Nohut yanıklık etmeni Ascochyta rabiei (Pass.) Labr.'nin patotiplerinin moleküler yöntemlerle belirlenmesi
Determination of pathotypes of Ascochyta rabiei (Pass.) Labr. causing chickpea blight by molecular techniques
- Tez No: 258747
- Danışmanlar: PROF. DR. SARA DOLAR
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Nohut, Ascochyta rabiei, genetik farklılık, RAPD, ISSR, Chickpea, Ascochyta rabiei, genetic diversity, RAPD, ISSR
- Yıl: 2009
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 72
Özet
Ascochyta rabiei (Pass.) Labr., (eşeyli dönem, Didymella rabiei (Kov.) v. Arx)'nin neden olduğu Ascochyta yanıklığı dünyada olduğu gibi ülkemizde de nohut üretimini kısıtlayan en önemli hastalıklardan biridir. Bu sebeple Türkiye'nin farklı bölgelerine ait 18 ili temsil eden A. rabiei patotipleri arasındaki genetik farklılıklar 54 RAPD ve 30 ISSR primeri kullanılarak incelenmiştir. Elde edilen verilerin Dice'ın benzerlik katsayısı kullanılarak yapılan UPGMA cluster analizi sonucunda 81 A. rabiei izolatı RAPD analizine göre 6 grup, ISSR analizine göre ise 4 grup içerisinde sınıflandırılmıştır. Ancak izolatların patotip ve bölgelere göre dağılımı ile dendrogramdaki gruplanmaları arasında herhangi bir ilişki tespit edilememiştir. İzolatların populasyon yapısı incelendiğinde en yüksek gen farklılığının İç Anadolu bölgesinde (0.1992), en düşük farklılığın ise Akdeniz bölgesinde (0.1574) olduğu görülmüştür. Moleküler varyans analizi (AMOVA) sonucunda populasyonlar arasında tespit edilen genetik varyasyonun büyük bir kısmının (%98.34) izolatlar arasındaki genetik farklılardan, çok küçük bir kısmının ise populasyonlar arasındaki coğrafik farklılıklardan kaynaklandığı tespit edilmiştir. Farklı bölgelere ait A.rabiei izolatları arasında görülen yüksek gen akışı (5.45) ve genetik farklılıklar değerleri ise seksüel rekombinasyonların bu patojendeki genetik farklıların artışında rol oynadığını göstermiştir.
Özet (Çeviri)
Ascochyta blight, caused by Ascochyta rabiei (Pass.) Labr., (teleomorph, Didymella rabiei (Kov.) v. Arx) is one of the most important diseases decreasing to chickpea production in Turkey and worldwide. Thus, genetic diversity among pathotypes of A. rabiei belonging to 18 different provinces of Turkey was assessed using 54 RAPD and 30 ISSR primers. UPGMA cluster analysis based on Dice?s coefficient clustered 81 isolates of A. rabiei into 6 and 4 major groups by RAPD and ISSR analysis, respectively. However, no correlation was found between the pathotypes and geographically distribution of these isolates and their grouping in dendrograms. Population analysis showed that the highest genetic variation occured in Central Anatolia region (0.1992) while the lowest variation was in Mediterranean region (0.1574). Analysis of molecular variance (AMOVA) confirmed that most genetic variability (%98.34) among populations resulted from differences among isolates while a relatively low proportion of the genetic variability was attributable to geographical differences among populations. High gene flow and genetic differentiation values among A. rabiei isolates from different provinces indicated that sexual recombination had a significant effect on increasing the genetic variability of this pathogen.
Benzer Tezler
- Nohutta iri daneli, çift baklalı ve markör destekli seleksiyonla yanıklık [Ascochyta rabiei Pass. (Labr.)] hastalığına dayanıklı ideal bitki ıslahı
Ideotype breeding in kabuli chickpea: extra large-seeded, double-podded and resistant to ascochyta blight [Ascochyta rabiei Pass. (Labr.)] via marker assisted selection
TUBA EKER
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
ZiraatAkdeniz ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. CENGİZ TOKER
- Nohut yanıklık etmeni Ascochyta rabiei izolatları arasındaki genetik farklılığın iPBS VE SCoT DNA markörleri ile incelenmesi
Investigation of genetic differences between chickpea blight agent ascochyta rabiei isolates with iPBS and SCoT DNA markers
MEHMET ALPEREN SERTKAYA
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
ZiraatBolu Abant İzzet Baysal ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÖKSEL ÖZER
- Ülkemizdeki tescilli nohut çeşitleri ile bazı uluslararası ıslah hatlarının nohut yanıklık etmeni Ascochyta rabiei'ye karşı dayanıklılık durumunun markör destekli seleksiyon ve klasik reaksiyon testleri ile belirlenmesi
Determination of the resistance to chickpea blight caused by Ascochyta rabiei in national registered chickpea genotypes and some international breeding lines by marker-assisted selection and classical reaction tests
HÜSEYİN KABAKCI
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
BiyoteknolojiBolu Abant İzzet Baysal ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GÖKSEL ÖZER
- Yabani nohutlarda (Cicer spp.) ascochyta yanıklık etmeni didymella rabiei'nin patojenik karakterizasyonu ve eşey tipi analizleri
Pathogenic characterisation and mating type analses of ascochyta blight agent, didymella rabiei, isolated from wild cicer spp
SELÇUK BAŞBUĞA
- İç Anadolu bölgesinde nohutta yanıklık hastalığına neden olan Didymella rabiei'nin patojenik karakterizasyonu ve eşey tipi analizleri
Pathogenic characterization and mating type analysis of Didymella rabiei causing ascochyta blight of chicpea in the Central Anatolia region
NAGİHAN ŞAHİN