Trabzon ve Rize illerinde bulunan bazı alabalık işletmelerinde görülen bakteriyel hastalıkların tespiti ve bazı etkenlerinin çoklu PCR ile teşhisi
Bacterial fish diseases in some of the trout farms in Trabzon and Rize and identification of some of their agents by multiplex PCR
- Tez No: 244653
- Danışmanlar: DOÇ. DR. İLHAN ALTINOK
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Balıkçılık Teknolojisi, Fisheries Technology
- Anahtar Kelimeler: Alabalık, bakteri, mevsimsel dağılım, hastalık, PCR, Bakteriyel enfeksiyonlar, Balıkçılık, Trout, bacteria, seasonality, disease, PCR, Bacterial infections, Fisheries
- Yıl: 2009
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Karadeniz Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Balıkçılık Teknolojisi Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Doğu Karadeniz Bölgesi'nde bulunan 34 farklı alabalık işletmesi, 2007 ve 2008 yılları arasında bakteriyel patojenler açısından incelenmiş ve bazı etkenlerinin teşhisi amacıyla çoklu PCR protokolü oluşturulmuştur. Bu amaçla, toplam 558 balık örneklenmiş ve 40 farklı bakteri türü fenotipik olarak izole edilmiştir. Çalışmada yersiniosis, furunkulosis, vibriosis, hareketli Aeromonas septisemi, bakterial soğuk su hastalığı ve Pseudomonas enfeksiyonları kaydedilmesine karşın, Yersinia ruckeri, Aeromonas hydrophila, ve A. salmonicida salmonicida'dan kaynaklanan enfeksiyonların oldukça yoğun olduğu belirlenmiştir. Pseudomonas putida, Flavobacterium psychrophilum ve P. luteola kaynaklı enfeksiyonlara ise nadir olarak rastlanmıştır. Tür çeşitliliğine bakıldığında bakterilerin İlkbahar ve Yaz mevsimlerinde yoğunluk gösterdiği belirlenmiştir. Bakterilerin %50 den daha fazla bir kısmının ampisilin, sepholatin, eritromisin, neomisin, sulfamethokzasol ve tetrasiklin'e karşı dirençli olduğu gözlemlenirken, en etkin antibiyotiklerin oksolinik asit ve florfenikol olduğu belirlenmiştir.Bakteriyel balık patojenleri arasında önemli yeri olan Aeromonas hydrophila, Aeromonas salmonicida, Flavobacterium columnare, Renibacterium salmoninarum ve Yersinia ruckeri'nin aynı anda teşhisine olanak sağlayacak çoklu PCR potokolü oluşturulmuştur. Bu çoklu PCR ptorokolü balıklarda meydana gelen doğal enfeksiyonların teşhisinde başarıyla kullanılmıştır. Fenotipik karakterlerin kullanımına dayalı metotlarla karşılaştırıldığında oluşturulan PCR protokolünün daha hassas olması bu metodun geleneksel teşhis metotlarına alternatif olabileceğini göstermiştir.
Özet (Çeviri)
Thirty four freshwater trout farms, in The Eastern Black Sea Region of Turkey were surveyed seasonally for bacterial pathogens and diseases between 2007 and 2008. And also a multiplex polymerase chain reaction (PCR) method was designed for five pathogens. A total of 558 fish were examined and 40 bacterial isolates were identified phenotypically. Yersiniosis, furunculosis, vibriosis, motile Aeromonas septicemia, bacterial cold water disease, and Pseudomonad infection were recorded. Infections caused by Yersinia ruckeri, Aeromonas hydrophila, A. salmonicida salmonicida, occurred most frequently, but only one and two outbreak of Pseudomonas putida, Flavobacterium psychrophilum and P. luteola infection were recorded, respectively. Most of the bacteria were isolated in spring and summer. Numbers of isolated bacteria were reduced in fall and winter. The disc susceptibility pattern was fairly consistent regardless of geographic areas or year of isolation. Fifty percent or more bacteria were resistant to ampicillin, cephalothin, erythromycin, neomycin, sulfamethoxazole, and tetracycline. The most effective antibiotics were oxolinic acid and florefenicol.A multiplex polymerase chain reaction (PCR) method was designed for the simultaneous detection of the five major fish pathogens, Aeromonas hydrophila, Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida, Flavobacterium columnare, Renibacterium salmoninarum, and Yersinia ruckeri. The multiplex PCR assay was useful for the detection of the bacteria in naturally infected fish. This assay is a sensitive and specific and reproducible diagnostic tool for the simultaneous detection of five pathogenic bacteria that cause disease in fish. Therefore, it could be a useful alternative to the conventional culture based method.
Benzer Tezler
- Doğu Karadeniz Bölgesindeki alabalık kuluçkahanelerinde ve yavru alabalıklarda bazı viral etkenlerin araştırılması
İnvestigation of some viral pathogens in trout hatcheries and juveniles in Eastern Black Sea Region
HÜSEYİN ALP
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
Veteriner HekimliğiMehmet Akif Ersoy ÜniversitesiViroloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. SİBEL HASIRCIOĞLU
PROF. DR. OYA BULUT
- Korunma ve bakım altında bulunan çocukların duygusal zekâ düzeylerinin bazı değişkenler açısından incelenmesi
Examination of the relationship between emotional intelligence and certain variables of children in protection and care
SERAP DENİZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
PsikolojiHaliç ÜniversitesiPsikoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. AYŞEGÜL YETKİN
- Doğu Karadeniz bölgesi'ndeki bazı akarsuların taban malzemeleri arasında bulunan faunanın belirlenmesi üzerine bir çalışma
A study on determination of interstitial fauna of some running waters in Eastern Black Sea region
HÜSEYİN ALİ BOLAT
Yüksek Lisans
Türkçe
2012
BiyolojiHacettepe ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NİLGÜN KAZANCI
- Trabzon Alt Bölgesi (TR90)'nde hazır beton işletmeciliği ve özgü muhasebe işlemleri
Ready mixed concrete management and specific accounting transactions in Trabzon Sub-Region (TR90)
HANDE SALİHOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
İşletmeKaradeniz Teknik Üniversitesiİşletme Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YUSUF SÜRMEN
- Türkiye'nin önemli kivi üretim alanlarındaki kök-ur nematodu (Meloidogyne spp.) türlerinin teşhisi ve bazı türlerin kivideki patojenisitesi üzerine araştırmalar
Research on the identification of root-knot nematode (Meloidogyne spp.) species in important kiwifruit production areas of Türkiye and the pathogenicity of some species on kiwifruit
ANIL FIRAT FELEK