Proteom analizi ile fare karaciğer dokusu proteinlerinde 7,8-dihidroksi-3-(4-metilfenil) kumarinin neden olabileceği değişikliklerin saptanması
Determination of possible changes in the proteins of rat liver tissue induced with 7,8-dihydroxy-3-(4-methylphenil) coumarin by proteom analysis
- Tez No: 233506
- Danışmanlar: PROF. DR. AYŞE OGAN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyokimya, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2007
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Marmara Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Bölümü
- Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 89
Özet
Flavonoid sınıfı bileşiklerden olan kumarinler, antikoagülan etkilerinin yanısıra bilinen kolesterol düşürücü özellikleri nedeni ile de önemlidir. Bu çalışmada, Bölümümüz Organik Kimya Anabilimdalınca sentezlenen ve kolesterol düşürücü etkisi olduğu daha önceki çalışmalarımızda saptanan 7,8-dihidroksi-3-(4-metilfenil) kumarinin, hiperlipidemi oluşturulmuş serum kolesterol düzeyi yüksek sıçan karaciğer proteinleri üzerindeki etkisi, proteom tekniği kullanılarak araştırılmıştır.Hiperlipidemi oluşturulmuş Sprague-Dawley türü sıçana 7,8-dihidroksi-3-(4-metilfenil) kumarin uygulanmış ve karaciğer dokusu çıkarılmıştır. Kontrol olarak, ilaç uygulanmamış hiperlipidemik serum kolesterol düzeyi yüksek aynı tür sıçan karaciğer dokusu kullanılmıştır. İki boyutlu elektroforez işlemi sonucunda sıçan karaciğer protein profilinin pI: 5,5-9 aralığında yoğunlaştığı belirlenmiştir. Molekül ağırlığı olarak da en büyük yoğunluğun 25-30 kDa bölgesinde olduğu saptanmıştır. Kullandığımız PDQuest görüntüleme sistemi yardımı ile 1358 spot belirlenmiştir. Bunların içinde farklılık gösteren 14 tanesinin MALDI-Tof analizi yapılarak Matrix-Science protein veri tabanı ile karşılaştırılmış, molekül ağırlıkları ve pI değerleri saptanmıştır.Proteomik analizlerle elde edilen bu bilgiler kolesterol düşürücü ilaçların etkisinin anlaşılmasında yararlı olabilecektir.
Özet (Çeviri)
Coumarins, are a class of compounds called flavonoids, which are significant not only for their anticoagulant effect but also for their cholesterol lowering effect. In this study, the effect of 7,8-dihydroxy-3-(4-methylphenil) coumarin, which was synthesized by Organic Chemistry Division of our department and its cholesterol lowering effect was proven in our previous studies, on the liver proteins of hyperlipidemic Sprague-Dawley rat by proteom analysis.We investigated the effect of 7,8-dihydroxy-3-(4-methylphenil) coumarin on the protein profiles of the liver tissues of hyperlipidemic Sprague-Dawley rat by proteom analysis. 7,8-dihydroxy-3-(4-methylphenil) coumarin was administrated orally to hyperlipidemic induced Sprague-Dawley rat with high serum cholesterol level. As control hyperlipidemia induced with high serum cholesterol level same strain rat liver was used. The 2D PAGE revealed that the liver protein profile was intensified in the range pI: 5,5-9, on the other hand the heavies molecular weight occured in the range 25-30 kDa. The PDQuest scanning and projection program displayed 1358 spots. After analysis the credible proteins number is 14. These proteins were excised and identified by MALDI-Tof analysis and compared to Matrix-Science protein data base. Their molecular weights and pI values are determined.These collected data will be of assistance in understanding the mechanismes of cholesterol lowering effect of 7,8-dihydroxy-3-(4-methylphenil) coumarin.
Benzer Tezler
- Proteomik yaklaşımlarla nörodejeneratif mekanizmaların araştırılması ve tedaviye yönelik potansiyel hedeflerin belirlenmesi
The investigation of neurodegenerative mechanisms by using proteomic approaches and determining potential therapeutic targets
ÇİĞDEM ACIOĞLU
Doktora
Türkçe
2016
Moleküler TıpKocaeli ÜniversitesiTıbbi Genetik ve Moleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HAKAN SAVLI
YRD. DOÇ. DR. AHMET TARIK BAYKAL
- Beyin ekstrasellüler matriksinin nörodejenerasyondaki rolünün alzheimer fare modelinde araştırılması
Investigation of the role of brain extracellular matrix in neurodegeneration BY using alzheimer's disease mouse model
BÜŞRA AYDOĞDU
Doktora
Türkçe
2017
Biyokimyaİstanbul Medipol ÜniversitesiSinir Bilimi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜRKAN ÖZTÜRK
DOÇ. DR. AHMET TARIK BAYKAL
- Molecular analysis of cortical malformation in mammalian cortex by using proteomics approaches
Proteomik yaklaşımlar kullanılarak memeli korteksindeki kortikal malformasyonun moleküler analizi
BERFU NUR YİĞİT
Doktora
İngilizce
2024
GenetikKoç ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NURHAN ÖZLÜ SICAKKAN
- Alzheimer hastalığı transgenik fare modelinde nano-LC-MS/MS metaproteomik analiz yöntemi ile bağırsak florasındaki değişimin araştırılması
Investigation of change in intestinal flora in alzheimer's disease transgenic mouse model BY nano-LC-MS / MS metaproteomic method
ESRA AYAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
BiyokimyaAcıbadem Mehmet Ali Aydınlar ÜniversitesiBiyokimya ve Moleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AHMET TARIK BAYKAL
- Huntington hastalığı beyin proteom değişimlerinin YAC128 transgenik fare modelinde MALDI-MS görüntüleme tekniği ile araştırılması
Detection of huntington's disease brain proteome alterations in YAC128 transgenic mouse model via MALDI-MS imaging
MERVE KARAYEL BAŞAR
Doktora
Türkçe
2022
BiyokimyaAcıbadem Mehmet Ali Aydınlar ÜniversitesiBiyokimya ve Moleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AHMET TARIK BAYKAL