Geri Dön

Biyolojik aktif bazı maddelerin teorik olarak incelenmesi

A theoretical study on the biologically active some substances

  1. Tez No: 256000
  2. Yazar: HAVA EYDEMİR
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. TEMİR ALİ DEMİR
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyokimya, Biochemistry
  6. Anahtar Kelimeler: pürin katabolizması, hipoksantin, ürik asit, tautomerizm, Se atomu, HF(Hartree-Fock), DFT, Purin catabolism, hypoxanthine, uric asid, tautomerism, Selenium atoms, HF(Hartree-Fock), DFT
  7. Yıl: 2010
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Eskişehir Osmangazi Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Biyokimya Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 148

Özet

Bu çalışmada biyolojik aktif olan, pürin katabolizmasında önemli rolleri bulunan adenozin, guanozin, guanin, inozin, hipoksantin, ksantin ve ürik asit teorik olarak incelendi.Moleküllerin gaz, su ve kan fazında, fiziksel ve termodinamik özellikleri ile yapısal parametreleri Gaussian 03W programında Hartree-Fock (HF) metodu ve Yoğunluk Fonksiyonu Teorisi (DFT/B3LYP) hibrit yaklaşımı ile 6-31G(d,p) ve 6-31+G(d,p) temel setleri kullanılarak hesaplandı.Yapılan hesaplamalarda çalışılan moleküllerin yapılarını aydınlatmak için bağ uzunlukları, bağ açıları, dihedral açıları, dipol moment, en yüksek dolu moleküler orbital (HOMO), en düşük boş moleküler orbital (LUMO) enerjileri, nükleofilite(?) ve serbest enerji (?G) değerleri HF ve DFT metotları ile hesaplandı. Elde edilen sonuçlara göre herbir molekül için en kararlı tautomer bulundu. Sonra bu kararlı tautomerlere Se atomu bağlandı. Tekrar serbest enerji (?G) değerleri kontrol edildi Sonuçta ürik asit miktarını kontrol etmek için, bizim çalışmamızda bulunan sonuçlara göre, Se atomunun bağlanması gereken en uygun molekülün hipoksantin olduğu saptandı.Bu hesaplamalarda DFT yöntemi HF yöntemine göre daha başarılı bulundu.

Özet (Çeviri)

In this study, some biologically active substances which plays important roles of adenosine, guanosine, guanin, inosine, hypoxanthine, xanthine and üric asid in the purins catabolism were investigated theoretically.Gas, liquid and blood phase, structural parameters along with physical and thermodynamic properties of the studied molecules were calculated using Hartree-Fock (HF) and Density Function (DFT/B3LYP) methods with hybrid approach and 6-31G(d,p) basis set.In the present work structural parameters such as bond lenths, bond angles, dihedral angles and dipole moments, HOMO(Highest Occupied Molecular Orbital), LUMO(Lowest Unaccupied Molecular Orbital) energies; nükleofilite(?) and free energy (?G) values studied using B3LYP/6-31G(d,p) and HF/6-31G(d,p) methods. According to result for each molecule the most stable tautomer found. Then Se atoms determined to tautomers linked. Free energy (?G) values were checked again. As a result, to control the amount of uric acid, which result in our study, according to the most appropriate to connect the Se atoms of the molecule were identified as hypoxanthine.That HF calculations according to the method of DFT methods were more successful.

Benzer Tezler

  1. Bazı biyolojik aktif bileşiklerin moleküler yapılarının ve spektroskopik özelliklerinin deneysel ve teorik yöntemler ile incelenmesi

    Study of the molecular structure and spectroscopic properties of some biologically active compounds with experimental and theoretical methods

    EBRU KARAKAŞ SARIKAYA

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Fizik ve Fizik MühendisliğiSelçuk Üniversitesi

    Fizik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÖMER DERELİ

  2. Hastane ve medikal laboratuvarı atıksularının membran biyoreaktör (MBR) ile farklı koşullarda arıtılması: İlaç etken madde giderim performansının ve akut inhibisyon etkisinin incelenmesi

    Treatment of hospital and medical laboratory wastewater under different conditions by membrane bioreactor (MBR): Investigation of removal performance of pharmaceuticals and acute inhibition effect

    RECEP PARTAL

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Çevre MühendisliğiSüleyman Demirel Üniversitesi

    Çevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NEVZAT ÖZGÜ YİĞİT

    DOÇ. DR. SELDA MURAT HOCAOĞLU

  3. Bazı biyolojik aktif moleküllerin yapılarının araştırılması

    Investigation on molecular structures of some biologically active molecules

    ERSİN DURGUT

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Fizik ve Fizik MühendisliğiSelçuk Üniversitesi

    Fizik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYHAN ÖZMEN

    PROF. DR. ÖMER DERELİ

  4. Biogas recovery during anaerobic treatment of lignocellulose-rich pollutants with high sulphate content: an investigation via innovative applications

    Yüksek sülfat içerikli lignoselüloz bakımından zengin kirleticilerin havasız arıtımı sırasında biyogaz geri kazanımı: yenilikçi uygulamalarla bir araştırma

    EDA YARSUR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2021

    Çevre Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Çevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÇİĞDEM GÖMEÇ

  5. Ortaöğretim kurumlarının diğer örgütlerle ortakyaşar ilişkileri

    The symbiotic relationship between secondary school and the other organizations

    ELİF GAMZE ÖZCAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Eğitim ve ÖğretimHacettepe Üniversitesi

    Eğitim Bilimleri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ŞEFİKA ŞULE ERÇETİN