Geri Dön

Molecular mechanisms of boron toxicity and identification of boron metabolism genes

Bor toksisitesinin moleküler mekanizmaları ve bor metabolizması genlerinin tanımlanması

PDF İndir

  1. Tez No: 266610
  2. Yazar: İREM ULUIŞIK
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. AHMET KOÇ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2010
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
  10. Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 50

Özet

Bor bitkiler için esansiyel bir mikrobesin olmasının yanında hayvanlar için de yararlı ya da gerekli olabilmektedir. Bugüne kadarki çalışmalar bor metabolizması ile ilgili çok az geni ortaya çıkarmıştır ve borun hücre içerisine nasıl taşındığı ve hücresel metabolizmada nasıl kullanıldığı hala bilinmemektedir. Bu çalışmada bor metabolizmasında rol oynayan genlerin bulunması amacıyla maya haploid delesyon mutantlarından oluşan bir set taranmış ve 6 mutant bor dirençli ve 21 mutant da bora karşı duyarlı bulunmuştur. Bor muamelesi ATR1 ifadelenmesini ve GCN4'e bağlı olarak genel amino asit kontrol mekanizması tarafından düzenlenen çoğu genin ifadelenmesini aktive etmiştir. Polizom analizleri ve 35-S metiyonin işaretlemesi denemeleri borun protein sentezini inhibe ettiğini göstermektedir. Protein sentezinin inhibisyonu aynı zamanda, eIF2? translasyon faktörünün bor ile muamele edilmiş hücrelerde fosfatlanmasıyla doğrulanmıştır ve eIF2?'nın fosforilasyonunun Gcn2 kinazının yüksüz tRNA bağlanma bölgesi ile ilişkili olduğu gösterilmiştir. Sonuç olarak, bor metabolizması ile alakalı pek çok gen ve yolak aydınlatılmıştır ve bor toksisitesi ile translasyonel kontrol arasında bir bağ olabileceği öne sürülmüştür.

Özet (Çeviri)

Boron is an essential micronutrient for plants and it is either necessary or beneficial for animals. Studies identified only few genes related to boron metabolism thus far and details of how boron is imported into cells and used in cell metabolism are largely unknown. In this study, in order to identify genes that play role in boron metabolism, the entire set of yeast haploid deletion mutants was screened and 6 boron resistant and 21 boron sensitive mutants were identified. Boron treatment activated the expression of ATR1 and many genes that are regulated by genereal amino acid control in a GCN4 dependent manner. Polysome analyses and 35-S methionine labelling assays suggested that boron inhibits protein synthesis. Inhibition of protein synthesis was also confirmed by the phosphorylation of translation factor eIF2? in boron treated cells, and phosphorylation of eIF2? was totally dependent on the uncharged tRNA binding domain of Gcn2 kinase. Overall, our results revealed many genes and pathways related to boron stress response and suggest a possible link between boron toxicity and translational control.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    883925

    Kanser tedavisi için potansiyel polo-benzeri kinaz 1 (plk1) inhibitörlerinin hesaplamalı yaklaşımlar ile belirlenmesi ve plk1 protein hedefinin biyomoleküler etkileşimleri

    Identification of potential polo-like kinase 1 (plk1) inhibitors for cancer therapy by computational approaches, and biomolecular interactions of polo-like kinase 1 (plk1) protein target

    GÜLCE DAVUTLAR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    BiyofizikÇanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi

    Tıbbi Sistem Biyolojisi Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ FERAH CÖMERT ÖNDER

  2. Tez No

    304934

    Microarray based expression profiling of barley under boron stress and cloning of 3H boron tolerance gene

    Bor stresi altında arpa gen ifade profillerinin mikrodizi analizi ile belirlenmesi ve 3H bor tolerans geninin klonlanması

    MEHMET TUFAN ÖZ

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2012

    BiyoistatistikOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FÜSUN EYİDOĞAN

    PROF. DR. HÜSEYİN AVNİ ÖKTEM

  3. Tez No

    837769

    Bor toksisitesine yanıt olarak bor toleranslı Triticum urartu genotipinin transkriptomik analizi

    Transcriptomic analysis of the boron tolerant Triticum urartu genotype in response to boron toxicity

    GÜL SEMA UYAR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    ZiraatSelçuk Üniversitesi

    Toprak Bilimi ve Bitki Besleme Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ MOHD KAMRAN KHAN

  4. Tez No

    482351

    Identification of the genes responsible for boron uptake, transport and detoxification in black poplar

    Karakavakta bor alımı taşınması ve detoksifikasyonundan sorumlu genlerin tanımlanması

    SENEM UYLAŞ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2017

    BiyomühendislikGaziosmanpaşa Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. KUBİLAY YILDIRIM

  5. Tez No

    405204

    Puccinellia distans (Jacq.) Parl.'da boron hiperakümülasyonu ve tolerans mekanizmalarinin proteomiks yaklaşim kullanarak anlaşilmasi

    Elucidation of boron hyperaccumulation and tolerance mechanisms in Puccinellia distans (Jacq.) Parl. using proteomics approach

    CANTUĞ BAR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2015

    Biyolojiİzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ANNE FRARY

Geri Dön