Intraspecific mtDNA variation and phylogenetic structure of the gall wasp Andricus quercustozae (Hymenoptera: Cynipidae)
Mazı arısı Andricus quercustozae (Hymenoptera:Cynipidae)'nin tür içi mtDNA varyasyonu ve filogenetik yapısı
- Tez No: 259431
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. SERAP MUTUN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2010
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Abant İzzet Baysal Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 77
Özet
Bu çalışmada ülkemizde bulunan Andricus quercustezae'nin tür içi mitokondrial DNA varyasyonu ve bu türün haplotipleri arasındaki filogenetik ilişki PCR-RFLP yöntemi kullanılarak çalışılmıştır. Mitokondriyal DNAnın 2540 baz çiftlik ND4, ND4L, tRNAThr, tRNAPro, ND6, cyt b gen bölgelerini içeren bir kısmı ile 1800 bazlık ATPases (6, 8) ve COIII bölgeleri çoğaltılarak elde edilen PCR ürünleri sırasıyla HindIII ve HinfI, HaeIII, HindIII, EcoRI ile kesilmiştir. Onaltı populasyondan toplanan 95 bireyde toplam 28 haplotip bulunmuştur. Çalışılan türün populasyon içi ortalama haplotip ve nükleotid çeşitliliği sırasıyla 0.45 ve 0.05 olarak hesaplanmıştır. Çalışılan mazı arısı populasyonlarında A.quercustozae haplotipleri arasındaki en yüksek nükleotid farklılaşması %9.0 olarak bulunmuştur.Haplotipler arasındaki filogenetik ilişkileri belirlemek için kullanılan PHYLIP programı sonucu elde edilen dendrogram haplotiplerin coğrafi dağılımları ile bu haplotiplerin gruplanmaları arasında anlamlı bir korelasyonun olduğunu ortaya koymuştur. Genetik farklılaşmanın farklı hiyerarşik düzeylerdeki dağılımını belirlemek için uygulanan AMOVA analizleri istatistiksel olarak oldukça yüksek oranda desteklenmiştir. Varyans analizi en fazla çeşitliliğin grup içinde (%38), buna takiben populasyonlar içinde (%35) ve gruplar arasında (%25) olduğunu ortaya çıkarmıştır. Bu çalışma genel olarak ülkemizde farklı populasyonlarda bulunan meşe mazı arısı haplotiplerinin oldukça fazla bir genetik çeşitliliğe sahip olduğunu ve belirgin coğrafik bir şekilde grup oluşturduklarını ortaya koymuştur. Ayrıca meşe mazı arısı populasyonlarının mevcut populasyon genetik yapılarının şekillenmesinde ülkemiz topoğrafyasının önemli bir rol oynadığı sonucuna varılmıştır.
Özet (Çeviri)
Intraspecific mitochondrial DNA variation and phylogenetic relationships of Andricus quercustozae haplotypes from Turkey was studied using PCR-RFLP method. An 2540 base pair mitochondrial DNA region covering ND4, ND4L, tRNAThr, tRNAPro, ND6, cyt b gene and a second 1800 base pair fragment comprising the ATPases (6, 8) and COIII amplified by PCR were digested with restriction enzymes including HindIII and HinfI, HaeIII, HindIII, EcoRI, respectively. A total of 28 haplotypes were detected among 95 individuals collected from 16 populations. The estimated average haplotype and nucleotide diversity within populations were 0.45 and 0.05, respectively. The highest nucleotide divergence estimate among the analyzed oak gall wasp populations was 9.0% indicating an ancient split between A. quercustozae haplotypes.Dendrogram obtained using PHYLIP program depicting the phylogenetic relationships of haplotypes indicated that there was a significant relationship between geographical distribution of haplotypes and their clustering. AMOVA analysis for estimation of the partitioning of genetic differentiation at different hierarchical levels was statistically significant. Analysis of variance revealed the highest genetic variance (38%) was present within groups, a significant partitioning of variance (25%) was found among groups and an intermediate level of variance was present within populations (35%).Overall, the present study indicates that the oak gall wasp haplotypes found in different populations of A. quercustozae have significant amount of genetic diversity and they form geographically significant groupings. It can also be concluded that varied topography of Turkey plays an important role in shaping the current population genetic structure of the oak gall wasp species.
Benzer Tezler
- Identification of Colchicum L. species of Turkey's flora by sequence analysis of nrDNA its region
Türki̇ye florasına ai̇t Colchi̇cum L. türleri̇ni̇n nrDNA its bölgesi̇ di̇zi̇ anali̇zleri̇ i̇le beli̇rlenmesi̇
SEREN METE
Yüksek Lisans
İngilizce
2015
BiyomühendislikMarmara ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AHU ALTINKUT UNCUOĞLU
- Brassica türleri (Brassica oleracea L. X Brassica rapa L.) arasında melezleme yoluyla lahana kök uru (Plasmodiophora brassica Wor.)'na karşı dayanıklı hatların geliştirilmesinde embriyo kültür tekniğinin kullanım olanakları
Posibility of use embryo culture tekniqu to improvement resistanced lines agains to Plasmodiophora brassica Wor. via interspesific hybridisation between brassica species (Brassica oleracea L. X Brassica rapa L.)
AYTEN DEMİR
- Kabak anaç çeşit adaylarının aşılı mini karpuz yetiştiriciliğinde değerlendirilmesi
The evaluation of local pumpkin rootstocks candidates in the grafted mini watermelon cultivation
BELKIS GÜNGÖR
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
ZiraatOndokuz Mayıs ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AHMET BALKAYA
- Çamlık ve Cimil Deresi (İkizdere/Rize) çevresinin briyofit florası
The bryophyte flora of around Çamlık and Cimil stream (İkizdere/Rize)
SAVAŞ EKŞİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
BiyolojiRecep Tayyip Erdoğan ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. VAGİF ATAMOV
DOÇ. DR. NEVZAT BATAN
- Eurygaster maura (L.) (Heteroptera:Scutelleridae)'nın metatorasik koku bezi salgısı, yumurta kalitesi ve buğday tarlalarındaki bazı yabancı otların ekstraktlarının yumurta parazitoiti Trissolcus semistriatus (Nees) (Hymenoptera:Scelionidae'a etkileri
Effects of metathoracic scent gland secretion and egg quality of Eurygaster maura (L.) (Heteroptera:Scutelleridae) and some weed extracts in wheat fields on egg parasitoid, Trissolcus semistriatus (Nees) (Hymenoptera:Scelionidae)
EKREM ÖGÜR