Klinik izolatlardan elde edilen Staphylococcus aureus suşlarının fenotipik ve genotipik yöntemler ile tanımlanması ve karşılaştırılması
Identification and comparison of clinical isolate Staphylococcus aureus strains by phenotyping and genotyping methods
- Tez No: 216204
- Danışmanlar: PROF.DR. NİLÜFER AKSÖZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Tıbbi Biyoloji, Biology, Biotechnology, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Staphylococcus aureus, RAPD-PCR, UPGMA, Staphylococcus aureus, RAPD-PCR, UPGMA
- Yıl: 2007
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 104
Özet
Nozokomikal enfeksiyon etkeni olarak Metisilin Dirençli Staphylococcus aureus (Methicillin Resistant Staphylococcus aureus-MRSA) görülme sıklığındaki artış ve vankomisine dirençliliğin oluşması izolat karakterizasyonunun hızlı ve güvenilir bir şekilde yapılmasını ve hastanelerde klonal yayılımın tanımlanmasını gerektirmektedir. Bu çalışmanın amacı, klinik izolatlardan elde edilen Staphylococcus aureus suşlarına ait RAPD bant modellerindeki varyasyonu ve bunlar arasındaki sistematik ilişkiyi ortaya çıkarmaktır. Klinik izolatlara disk difüzyon metodu kullanılarak antibiyotik duyarlılıklarına bakıldı. Bütün izolatlar vankomisine duyarlı bulundu. Bu çalışmada; MSSA için 6 (iki baskın tip-%29.4) ve MRSA için 8 (bir baskın tip-%26.6) farklı antibiyotip paterni belirlendi. 47 S.aureus ve kontrol olarak S.aures ATCC 29213, S.epidermidis ve S.saprophyticus 25 farklı primer ile rastgele çoğaltılmış polimorfik DNA (RAPD) PCR tekniği kullanılarak analiz edildi. Tüm veriler ile UPGMA metodu kullanılarak dendogram çizildi. Rastgele seçilmiş 25 primerden 15'i informatif bulundu. Buna ek olarak; RAPD PCR metodu ile izolatlar MRSA ve MSSA olmak üzere ayrılmıştır. İzolatlardaki genetik uzaklık 0.1142'den 0.9565'ye değişen aralıktadır. Çalışmadan elde edilen veriler bize izolatların antibiyotip paternleri ile RAPD paternlerinin birbiri ile benzer olduğunu göstermektedir.
Özet (Çeviri)
The increase in the frequency of Methicillin Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) as the causal agent of nosocomial infection and the possibility of emergence of resistance to vancomycin demands a quick and trustworthy characterization of isolates and identification of clonal spread within hospitals. The objective of this study is to establish variations of RAPD band patterns in Staphylococcus aureus strains which are collected from clinical isolates and its systematic relationship between them. Antimicrobial susceptibility tests of clinical isolates were performed by the disc diffusion method. All the isolates were susceptible to vancomycin. In this study different antibiotype patterns were determined; 6 for MSSA (with two dominant patterns-%29.4) and 8 for MRSA (with one dominant pattern-%26.6). Randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) PCR method with 25 different primers was analysed on 47 clinical isolates of Staphylococcus aureus and S.aures ATCC 29213, S.epidermidis and S.saprophyticus as controls. All the data were employed to construct dendrograms using the UPGMA. Randomly selected 15 primers were informative out of 25. In addition, RAPD PCR method differentiated between MRSA and non-MRSA based on the clustering.The overall genetic distances ranged from 0.1142 to 0.9565 among the isolates. These data suggested that the antibiotype patterns of the isolates were identical to RAPD patterns.
Benzer Tezler
- Metisilin dirençli staphylococcus aureus üremesi tespit edilen çocuk hastaların, klinik, epidemiyolojik özellikleri ve vankomisin heterojen ve vankomisin orta duyarlı izolatların klinik yansımaları
Clinical and epidemiological characteristics of children with methicillin-resistant staphylococcus aureus and clinical reflections of vancomycin heterogeneous and vancomycin intermediate staphylococcus aureus
ASLI TURGUTOĞLU YILMAZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2016
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıHacettepe ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ATEŞ KARA
- Staphylococcus aureus suşlarının metisiline duyarlığının belirlenmesinde oksasilin ve sefoksitin disk yöntemlerinin özgüllük ve duyarlılıklarının saptanması
Finding out the specifity and susceptibility of the oxacilin and cephoxitin disc methods in determining the staphylococus aureus strains susceptibility to methicilline
ÖZLEM YÜKSEL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2005
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıAnkara ÜniversitesiKlinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF.DR. HALİL KURT
- Klinik örneklerden izole edilen staphylococcus aureus suşlarının antibiyotiklere direnç oranlarının araştırılması
Investigation of antibiotic resistance rates of staphylococcus aureus strains isolated from clinical samples
ZEHRA VARIŞ KARAKAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
MikrobiyolojiBolu Abant İzzet Baysal ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUSTAFA BEHÇET
- Piyasada satışa sunulan peynirlerden elde edilen jenerik Escherichia coli ve Staphylococcus aureus suşlarının antibiyotik dirençliliklerinin belirlenerek, mastitis kontrol ve tedavi programlarında kullanılan antibiyotiklerle ilişkisinin belirlenmesi
Antibiotic resistance of generic Escherichia coli and Staphylococcus aureus isolated from cheese samples sold in retail markets and correlation between antibiotics used as preventative and therapeutic measures in mastitis
CAN ATABEY
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
Besin Hijyeni ve TeknolojisiAdnan Menderes ÜniversitesiBesin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ERGÜN ÖMER GÖKSOY
- Staphylococcus aureus izolatlarında antibiyotik duyarlılığının belirlenmesi
Determination of antibiotic susceptibility of Staphylococcus aureus strains
TAHA SELÇUK
Yüksek Lisans
İngilizce
2018
MikrobiyolojiErzincan Binali Yıldırım ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ AYTEKİN ÇIKMAN