Geri Dön

Serin alkali proteaz sentezini kontrol eden aspartik asit grubu amino asitlerin proteaz üretimine etkisinin araştırılması

Investigation of effects on protease production which aspartic acid group amino acid control of synthesis on serine alkaline protease

PDF İndir

  1. Tez No: 213749
  2. Yazar: BAHAR TOSUN ERCAN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. PINAR ÇALIK, PROF. DR. TUNÇER H. ÖZDAMAR
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyomühendislik, Biyoteknoloji, Kimya Mühendisliği, Bioengineering, Biotechnology, Chemical Engineering
  6. Anahtar Kelimeler: Serin alkali proteaz üretimi, rekombinant Bacillus, kontrol eden amino asitler, amino asitler, metabolik yolizi mühendisliği, Serine alkaline protease production, recombinant Bacillus, controlling amino acids, intracellular metabolites, amino acids, metabolic pathway analysis
  7. Yıl: 2007
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ankara Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Kimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 148

Özet

Serin Alkali Proteaz (SAP) üretiminde subC içeren plasmid pHV1431 taşıyan rekombinant Bacillus licheniformis ile SAP sentezini kontrol eden aspartik asit grubu amino asitlerin ?aspartik asit (Asp), asparajin (Asn), izolözin (Ile), lizin (Lys), treonin (Thr), metionin (Met)- SAP üretimine etkisinin belirlenmesi amacıyla farklı ekleme zamanlarında ve CAA=0-15 mM derişim aralığında etkileri incelenmiştir. Bu amino asitlerden Asp, Asn, Ile, Thr, Lys sırasıyla te=0 ekleme anında CAsp=7.5 mM derişiminde 1.35 kat, te=18 ekleme anında CAsn=5.0 mM derişiminde 1.38 kat, te=18 ekleme anında CIle=15 mM derişiminde 1.25 kat, te=18 ekleme anında CThr=7.5mM derişiminde 1.32 kat, te=0 ekleme anında CLys=2.5 mM derişiminde 1.12 kat attırırken, metionin (Met) ise üretimi inhibe etmiştir. Diğer taraftan farklı rekombinant türleri ile de birer set deney yapılmış, rekombinant B.subtilis ile te=0 ekleme anında üç farklı derişimde (2.5, 5.0, 7.5 mM), rekombinant B.amyloliquefaciens ve rekombinant B.sphaericus ile de te=0'da ve her biri CAA=2.5 mM derişimde aspartik asit grubu amino asitlerin etkisi incelenmiş; bunun sonucunda rekombinant B.subtilis'de Asp 1.28 kat, Asn 1.25 kat, Thr 1.30 kat, Lys 1.67 kat, Met 1.41 kat üretimi arttırmış; Ile ise inhibe etmiştir. Rekombinant B.amyloliquefaciens'de ise Asp üretimi 1.35 kat, Asn 1.25 kat arttırmış; Thr, Ile, ve Lys ise inhibe etmiştir. Rekombinant B.sphaericus'da ise Asp üretimi 1.35, Thr 1.28 kat, Lys 1.26, Ile ise 1.22 kat arttırmış; Asn ise üretimi inhibe etmiştir. Programın ikinci aşamasında ise rekombinant B.licheniformis ile optimum derişimleri belli olan aspartik asit grubu amino asitlerin SAP verimine ve seçimliliğine, ürün ve yan ürün dağılımlarına etkisi incelenmiş ve her amino asit için üç farklı derişimde metabolik yolizi analizi yapılmıştır. Metabolik yolizi analizinin sonucunda SAP üretiminde ortama optimum ekleme anında ve optimum derişimde eklenen Asp, Asn, Thr, Ile, Lys'nin SAP üretimini arttırarak üretimde bir darboğaz olmaktan çıktığı belirlenmiş, bu çalışmadan sonra yapılacak çalışmalarda mikroorganizmalarda regülasyon mekanizmaları dikkate alınarak genetik modifikasyon yapılması durumunda üretimin daha fazla arttırabileceği sonucuna ulaşılmıştır. 2007, 148 sayfa

Özet (Çeviri)

The effects of concentration and addition of aspartic asid group amino acids on serine alkaline protease (SAP) production in order to determine the controlling amino acids of SAP synthesis were investigated by using recombinant Bacillus licheniformis carrying subC gene encoding SAP enzyme. SAP activity was increased in each enriched bioprocess medium containing 7.5 mM aspartic acid (Asp), 5.0 mM asparagine (Asn), 15 mM ısoleucine (Ile), 7.5 mM threonine (Thr), 2.5 mM lysine (Lys), respectively, 1.35, 1.38, 1.25, 1.32, 1.12 fold. Methionine was inhibated the production of SAP synthesis. The effects of aspartic acid group amino acids on SAP production with he other recombinant Bacillus species (r-B.subtilis, r-B.sphaericus, r-B.amyloliquefaciens) was investigated. With r-B.subtilis; SAP activity was increased in each enriched bioprocess medium containing Asp, Asn, Thr, Lys, Met respectively 1.28, 1.25, 1.30, 1.67, 1.41 fold but Ile inhibated the production of SAP synthesis. With r-B.sphaericus; SAP activity increased in each enriched bioprocess medium containing Asp, Thr, Lys, Ile respectively, 1.35, 1.28, 1.26, 1.22 but Asn was inhibated the SAP production. With r-B.amyloliquefaciens SAP activity increased in each enriched bioprocess medium containing Asp, Asn respectively 1.35, 1.25 fold but Ile, Lys, Thr inhibated the SAP production. Threafter, the mass-flux balance based stoichiometric model for the bioreaction network that includes 236 reactions and 183 metabolites were developed; and then solved using the extracellular concentration data together with the batchbioreactor medium concentration measurements. Results of the metabolic pathway analysis; aspartic acid group amino acids were bootleneck of the SAP production. 2007, 148 pages

Benzer Tezler

  1. Tez No

    603527

    Recombinant production and characterization of serine protease enzyme from Virgibacillus sp. AGTR strain

    Virgibacillus sp. AGTR suşundan izole edilen serin proteaz enziminin rekombinant üretimi ve karakterizasyonu

    BEGÜM ÖZDEN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2019

    Biyoteknolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NEVİN GÜL KARAGÜLER

  2. Tez No

    120140

    Serin alkali proteaz enziminin hücreiçi üretimini kontrol eden alanin ve serin grubu amino asitlerin enzim üretimine etkisi

    Effects of controlling alanine and serine group amino acids on serine alkaline protease production

    ARZU BAYRAM

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2002

    Kimya MühendisliğiAnkara Üniversitesi

    Kimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. TUNÇER H. ÖZDAMAR

  3. Tez No

    688848

    Recombinant production and characterization of serine protease enzyme from Virgibacillus sp. AGTR strain using site directed mutagenesis

    Virgibacillus sp. AGTR suşundan izole edilen serin proteaz enziminin bölgeye yönelik mutagenez yöntemi kullanılarak rekombinant üretimi ve karakterizasyonu

    EVRİM KAPUCU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Biyokimyaİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NEVİN GÜL KARAGÜLER

  4. Tez No

    76601

    Serin alkali proteaz enzimi üretimi için biyoproses geliştirilmesi

    Bioprocess development for serine alkaline protease production

    PINAR ÇALIK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1998

    Kimya MühendisliğiAnkara Üniversitesi

    Kimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. H. TUNÇER ÖZDAMAR

  5. Tez No

    143384

    Comparative analysis of product and by-product distributions in defined and complex media in serine alkaline protease production by recombinant Bacillus subtilis

    Rekombinant Bacillus subtilis ile serin proteaz üretimi sırasında tanımlanmış ve kompleks ortamlardaki ürün ve yan-ürün dağılımlarının karşılaştırmalı analizi

    CEREN OKTAR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2003

    Kimya MühendisliğiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Kimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. PINAR ÇALIK

Geri Dön