Geri Dön

Ödemiş bölgesinde üretimi yapılan patates yumrularında PVY,PVX,PVS ve PLRV'lerinin RT-PCR yöntemiyle saptanması

Determination of PVY,PVX,PVS and PLRV at potato tubers which were produced in ödemiş region with RT-PCR method

  1. Tez No: 200661
  2. Yazar: MUSTAFA KÖKTEN
  3. Danışmanlar: PROF.DR. SERAP AÇIKGÖZ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Ziraat, Agriculture
  6. Anahtar Kelimeler: Potato sertification, PLRV, PVS, PVX, PVY, RT-PCR
  7. Yıl: 2007
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Adnan Menderes Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 54

Özet

Patates yetiştiriciliğinde virüsten temiz tohumluk elde etmek için virüsleri tanılayabileceğimiz hızlı ve hassas testlerin kullanılması önemlidir. Patates yumrularındaki viral etmenleri tanılamakta RT-PCR yöntemi kullanılmaktadır. Ancak patates yumruları birden fazla virüsle bulaşık olduğunda tek seferde hızlı bir şekilde bu karışım virüsleri (Patates Y Virüsü = PVY, Patates X Virüsü = PVX, Patates S Virüsü = PVS, Patates Yaprak Kıvrılma Virüsü = PLRV) tanılamak için multiplex RT-PCR yönteminin kullanılabilirliğinin belirlenmesi bu çalışmanın amacını oluşturmuştur. Bu amaçla, İzmir ? Ödemiş bölgesinde en fazla tohumluk üretimi yapılan Agata, Konsul, Granola, Marabel ve Marfona çeşitlerine ait 25'er yumrudan total RNA'lar elde edilmiştir. Total RNA'lardaki PVY, PVX, PVS, PLRV'leri, bu virüslere spesifik primerler kullanılarak RT-PCR ve multiplex RT-PCR yöntemleri ile belirlenmiştir. RT- PCR yöntemi uygulanarak beş patates çeşidinde dört viral etmenin (PVY, PVX, PVS ve PLRV) varlığı bulunmuştur. Ancak hiçbir yumruda dört viral etmen bir arada bulunmamıştır. Bu nedenle iki (PVX+PVS, PVX+PLRV, PVX+PVY, PVS+PLRV, PVS+PVY, PLRV+PVY) ve üç viral etmenin (PVX+PVS+PLRV, PVS+PVS+PVY, PVS+PLRV+PVY ve PVX+PLRV+PVY) bir arada bulunduğu örnekler için multiplex RT-PCR yöntemi uygulanmış ve örneklerde PVY hariç yöntemin kullanılabilir olduğu belirlenmiştir. 2 Bir yumruda üç viral etmenin multiplex RT-PCR ile belirlenmesinde PVY' ne ait herhangi bir sonuç alınamamış olsa da PVY' ne ait primer çiftleri ilk kez bu çalışmada denenmiştir. RT-PCR ve multiplex RT-PCR sonuçları değerlendirildiğinde ise 125 adet yumrudan 75 adedinin dört viral etmenden en az biriyle enfekteli olduğu, buna karşın sadece 50 adet yumrunun sağlıklı olduğu belirlenmiştir. 2007, 43 sayfa Anahtar sözcükler Patates sertifikasyon, PLRV, PVY, PVX, PVS, RT-PCR

Özet (Çeviri)

At potato production, for obtaining virus free seed it was important to use fast and sensitive test which defined viruses. RT-PCR method was used to define viral factors at potato tubers. But when the potato tubers infected more than one virus, at first time for obtaining mixture viruses (Potato Y Virus = PVY, Potato X Virus = PVX, Potato S Virus = PVS, Potato Leafroll Virus = PLRV) quickly, usefulness of multiplex RTPCR method formed this study purpose. For this purpose, in İzmir-Ödemiş region, total RNA?s were extracted from 25 tubers belong to Agata, Consul, Granola, Marabel and Marfona kinds which were used mostly for seed. PVY, PVX, PVS, PLRV at total RNA?s were determined using special primers to these viruses with RT-PCR and multiplex RT-PCR methods. With RT-PCR method, four viral factors were found at five potato kinds. But it wasn?t dedected four viral factor together at any tuber. For this reason multiplex RTPCR method used for samples which have two (PVX+PVS, PVX+PLRV, PVX+PVY, PVS+PLRV, PVS+PVY, PLRV+PVY) and three viral factors (PVX+PVS+PLRV, PVS+PVS+PVY, PVS+PLRV+PVY ve PVX+PLRV+PVY) all together and it was determined that this method can use except PVY. To determine of three viral factors at one sample with multiplex RT-PCR, for the first time it was tested specific primer pairs belong to PVY with the other viruses?es primer pairs in this study. But it wasn?t taken conclusion. 2 To utilize the RT- PCR and multiplex RT-PCR results, it was determined that 75 of 125 tubers were infected with at least one of four viral factors. In spite of this 50 tubers were healthy. 2007, 43 pages

Benzer Tezler

  1. Ege bölgesinde geleneksel çömlekçiliğin bugünkü durumu

    The Current situation of traditional pottery in the aegean region

    İREM ÇALIŞICI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2003

    El SanatlarıDokuz Eylül Üniversitesi

    Çini ve Çini Onarımları Ana Sanat Dalı

    YRD. DOÇ. DR. ÖZNUR AYDIN

  2. İntravitreal bevacizumab enjeksiyonun konjonktival kalınlığa etkisi

    Intravitreal bevacizumab injection's effect on conjunctival thickness

    MEHMET OĞUZHAN KUNCI

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Göz HastalıklarıÇanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi

    Göz Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. İSMAİL ERŞAN

  3. KOSGEB AR-GE, inovasyon desteklerinin değerlendirilmesi: Bursa organize sanayi bölgesi ve Nilüfer organize sanayi bölgesi KOBİ'leri özelinde bir çalışma

    Rewiew of KOSGEB's R&D, innovation supports: A spesific study on MSE's of Bursa organized industrial zone and Nilufer organized industrial zone

    YAKUP PİRİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Elektrik ve Elektronik MühendisliğiBursa Teknik Üniversitesi

    Elektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NURETTİN ACIR

  4. Doğu Karadeniz bölgesinde çay tarımının yapısı, başlıca ürünlerle mukayesesi ve dış ticareti

    Structure of tea harvest comparasion of basic agricultural products and foreign trade in the east region of Black sea

    KÖKSAL KASAPOĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1998

    EkonomiKaradeniz Teknik Üniversitesi

    İktisat Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. KENAN ÇELİK

  5. Ofis yapılarında kullanım dönüşümü, döngüsel ekonomi örneği

    Adaptive reuse of office buildings, circular economy case

    BUĞRA BÜTÜN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    MimarlıkYıldız Teknik Üniversitesi

    Mimarlık Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SERHAT BAŞDOĞAN