Çukurova bölgesindeki Trichogramma türlerinin (Hymenoptera, Trichogrammatidae) teşhisinde moleküler yöntemlerin kullanımı
Usage of molecular techniques for identification of Trichogramma species (Hymenoptera, Trichogrammatidae) in Çukurova region
- Tez No: 246114
- Danışmanlar: PROF. DR. AYDIN Ş. TUNÇBİLEK
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2009
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Erciyes Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 141
Özet
Çukurova Bölgesindeki farklı lokalitelerinden toplanan Trichogramma örnekleri rDNA'nın ITS2 dizisine göre teşhis edilmiş ve örneklerin T. turkestanica (Meyer, 1940), T. brassicae (Bezdenko, 1968) ve T. euproctidis (Girault, 1911) olmak üzere üç tür içerdiği belirlenmiştir. ITS2 nükleotit dizilerindeki farklılıklar ve genetik uzaklık UPGMA yöntemi ile hesaplanmış ve buna göre örnekler iki ana gruba ayrılmıştır. T. turkestanica türleri arasındaki genetik uzaklık % 0-0,531 arasında değişirken, T. brassicae için % 0-0,750, T. euproctidis için % 0,565 olarak hesaplanmıştır. Türler arası genetik uzaklık ise % 4,388 ile % 6,934 arasında değişmektedir. ITS2 dizi analizi sonucu T. turkestanica ve T. brassicae olduğu belirlenen kültürler arasında çaprazlama denemeleri kurulmuş ve farklı tür olduğu bilinen örnekler arasında yapılan çaprazlama sonucunda F1'de elde edilen bireylerin tamamının erkek olduğu bulunmuştur. Çalışmamızda ITS2 bölgesinden başka rDNA'nın 28SD2 bölgesi ile mitokondriyal COI bölgelerinin dizi analizinin Trichogramma türlerinin ayırt edilmesinde kullanılabilirliği araştırılmıştır. T. turkestanica'ya ait örneklerin D2 bölgesi 522 bç, COI bölgesi 669 bç iken T. brassicae'ye ait olanların D2 bölgesinin 530 bç, COI bölgesinin 672 bç olduğu belirlenmiştir. Bu iki tür arasındaki genetik uzaklık COI dizisine göre % 1,047, D2 dizisine göre % 3,439 iken, ITS2 dizisine göre % 6,012 ile % 6, 934 arasında değişmektedir. Ayrıca tür içi ve türler arası farklılıkları belirlemek için 50 farklı RAPD primeri denenmiş ve bunlardan 6 tanesi ayırt edici bant vermiştir. RAPD primerlerinden elde edilen bantlara göre örneklerin arasındaki genetik uzaklık hesaplanmış ve bu uzaklıkların % 0,05 ile % 79,85 arasında değiştiği belirlenmiştir.Bu çalışmada moleküler belirteçler kullanılarak biyolojik mücadelede oldukça önemli bir doğal düşman olan Trichogramma türlerinin moleküler teşhisi ve karakterizasyonu sağlanmıştır. Kullanılan moleküler belirteçler içerisinde ITS2'nin ayırt edici ve güvenilir sonuçlar sağladığı tespit edilmiştir.
Özet (Çeviri)
In this study, Trichogramma species were collected from different locations of Çukurova and identified by using the sequence of rDNA-ITS2. It was found that all samples were belonging to T. turkestanica, T. brassicae and T. euproctidis. Nucleotide sequence diversity was calculated by using UPGMA analysis. According to the analysis the samples were separated in two main groups. The genetic distances were calculated as in the range of 0-0,531 % for T. turkestanica, 0-0,750 % for T. brassicae and. 0,565 % for T. euproctidis species. The range of genetic distances were found between 4,388 % and 6,934 % for different species. Only males were obtained, after reciprocal crossing with T. turkestanica and T. brassicae species. We also used 28SD2 region of rDNA and mitochondrial COI region for identification of Trichogramma species. 28SD2 and COI sequences were distinct in size, 522 bp and 669 bp for T. turkestanica and 530 bp and 672 bp for T. brassicae, respectively. While the genetic distances between the species were calculated to be 3,439% and 1,047% for 28SD2 and COI, respectively, these values for ITS2 were between 6,012 % and 6,934 %. Among 50 different RAPD primers used for determining diversities between species, six primers showed distinctive bands. The banding patterns were compared with each other and the genetic distances of samples were found in the range of 0,05% to 79,85%. In conclusion, molecular identification of Trichogramma was provided and ITS2 marker was found to be the best distinguishing and reliable one among the markers that was used in this study.
Benzer Tezler
- Çukurova bölgesinde mısır zararlısı Ostrinia nubilalis hübner (Lepidoptera;pyralidae)'ın doğal düşmanlarının saptanması ve yumurta parazitoidi, Trichogramme evanescens westwood (Hymenoptera; Trichogrammatidae) ile arasındaki ilişkilerin araştırılması
Determination of the naturel enemies of D. nubilalis hübner (Lepidoptera;pyralidae)in the Çukurova region of Turkey, and investigation of the relationships between the egg parasitiod, Trichogramme evanescens ...
ALİ KAYAPINAR
- Çukurova bölgesindeki kadınlarda genital human papillomavirus infeksiyon prevalansı
The prevalence of genital human papillomavirus infection among women in çukurova region
ZAFER ALTUN
Doktora
Türkçe
2009
MikrobiyolojiÇukurova ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FÜGEN YARKIN
- Çukurova Bölgesindeki akciğer tüberkülozlu hastaların mononükleer hücrelerindeki mikrorna düzeylerinin incelenmesi
Detection of microrna levels in mononuclear cells from patients with pulmoner tuberculosis in Çukurova Region
FIRAT KARSLI
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
MikrobiyolojiÇukurova ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATİH KÖKSAL
- Çukurova bölgesindeki yağ sanayi işletmelerinin ekonomik ve yönetsel sorunları
Economical and management problems of oil industry organizations in Çukurova region
FAHRİ KURTAY
- Çukurova bölgesindeki okul çağı cocuklarında allerjik hastalıkların prevalansı ve etkileyen faktörler
Başlık çevirisi yok
İBRAHİM BAYRAM
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1998
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıÇukurova ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEVAL GÜNEŞER KENDİRLİ