Geri Dön

Farklı staphylococcus suşlarının fenotipik yöntemler, RAPD-PCR ve REP-PCR tiplendirilmesi

Typing of different staphylococcus strains by phenotypic methods, RAPD-PCR and REP-PCR

PDF İndir

  1. Tez No: 244804
  2. Yazar: NESLİHAN SÜRÜCÜ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. NİLÜFER AKSÖZ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Staphylococcus aureus, antibiyotipleme, RAPD-PCR, REP-PCR, Staphylococcus aureus, antibiotyping, RAPD-PCR, REP-PCR
  7. Yıl: 2009
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 93

Özet

Staphylococcus aureus tüm dünyada en önemli hastane kökenli enfeksiyon etkenlerinden biridir. Günümüzde nozokomiyal patojenler arasında öneminin giderek artması, epidemilere yol açabilmesi ve çoklu antibiyotik direncine bağlı tedavi seçeneklerinin kısıtlı olması nedeniyle dünya tıp gündeminin başlarında yer almaktadır. S.aureus suşlarının antibiyotiklere karşı çok kısa zamanda direnç geliştirmesi, Metisiline Dirençli Staphylococcus aureus (Methicillin Resistant Staphylococcus aureus-MRSA) görülme sıklığındaki artışa ve vankomisin dirençliliğinin ortaya çıkmasına neden olmuştur. Bu nedenle tanımlamanın en kısa sürede, hızlı ve güvenilir bir şekilde yapılması gerekmektedir.Bu çalışmada, çeşitli klinik örneklerden izole edilen Staphylococcus aureus suşları ile koagülaz negatif Staphylococcus suşlarının RAPD-PCR (Random Amplified Polimorphic DNA-PCR) ve REP-PCR (Repetitive Extragenic Palindromic-PCR) yöntemi ile tiplendirilmeleri amaçlanmaktadır. Bu amaçla fenotipik yöntemlerle tanımlanan Staphylococcus suşların antibiyotik duyarlılıkları incelenerek antibiyotip grupları oluşturuldu. 46 Staphylococcus suşunda (26 Metisiline Dirençli Staphylococcus aureus, 15 Metisiline Duyarlı Staphylococcus aureus ve 5 Koagülaz Negatif Staphylococcus) 8 farklı antibiyotip grubu belirlendi. Antibiyotiplemenin ardından, bu suşlar RAPD-PCR ve REP-PCR yöntemi kullanılarak tiplendirildi ve elde edilen dendogramlar incelendiğinde, RAPD-PCR ile 10 farklı genotip, REP-PCR ile 16 farklı genotip belirlendi.

Özet (Çeviri)

Staphylococcus aureus is one of the most important nosocomial pathogens all over the world. Nowadays, the increase in the importance of S.aureus among nosocomial pathogens, leading to epidemies and limited antimicrobial treatment makes its place at the top of the world medical agenda. Developing resistance against various antimicrobial agents contributes to wide range in the prevalance of Methicillin Resistant Staphylococcus aureus-MRSA and the emergence of the vancomycin resistance. Hence, rapid and reliable identification of these microorganisms in short term is required.The aim of this study is to identify Staphylococcus aureus and CNS (Coagulase Negative Staphylococcus) isolates isolated from various clinical specimens by using RAPD-PCR (Random Amplified Polimorphic DNA-PCR) and REP-PCR (Repetitive Extragenic Palindromic-PCR). For this purpose, antibiotype groups were generated by the examination of antibiotic susceptibilities of Staphylococcus strains which were identified by using phenotypic methods. Eight different antibiotype groups were assigned in forty-six Staphylococcus strains (twenty-six Methicillin Resistant Staphylococcus aureus, fifteen Methicillin Sensitive Staphylococcus aureus ve five Coagulase Negative Staphylococcus). After antibiotyping, these strains were identified by using RAPD-PCR and REP-PCR methods. When dendograms were analyzed, ten different genotypes were assigned by RAPD-PCR and sixteen different genotypes were assigned by REP-PCR.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    216204

    Klinik izolatlardan elde edilen Staphylococcus aureus suşlarının fenotipik ve genotipik yöntemler ile tanımlanması ve karşılaştırılması

    Identification and comparison of clinical isolate Staphylococcus aureus strains by phenotyping and genotyping methods

    ESRA DENİZ ÜSLÜ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    BiyolojiHacettepe Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. NİLÜFER AKSÖZ

  2. Tez No

    330618

    Klinik örneklerden izole edilen Staphylococcus aureus suşlarının metisilin dirençlilik genlerinin belirlenmesi

    Determination of methicillin resistance genes of Staphylococcus aureus strains isolated from clinical specimens

    ELİF BAYTAROĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    BiyoteknolojiGazi Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ZEHRA NUR YÜKSEKDAĞ

  3. Tez No

    316503

    Diş çürüklerinden staphylococcus aureus izolasyonu ve identifikasyonu

    Identification and isolation of staphylococcus aureus from tooth decay

    NEVRA ÇİNE

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    BiyolojiSinop Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. İSMET BERBER

  4. Tez No

    242805

    Hastane Kökenli MDR-MRSA Suşlarında Protein A Geni ( spa ) Dizi Analizinin Kloanal İlişkinin Tespitindeki Rolü

    The Role of at Klonal Relation Establishing of Sequence Analysis of the Protein A Gene ( spa ) in Hospital Origined MDR-MRSA İsolates

    TANER BOZKURT

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    MikrobiyolojiÇukurova Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FATİH KÖKSAL

  5. Tez No

    242129

    Metisiline dirençli Staphylococcus aureus suşlarının saptanmasında farklı yöntemlerin karşılaştırılması

    Comparison of different methods for the detection of methicillin resistant Staphylococcus aureus

    AYKUT ARAZ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    MikrobiyolojiCelal Bayar Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HÖRÜ GAZİ

Geri Dön