hücrelerinde denenmiştir. Bu çalışma, IL-7R geninin farklıekspresyon özelliklerine dayanarak genişletilmelidir. B- ve T-lenfosit gelişiminin farklıevrelerindeki hücrelerin korunmuş dizilere olan transkripsyonel duyarlılıklarınınincelenmesi, IL-7R geninin ekspresyonu üzerindeki kontrolü araştıran çalışmalarıhızlandıracaktır.
Özet (Çeviri)
Interleukin-7 (IL-7) is a key cytokine in the development of B- and T-lymphocytes. Responsiveness of lymphocyte populations to IL-7 is controlled by thetemporal and cell specific expression of the IL-7 receptor (IL-7R). Although there arestudies on the transcriptional regulation of IL-7R expression, these findings areinsufficient to explain the tight regulation on IL-7R expression.In this study, we identified conserved upstream sequences at the mouse IL-7Ralpha locus. We aligned murine and human genomic sequences using a pairwise globalalignment approach and found seven noncoding genomic regions with more than 85percent conservation. We amplified the conserved sequences from a specific bacterialartificial chromosome and constructed luciferase reporter vectors representing thesemouse genomic sequences. Here we investigate a reporter gene strategy to identify thetranscriptional activation properties of these mouse sequences in a mouse T-lymphomacell line.We evaluated the efficiency of luciferase assay system in a human kidneyfibroblast cell line and a mouse CD4 single positive T-lymphocyte cell line. Due to thedistinct expression properties of IL-7R, the present study can be expanded for cellsrepresenting the different stages of B- and T-lymphocyte development. Analysis of thetranscriptional responses of different cell lineages to the conserved sequences willfacilitate the studies on the investigation of the tight regulation on IL-7R expression.
Benzer Tezler
- Astragalus chrysochlorus'da fenilpropanoid metabolik yoluna ilişkin genomik analizler
Genomic analysis on phenylpropanoid pathway of Astragalus chrysochlorus
NESLİHAN TURGUT KARA
Doktora
Türkçe
2007
Biyoteknolojiİstanbul ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ŞULE ARI
- Mechanisms of autophagy control through microRNAs under cellular stress
Hücresel stres koşulları altında otofajinin mikroRNAlar ile kontrolü
DENİZ GÜLFEM ÖZTÜRK
- Abemaciclib ve palbociclib'in MIA PaCa-2 ve Capan-2 pankreas kanseri hücrelerinde ampk' nın etkileşimde olduğu üst ve alt sinyal yolakları ile etkilerinin araştırılması
Başlık çevirisi yok
BÖRTEÇİNE SEVGİN
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
Biyolojiİstanbul Kültür ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AJDA ÇOKER GÜRKAN
- Investigation of NFİB function and regulation of its putative target genes in human neural stem cell and SH-SY5Y neuroblastoma cell lines
İnsan sinir kök hücre ve SH-SY5Y nöroblastom hücre hatlarında NFIB işlevinin ve potansiyel hedef genlerinin regülasyonunun incelenmesi
BETÜL ULUCA
Doktora
İngilizce
2023
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ASLI KUMBASAR
- Identification of upstream regulators of MAPK stimulated Pea3-mediated neural differentiation in PC12 cells
PC12 hücrelerinde MAPK uyarılı Pea3 aracılı nöral farklılaşmanın üst akış düzenleyicilerinin tanımlanması
BERRAK ÇAĞLAYAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2010
BiyolojiYeditepe ÜniversitesiBiyoteknoloji Bölümü
DOÇ. DR. IŞIL AKSAN KURNAZ