Türkiye sularındaki işkine (Sciaena umbra Linnaeus,1758) ve kötek (Umbrina cirrosa Linnaeus,1758) balıklarının populasyonlarının genetik analizi
Genetic analyses of brown meagre (Sciaena umbra Linnaeus,1758) and shi drum (Umbrina cirrosa Linnaeus,1758) distributed along Turkish coastal waters
- Tez No: 285370
- Danışmanlar: DOÇ. DR. İLHAN ALTINOK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Umbrina cirrosa, Sciaena umbra, Cyt-b, haplotip, RFLP, nükleotitçeşitliliği
- Yıl: 2011
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Karadeniz Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Balıkçılık Teknolojisi Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 92
Özet
2008-2010 tarihleri arasında Trabzon, Giresun, Artvin, Rize, Adana, Antalya, Muğla ve?zmir bölgelerinden toplam 254 adet kötek (Umbrina cirrosa) ve işkine (Sciaena umbra)balık türleri örneklenmiştir. Cyt-b, 16S rRNA gen bölgelerinin sekans ve Cyt-b, 16S rRNAve ND1 gen bölgeleri için RFLP analiz sonuçları irdelenerek filogenetik ve populasyonanalizleri yapılmıştır. Sekans analizi sonuçlarına göre Cyt-b geninde işkinede 25, kötekte20 haplotip belirlenirken, 16S rRNA geni için işkinede 4 ve kötekte 8 haplotipbulunmuştur. Ayrıca Cyt-b ve 16S rRNA gen bölgeleri için haplotip çeşitliği işkinedesırası ile %83,8 ve %52,6 ve kötek de ise %80,5 ve %73,6 olarak bulunmuştur. Yapılanmoleküler varyans analizi sonucuna göre Fst değeri 0,07364 (P < 0.001) olarak bulunmuşolup, Trabzon Rize popülâsyonu hariç diğer popülâsyonlar birbirinden ayrılmıştır. KötekCyt-b moleküler varyans analizi sonucunda Fst değeri 0,1881 ve (P < 0.001) dir. Rize-Artvin populasyonları yalnız kendi aralarında ayrılmaz iken Antalya tüm populasyonlarlaaynı özelliği göstermiştir. İşkine ve Kötek için hesaplanan Nükleotid çeşitliliği (Pi) venükleotid farklığı (k) Cyt-b geni için sırası ile % 2,97 ve 2,87 ve 16S rRNA geni için isesırası ile 1,54 ile 0,61 olarak belirlenmiştir. Filogenetik analizlerde genus düzeyindeayrışma sağlanamamıştır. Yapılan RFLP analiz sonucunda ise populasyon düzeyindepolimorfik bir yapılanma bulunamamıştır.
Özet (Çeviri)
To analyze filogenetic and population structure of shi drum and brown meagre, 254 fishwere sampled from eight locations of Turkish coastal. The sequence analysis of Cyt-b, 16SrRNA and RFLP analysis of Cyt-b, 16S rRNA and ND1 gene sites were examined tofilogenetic and population structure of these fish. Based on sequence analyses, 25 and 20haplotypes were specified for brown meagre and for Shi Drum in Cyt-b gene and 4haplotypes for brown meagre and 8 haplotypes for shi drum in 16S rRNA. Nucleotidediversity in 16S rRNA and Cyt-b genes were found 83.8% and 52.6% for brown meagreand 80.5% and 73.6% for shi drum, respectively. Molecular variances analysis showed thatFST value was found 0.07364, Cyt-b molecular variances analysis for shi drum indicatedthat FST value was 0.1881 (P
Benzer Tezler
- Preparation of poly(N-tris[hydroxymethyl]methyl acrylamide) based hydrogels and composites for removal of boron from aqueous solutions
Sulu çözeltilerden bor giderilmesi için poli(N-tris[hidroksimetil]metil akrilamid) bazlı hidrojel ve kompozitlerin hazırlanması
SARE NAZ ÇİFTÇİ
Yüksek Lisans
İngilizce
2019
Polimer Bilim ve Teknolojisiİstanbul Teknik ÜniversitesiPolimer Bilim ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BAHİRE FİLİZ ŞENKAL
- Potential benefits of satellite-based automatic identification system in the context of intelligent transportation systems
S-AIS teknolojisinin akıllı ulaşım sistemleri bağlamındaki potansiyel faydaları
BORA ŞAN TURGUT
Yüksek Lisans
İngilizce
2019
Denizcilikİstanbul Teknik ÜniversitesiDeniz Ulaştırma Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ İSMAİL ÇİÇEK
- A preliminary investigation on genetics of small cetaceans in Turkey
Türkiye sularındaki küçük deniz memelilerin genetiği üzerine bir ön çalışma
REYHAN SÖNMEZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2011
Deniz BilimleriDokuz Eylül ÜniversitesiDeniz Bilimleri ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. KEMAL CAN BİZSEL
- Türkiye kahverengi alabalık (Salmo trutta L.) populasyonlarının genetik yapısının mikrosatellit yöntemiyle belirlenmesi
Determination of genetic structure of brown trout (Salmo trutta, L., 1758) populations using mikrosatellit markers
FERİDUN AFAN
- Fırat-Dicle havzasında bazı Alburnus sellal Heckel, 1843 popülasyonlarının geometrik morfometrik analizi
Geometric morpometric analysis of some Alburnus sellal Heckel, 1843 populations in Firat-Dicle basin
NUH KUBİLAY
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
BiyolojiNevşehir Hacı Bektaş Veli ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SEVİL SUNGUR