Geri Dön

Determination of Genetic Diversity and Antioxidant Content of the National Melon (Cucumis melo) Collection

Ulusal kavun (cucumis melo) hatlarında genetik çeşitliliğin belirlenmesi ve antioksidant karakterizasyonu

  1. Tez No: 237011
  2. Yazar: HASAN ÖZGÜR ŞİĞVA
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. ANNE FRARY
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2008
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
  10. Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Bölümü
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 102

Özet

Bu çalışmada, 238 adet ulusal kavun hattı ile 12 farklı kabakgiller üyesi arasındaki genetik çeşitliliğin bulunması amacıyla 19 farklı kriterde morfolojik karakterizasyon ile beraber iki tip PCR tabanlı moleküler markır sistemleri olan Simple Sequence Repeats (SSRs), Basit Dizi Analizi, ve Amplified Fragment Length Polymorphisims (AFLPs), Çoğaltılmış Parça Uzunluk Polimorfizmi, kullanılmıştır.Morfolojik analizleri sonucunda, hatlar meyve şekli bakımından büyük çeşitlilikler göstermektedir, 53 (38.41%) hat globular (küresel), 51 (36.96%) hat eliptik, 15 (10.87%) hat ovat, 7 (5.07%) hat oblat, 2 (1.45%) hat elongat, 1 (0.72%) hat düz şekillidir. Bir diğer önemli özellik ise birincil meyve kabuğu rengidir. 55 (39.86%) hat açık sarı, 34 (24.64%) hat soluk yeşil, 29 (21.02%) hat turuncu, 9 (6.52%) hat krem rengi, 6 (4.35%) hat yeşil, 4 (2.9%) hat siyah-yeşil ve 1 (0.72%) hat koyu yeşil renktedir. Hatların büyük kısmı 115 (83.33%) meyve tadı bakımından orta seviyededir. 13 (9.42%) hat acı ve 10 (7.25%) hat ise tatlıdır.Genetik karakterizasyonu sonucunda 306 adet polimorfik AFLP fragmentleri (10 adet AFLP primer kombinasyonundan) ve 93 adet SSR fragmentleri (12 adet SSR primerinden) elde edilmiş ve bu değerler genetik uzaklığın ölçümünde kullanılmıştır. AFLP primer kombinasyonu başıına ortalama 34.5, SSR primerleri başına ise 7.75 polimorfik fragment düşmektedir. 345 AFLP ve 93 SSR polimorfik fragmentleri ışığında, 238 adet ulusal kavun hattı ile 12 adet kabakgiller üyesi arasındaki genetik ağaç NTSYS-pc version 2.2 programında SHAN modülünde DICE katsayısı ve UPGMA metodu kullanılarak çizilmiş ve AFLP'de 10, SSR'da 21 adet grup kesin olarak ayrılmıştır. Bu çalışmada ulusal kavun hatları, genetik benzerlik ve farklılık ilkesine bağlı olarak saptanmıştır.43 adet ulusal kavun hattında ABTS dekolorizasyon yöntemi kullanılarak suda çözünebilen toplam antioksidant ve toplam fenolik aktivitesi hesaplanmıştır.

Özet (Çeviri)

In this study, characterization with 19 morphological criteria and two types of PCR-based molecular marker systems, Simple Sequence Repeats (SSRs, microsatellites) and Amplified Fragment Length Polymorphisms (AFLPs), were used to characterize genetic variability among 238 national melon (Cucumis melo L.) accessions and 12 different members of the Cucurbitaceae family.According to morphological analysis, all accessions were vigorous. The accessions showed a great variety of fruit shape, 53 (38.4%) accessions were globular (round), 51 (37.0%) were elliptical, 15 (10.9%) were ovate, 7 (5.1%) oblate, 2 (1.4%) elongate and one accession was flattened. Another agronomical important criterion was predominant fruit skin colour. A total of 55 (39.9%) accessions had light yellow predominant skin colour, 34 (24.6%) were pale green, 29 (21.0%) were orange, 9 (6.5%) were cream, 6 (4.4%) were green, 4 (2.9%) were blackish-green and 1 (0.7%) was dark green.In accordance with genetic characterization, a total of 345 polymorphic AFLP fragments (products of 10 AFLP primer combinations) and 93 SSR fragments (products of 12 SSR markers) were detected and used to calculate genetic distance using DICE matrix and UPGMA (Unweighted Pair Group Method) arithmetical averages. The average polymorphic AFLP fragments per combination was 34.5 and SSR fragments per marker was 7.75. The phylogenetic tree showed that groups were clearly separated by both marker systems. This study allowed the identification of the relationship between national melon accessions based on genetic similarity or differences.Forty three melon accessions were also analyzed for total water soluble antioxidant and total phenolic compound activities.

Benzer Tezler

  1. Farklı Hericium izolatlarının en uygun yetiştirme koşulları ve ortamlarının belirlenmesi ve moleküler karakterizasyonu

    Determination of optimal growing conditions and growing substrate for different Hericium isolates and moleculer characterization

    FUNDA ATİLA

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    ZiraatEge Üniversitesi

    Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. YÜKSEL TÜZEL

  2. Bazı hıyar (Cucumis sativus L.) genotiplerinin morfolojik ve moleküler karakterizasyonu

    Morphological and molecular characterization of some cucumber (Cucumis sativus L.) genotypes

    ALAA SAYED IBRAHIM

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    ZiraatIsparta Uygulamalı Bilimler Üniversitesi

    Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. YAŞAR KARAKURT

  3. Kars yöresine ait ata buğdayı Kavılca ve modern ekmeklik buğdaydan hazırlanan un ve ekmeğin fonksiyonel özelliklerinin ve sağlık etkilerinin incelenmesi

    Investigation of the functional properties and health effects of flour and bread prepared from Kavılca wheat grown in Kars and modern bread wheat

    ELİF FEYZA AYDAR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Gıda Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BERAAT ÖZÇELİK

  4. Van havzasında yetişen Asparagus cinsine ait türlerin moleküler karakterizasyonu ve antioksidan aktivitelerinin belirlenmesi

    Molecular characterization and determination of antioxidant activity of the species of the genus Asparagus distributed in Van lake basin

    SERDAR ALTINTAŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    ZiraatSiirt Üniversitesi

    Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. MİNE PAKYÜREK

    PROF. DR. SUAT ŞENSOY

  5. Comparative metabolome and transcriptome analysis of anthocyanin biosynthesis in fig (Ficus carica L.)

    İncir (Ficus carica L.)'de antosiyanin biyosentezinin karşılaştırmalı metabolom ve transkriptom analizi

    GHASSAN ZAHID

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    BiyoteknolojiÇukurova Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. YILDIZ KAÇAR