Geri Dön

Tripsin enziminin immobilizasyonu ve protein fragmantasyonunda kullanım potansiyelinin araştırılması

Immobilization of trypsin and investigation of potential use for protein fragmentation

  1. Tez No: 276084
  2. Yazar: CENK DAĞLIOĞLU
  3. Danışmanlar: PROF. DR. FİGEN ZİHNİOĞLU
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyokimya, Biochemistry
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2010
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ege Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyokimya Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 109

Özet

Tripsin, peptid bağlarını lizin ve arginin artıklarından sonra spesifik olarak yıkıma uğratan bir pankreatik serin endoproteazdır ve çoğunlukla protein yıkımı ve peptid haritalandırılmasında kullanılmaktadır.Proteazlar arasında en kapsamlı ilgilenilen proteaz olan tripsin endüstriyel ve biyomedikal uygulamalarda yaygın olarak kullanılmaktadır. Fakat endüstriyel proseslerde doğal enzim kullanımı, operasyon ve saklama süreci sırasında enzimin biyokatalitik aktivitesini hızlı kaybetmesi ve kararlı olmaması göz önüne alındığında sınırlanmaktadır. Bunun yanı sıra enzimleri substrat çözeltisinden çıkarmak zordur ve bu durum ürün kontaminasyonuna sebep olabilir.Protein analizlerindeki yoğun ilgi göz önüne alındığında, son yıllarda immobilize tripsin konsepti, geniş enzim-substrat oranı, yüksek yıkım verimliliği, tekrar kullanılabilirliğinin mümkün olması ve serbest enzime göre denatürasyon ve inaktivasyon oranının düşük olması gibi çeşitli avantajları nedeni ile çok fazla dikkat çekmiştir.Bu çalışmada, ilk olarak silika tabanlı bir taşıyıcı üzerine tripsin immobilizasyonu gerçekleştirildi. Daha sonra, kovalent baglanma ile immobilize edilen tripsinin karakterizasyonu için, optimum pH, pH kararlılığı, optimum sıcaklık, termal kararlılığı, depo kararlılığı, operasyonel kararlılığı ve tekrar kullanılabilirliği belirlendi. Bunlara ek olarak, immobilize tripsinin organik çözücülerde çalışılabilirliği ve stabilitesi, ve protein fragmantasyonunda kullanım potansiyeli araştırıldı.

Özet (Çeviri)

Trypsin, which specifically cleaves peptidic bonds on C-terminal group of lysine or arginine, is a pancreatic serine endoprotease and used mostly for protein digestion and peptide mapping.Proteases among which trypsin is the most extensively concerned are widely used in industrial and biomedical applications. However utilisation of native enzyme is limited in industrial processes due to the problem of its instability and rapid loss of biocatalytic activity during the operation and prolonged storage periods. Besides that, it is difficult to remove the enzyme from the substrate solution and might lead to a contamination of the product.In view of the strong interest in protein analysis, the concept of immobilized trypsin has received much attention in recent years because of several advantages, such as: larger enzyme to substrate ratio, high digestion efficiency, the possibility of their repeated use, and the rate of denaturation or inactivation is less than with the free enzyme.In this study immobilization of trypsin was firstly performed on a silica-based carrier. Afterwards, the parameters of: optimum pH, pH stability, optimum temperature, thermal stability, storage stability, operational stability and re-usability were determined for the characterization of the trypsin immobilized by covalent binding. In addition to these, immobilized trypsin was investigated for function and stability in organic solvents, and in potential uses for protein fragmentation.

Benzer Tezler

  1. Polifenollerle fonksiyonelleştirilmiş Fe3O4 nanopartiküllerine tripsin immobilizasyonu ve sindirim uygulaması

    Immobilization of trypsin on Fe3O4 nanoparticles which have been functionalized with polyphenols and application of digestion

    KEZİBAN ATACAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    BiyokimyaSakarya Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MAHMUT ÖZACAR

  2. Yeni akrilat kökenli afinite kürelerin tasarlanması: Protein adsorpsiyonu ve saflaştırılmasında kullanılması

    Design of the new acrylate based affinty beads and the use of adsorption and purification of protein

    AYŞEGÜL ÜLKÜ METİN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    BiyoteknolojiKırıkkale Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. GÜLAY BAYRAMOĞLU

    PROF. DR. M. YAKUP ARICA

  3. Protein encapsulation within oppositely charged polyelectrolyte complexes

    Karşı yüklü polielektrolit kompleksleri içine protein enkapsüllemesi

    İLAYDA AKBULUT

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    BiyofizikBoğaziçi Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AYŞE BAŞAK KAYITMAZER BÜYÜKOKUTAN

  4. İmmobilize edilmiş proteazlarda düşük su içeren organik ortamlarda peptid sentezi

    Peptide synthesis catalyzed by modified proteases in low-water organik media

    YEŞİM YEŞİLOĞLU

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1999

    KimyaTrakya Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    Y.DOÇ.DR. AYTEN SAĞIROĞLU

  5. Tripsin immobilizasyonu ve karakterizasyonu

    Trypsin immobilization and characterization

    ÖMER HABİB

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    BiyokimyaEge Üniversitesi

    Biyokimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FİGEN ZİHNİOĞLU