Süt ve süt ürünlerinden Yarrowia lipolytica izolasyonu, identifikasyonu ve ürettikleri alkalin proteaz ve ribonükleaz enzimlerinin aktivitelerinin araştırılması
Isolation and identification of Yarrowia lipolytica from milk and dairy products, study of alkaline protease and ribonuclease enzymes activities of this species
- Tez No: 216124
- Danışmanlar: PROF. DR. FÜSUN UÇAR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Mikrobiyoloji, Biology, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Y. lipolytica, identifikasyon, ITS-PCR, alkalin proteaz ve ribonükleaz enzimleri, Y. lipolytica, identification, ITS-PCR, alkaline protease and ribonuclease enzymes
- Yıl: 2008
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 291
Özet
Farklı süt ve süt ürünlerinde bozulmaya neden olan 48 maya izole edilmiş ve bu izolatların tanılanmaları hem Barnett ve ark. (2000) tarafından önerilen fenotipik testler ile hem de 5,8S ITS PCR ile genotipik testlerle tanılanmıştırlar. Ayrıca, ITS PCR'da elde edilen PCR fragmentlerinin sekans analizi yapılmıştır. Fenotipik testler sonucunda, 48 izolatın sadece 9 tanesi (5, 6, 9, 10, 17, 18, 19, 20 ve 21 numaralı strainler) Y. lipolytica straini olarak tanılanmış olmasına rağmen denemeye alınan 43 izolatın genotipik tanılamasında bu 9 Y. lipolytica straine ilave olarak 5 tane daha izolat (1, 3, 7, 8 ve 23 numaralı strainler) Y. lipolytica straini olarak tanılanmıştır. Ancak, sekans analizi sonuçlarında, 14 Y. lipolytica straininden bir tanesi (1 numaralı strain) Saccharomyces cerevisiae olarak tanılanmıştır. Yapılan sekans analizi sonucunda, ITS PCR'a göre tanılanan 1, 8, 9 ve 10 numaralı Y. lipolytica strainleri haricinde 3, 5, 6, 7, 17, 18, 19, 20, 21 ve 23 numaralı Y. lipolytica strainleri sırasıyla %89, %99, %92, %93, %96, %93, %89, %92, %92 ve %92 oranında Y. lipolytica strainleri ile benzerlik göstermiştir.Y. lipolytica tarafından üretilen alkalin proteaz ve ribonükleaz hücre dışına salgılanan ve endüstriyel önemi olan enzimlerdir. Araştırmamızda identifikasyonu yapılan 14 Y. lipolytica strainleri farklı karbon ve azot kaynakları kullanılarak alkalin ekstraselüler proteaz (AEP) ve ribonükleaz (RNaz) üretiminin regülasyonu yönünden çalışılmış ve farklı pH değerlerinindeki sıvı kültürler kullanılarak süpernant ortamın enzim aktivitesinin saptanması amaçlanmıştır. Bütün ortamlarda en fazla aktivite nötr pH'da meydana gelmiştir. AEP'i en fazla nötr pH'da üreten strainin Yarrowia lipolytica CBS 6124 tip türünün olduğu ve 57 unit/ml aktiviteye sahip olduğu hesaplanmıştır. Bunu 5 numaralı Y. lipolytica straini 36,21 unit/ml ile takip etmiştir. Benzer şekilde, denemeler sonunda RNaz üretimi en fazla aktivite nötr pH'da meydana gelmiştir. RNazı en fazla üreten strainin 21 numaralı Y. lipolytica straininin olduğu ve 3002,48 unit/ml aktiviteye sahip olduğu hesaplanmıştır.
Özet (Çeviri)
48 yeast strains causing spoilage on different dairy products were isolated and this isolates identified both suggested with phenotypic tests by Barnett et al. (2000) and genotypic tests with 5,8S ITS PCR. Also, PCR fragments obtained from ITS PCR were analyzed sequencing. Despite the results of phenotypic tests, 9 of the 48 isolates (5, 6, 9, 10, 17, 18, 19, 20 and 21 numbered strains) idetified as Y. lipolytica, after the study of 43 isolates which genotypically identified as Y. lipolytica than 5 strain (1, 3, 7, 8 ve 23 numbered strains) were added to these isolates phenotipically. However, after the results of sequencing, 1 of the 14 Y. lipolytica strains (numbered 1 strain) identified as Saccharomyces cerevisiae. After sequencing, except 1, 8, 9, 10 numbered Y. lipolytica strains which were identified according to ITS PCR, 3, 5, 6, 7, 17, 18, 19, 20, 21 and 23 numbered Y. lipolytica strains respectively show similarity 89%, 99%, 92%, 93%, 96%, 93%, 89%, 92%, 92% and 92%.Alkaline extracellular protease (AEP) and ribonuclease (RNase) produced by Y. lipolytica are secreted to extracellular environment and has an industrial occurance. In our research, identified 14 Yarrowia lipolytica strains, with the use of different carbon and nitrogen sources, regulation of AEP and RNase production studied. Morever, it is aimed to detect enzymes activities with the use liquid cultures which have different pH values. The most protease activity has a accoured in neutre pH. It is noted that in neutre pH Yarrowia lipolytica CBS 6124 type species has the AEP production the most and accounted 57 unit/ml activity. 5 numbered Y. lipolytica strain followed as 36,21 unit/ml. Similar to, after the RNase production assay, the most ribonuclease activity has a accoured in neutre pH. The most RNase producing strain is the 21 numbered Y. lipolytica strain and activity accounted as 3002,48 unit/ml.
Benzer Tezler
- Gaziantep'te bazı süt ürünlerinde bozulmaya neden olan mayalardan ekstraselüler lipaz enzimi aranması ve lipaz aktivitesine sahip suşların genotipik identifikasyonu
Detection of extracellular lipases and genotypic identification from yeast causing to spoilage of some dairy products produced in Gaziantep
SEMİH TOKAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
MikrobiyolojiGaziantep ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. İBRAHİM HALİL KILIÇ
- Süt ürünlerinden izole edilen maya suşlarının moleküler identifikasyonu ve endüstriyel öneme sahip maya türlerinin belirlenmesi
Molecular identification of yeast strains isolated from dairy products and determination of yeast species with industrial important
MELİH GÜNAY
Doktora
Türkçe
2023
BiyolojiÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ TÜLAY TURGUT GENÇ
- Süt ürünleri ve zeytinde bozulmaya neden olan maya türlerinin 'real-time PCR yüksek çözünürlüklü erime analizi' ile tanımlanması
Identification of spoilage yeasts in dairy products and olives with real-time PCR high resulotion melting analyses
MİNE ERDEM
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
BiyoteknolojiErciyes ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ZÜLAL KESMEN
- Optimization of Production Parameters for Single Cell Oil and Metabolite Production from Yarrowia lipolytica Strains
Yarrowia lipolytica Suşlarından Tek Hücre Yağı ve Metabolit Üretim Parametrelerinin Optimizasyonu
AYŞE SAYGÜN
Doktora
Türkçe
2017
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NEŞE ŞAHİN YEŞİLÇUBUK
PROF. DR. NECLA ARAN
- Süt ve süt ürünlerinden laktik asit bakterilerinin izolasyonu ve moleküler identifikasyonu
Başlık çevirisi yok
BARIŞ BOSTANCI
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Veteriner HekimliğiAfyon Kocatepe ÜniversitesiMedikal Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. SEVİM FEYZA ERDOĞMUŞ