Simulation of the stepping stone model for population structure
Stepping-stone populasyon yapısı modelinin simulasyonu
- Tez No: 23509
- Danışmanlar: PROF. DR. AYKUT KENCE
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Stepping-Stone Modeli, Uzamsal Otokorelasyon, Uzamsal Otokorelasyon Analizi, Simulasyon, Populasyon Yapısı, Benzetim, Gen frekansı, Otokorelasyon, Popülasyon, Stepping Stone Model, Spatial Autocorrelation, Spatial Autocorrelation Analysis, Simulation, Population Structure Science Codes: 401.01.02, 401.02.03 IV, Gene frequence, Autocorrelation, Population, Stepping-stone model
- Yıl: 1992
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
oz STEPPING-STONE POPULASYON YAPISI MODELİNİN SİMULASYONU TURAK, Ayşe Suzan Yüksek Lisans Tezi, Biyoloji Anabilim Dalı Danışman: Prof.Dr. Aykut Kence Ağustos, 1992, 140 sayfa. Bu tezde Stepping-Stone Populasyon Yapısı modelinin simulasyonunu gerçekleştirmek amacıyla bir bilgisayar programı geliştirildi. Bu program, 400 alt- populasyondan oluşan kare örgülü bir populasyonda gen frekansmdaki değişimlerin incelenmesi amacıyla kullanıldı. Program, farklı parametreler kullanan 23 grup için 200 jenerasyon çalıştırıldı ve her grup beş defa tekrarlandı. Elde edilen gen frekans yüzeyleri basıldı ve görsel olarak analiz edildi. Bu yüzeyler ayrıca Uzamsal Otokorelasyon Analizi yöntemi kullanılarak özetlendi. Elde edilen korelogramlar populasyon içindeki gen frekansını etkileyen faktörlerin yol açacağı yapılanmaları ortaya çıkarmak amacıyla birbirleriyle karşılaştırıldılar. Difüzyon hızının, diğer mikro-evrimsel güçlerin etkilerini arttırmak veya azaltmak yoluyla gen frekansyüzeylerinin yapısı üzerinde önemli ölçüde etkili olduğu ortaya çıktı. Ayrıca, Uzamsal Otokorelasyon Analizinin tek gen lokusunun sözkonusu olduğu durumlarda gen frekans yüzeylerinin analizi için fazla etkili bir yöntem olmadığı sonucuna varıldı. f
Özet (Çeviri)
ABSTRACT SIMULATION OF THE STEPPING STONE MODEL FOR POPULATION STRUCTURE TURAK, Ayse Suzan M.S. in Biology Supervisor: Prof. Dr. Aykut Kence August, 1992, 140 pages. A computer program for simulating the Stepping- Stone Model of population structure is developed and used for studying the changes in gene frequency in a square grid population of 400 demes. 23 sets of simulation runs with different parameters are performed as five replicates, each of which lasts for 200 generations. The resulting gene frequency surfaces are ploted and analyzed visually. Also these surfaces are sumarized by the method of Spatial Autocorrelation Analysis, and the resulting correlograms are compared with each other for apparent trends caused by underlying forces acting on the gene frequency within the population. Diffusion rate is found to be the most important factor in shaping the gene frequency surfaces, because, XIIdepending on its strength, it tends to enhance or dampen the effects of other microevolutionary forces. Also, in this study Spatial Autocorrelation Analysis does not emerge as a very powerfull tool for the analysis of gene frequency surfaces where a single gene locus is concerned.
Benzer Tezler
- İki serbestlik dereceli bir gimbal sisteminin modellenmesi, tanılanması ve gerçek zamanlı kontrolü
Modelling, identification and real-time control of a two-degree-of-freedom gimbal system
BATUHAN KALKAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
Makine Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiMakine Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYHAN KURAL
- Bisiklet öncelikli kavşak işletiminde yeni bir yaklaşım
A new approach for operation of intersections with presedence of bicycle
CİHAT KALYONCUOĞLU
Doktora
Türkçe
2017
Ulaşımİstanbul Teknik Üniversitesiİnşaat Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MURAT ERGÜN
- Search for susy in missing transverse energy plus multijet topologies at sqrt (s) = 14 TeV and geant4 simulation of the CMS hadronic forward calorimeter in the 2004 test beam
Sqrt ps = 14 TeVde kayıp enine enerji ve C¸ oklu jet topolojisinde susi araştırmaları ve CMS ileri hadronik kalorimetresinin 2004teki demet testinin geant4 benzetişimi
TAYLAN YETKİN
Yüksek Lisans
İngilizce
2006
Fizik ve Fizik MühendisliğiÇukurova ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜLSEN ÖNENGÜT
- Sistem dinamik simülasyonu ile topraksız tarımda çilek üretimi projesinin finansal fizibilite analizi
Financial feasibility analysis of strawberry production project in soilless agriculture with system dynamic simulation
BEGÜM AKAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
Ziraatİstanbul Ticaret ÜniversitesiEndüstri Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ EMİN BAŞAR BAYLAN
- A double auction microgrid market design and its application with agent-based simulation
Mikro şebekeler için bir piyasa önerisi ve ajan temelli benzetim ile bir uygulaması
EFE BAŞLAR
Yüksek Lisans
İngilizce
2020
Endüstri ve Endüstri Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiEndüstri Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ CAFER ERHAN BOZDAĞ