Türkiye'deki bazı yerli keçi ırklarında mikrosatellit polimorfizminin belirlenmesi
Determination of microsatellite polymorphism in some native turkish goat breeds
- Tez No: 267071
- Danışmanlar: PROF. DR. OKAN ERTUĞRUL
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Genetik, Veteriner Hekimliği, Zooloji, Genetics, Veterinary Medicine, Zoology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2010
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 235
Özet
Bu çalışmada; Türkiye'ye özgü 5 yerli keçi ırkının (Ankara Keçisi (n=50), Kilis Keçisi (n=51), Honamlı Keçisi (n=49), Kıl Keçisi (n=52) ve Norduz Keçisi (n=49) 20 mikrosatellit belirteci ile genetik çeşitliliklerinin belirlenmesi amaçlanmıştır.Bu çalışmada kullanılan yerli keçi ırklarında 20 mikrosatellit belirtecine ait yapılan analizler sonucunda; lokus başına düşen ortalama allel sayısının (15.65 allel / lokus) ve heterozigotluk düzeylerinin (0.5192 ile 0.9400 arasında) oldukça yüksek olduğu belirlenmiştir.İncelenen ırklara ait Fıs değerlerinin; 0.01621 ile 0.04951 arasında değiştiği saptanmıştır ve bu değerler tüm populasyonlarda sıfıra oldukça yakın bulunmuştur. Ancak bu değerler sadece Ankara ve Kilis Keçisinde istatistiki olarak önemli bulunmuştur ki bu ırklarda düşük düzeyde heterozigot azlığı olduğu söylenebilir. Tüm populasyonlar için hesaplanan genel Fıs değeri 0.03656'dır. Çalışılan populasyonlardan elde edilen genel Fıs değeri sıfıra yakın olduğu için populasyonların Hardy Weinberg dengesinde olduğu belirlenmiştir. Fst değerlerine göre; Ankara Keçisi ile diğer ırklar arasında orta düzeyde bir farklılaşma varken, diğer ırkların birbirleri arasında az bir genetik farklılaşmanın olduğu belirlenmiştir ve bu farklılaşma istatistiki olarak önemli bulunmuştur.Bu araştırmada; allelik varyasyon analizi ve heterozigotluk analizi, F istatistikleri, AMOVA, Genetik Yapı Testi, Faktöriyel Benzerlik Analizi, Allel Paylaşım Uzunluklarının Ölçümü gibi analiz metodlarının sonuçlarına göre; Ankara Keçisi ırkının diğer ırklardan ayrı gruplandığı, fakat diğer yerli keçi ırklarının (Kilis Keçisi, Honamlı Keçisi, Kıl keçisi ve Norduz Keçisi) birbirlerinden kesin olarak ayrılamadığı ve bu ırklara ait örneklerin birbirleri ile genel olarak aynı yerde gruplandığı görülmüştür. Bu çalışmada kullanılan hiçbir ırkın yok olma tehlikesi ile karşı karşıya kalmadığı belirlenmiştir.Çalışmada kullanılan belirteçlerin genel anlamda oldukça polimorfik oldukları belirlenmiştir. Bu nedenle; çalışmada kullanılan belirteçler genetik karakterizasyon çalışmalarında oldukça kullanışlıdır ve genetik çeşitliliğin belirlenmesinde tercih edilebilirler.Elde edilen tüm sonuçlar birlikte değerlendirildiğinde; 20 mikrosatellit lokusundan elde edilen verilerle yapılan analiz sonuçlarına göre; Ankara Keçisi hariç; fenotipik olarak o ırka ait olan yerli ırklar, genetik olarak birbirlerinden kesin olarak ayrılamamıştır.
Özet (Çeviri)
The aim of the present study was to determine genetic diversity for five native goat breeds (Angora, Kilis, Honamlı, Hair and Norduz) in Turkey, by using 20 microsatellite markers.As a result of 20 microsatellite loci analyses, average number of alleles in per locus (15.65 allele/locus) and heterozygosity (0.5192-0.9400) levels were fairly high.Investigated FIS values of goat breeds were defined between 0.01621 and 0.04951. These values were found close to zero in all populations and they were significant in only Angora and Kilis goats where heterozygote deficiency was observed. Calculated overall FIS value for all populations was 0.03656. Because of FIS value close to zero, all of the populations were in the Hardy-Weinberg equilibrium. According to FST values; medium level of genetic diversity was found between Angora Goats and other breeds. Among the other breeds, genetic diversity was low and this diversity was statistically significant. Results of various analysis, such as allelic variation analysis, heterozigosity analysis, F statistics, AMOVA, structure test, factorial correspondence analysis, allele sharing distance were illustrated that Angora Goat breed different from other goat breeds. But other native goat breeds couldn?t be separated from each other; these breeds were grouped in the same place. According to acquired results, none of the analyzed breeds in the study was in danger of extinction.The markers used in this study were determined to be highly polymorphic in the general aspect. Therefore, these markers are useful in the studies of genetic characterization and determining genetic diversity.According to all obtained results from the analysis of 20 microsatellite loci, goat breeds except Angora can not be genetically separated from each other.
Benzer Tezler
- Türkiye'deki yerli Honamlı ve Kıl keçilerinin et verimi yönünden moleküler düzeyde tanımlanması
Definition of local Honamlı and Hair goats in Türkiye in terms of meat production on the molecular level
ONUR VURAL
Doktora
Türkçe
2023
BiyoteknolojiAkdeniz ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HASAN MEYDAN
- Türkiye'deki bazı koyun ırklarının genetik yapılarının mikrosatellitlerle incelenmesi
Investigation of genetic structure of some sheep breeds in Turkey by using microsatellites
ZAFER BULUT
Doktora
Türkçe
2004
Veteriner HekimliğiSelçuk ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
PROF.DR. MEHMET NİZAMLIOĞLU
PROF.DR. İNCİ TOGAN
- Japon bahçesi tasarım kriterleri açısından Türkiye'deki bazı Japon bahçelerinin değerlendirilmesi
Evaluation of some Japanese gardens in Turkey in terms of Japanese garden design criteria
MERTKAN FAHRETTİN TEKİNALP
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
Peyzaj MimarlığıDüzce ÜniversitesiPeyzaj Mimarlığı Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ÖZGÜR YERLİ
- Bazı yerli biber genotiplerinin karakterizasyonu ve sanayiye uygunluklarının belirlenmesi üzerine araştırmalar
Characterization of some local pepper genotypes and investigation on suitability for processsing
MEHMET KADRİ BOZOKALFA