Geri Dön

Candida ve Aspergillus enfeksiyonlarının real time PCR yöntemi ile hızlı tanısının kültür yöntemi ile karşılaştırılması ve antifungal direncin kolorimetrik yöntemle tayini

Real time PCR for rapid diagnosis of Candida and Aspergillus infections with comparison of culture method and determination of antifungal resistance colorimetric method

PDF İndir

  1. Tez No: 290413
  2. Yazar: İSKENDER KARALTI
  3. Danışmanlar: PROF. DR. GÜNAY TÜLAY ÇOLAKOĞLU
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoloji, Mikrobiyoloji, Biology, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2011
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Marmara Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 119

Özet

Bu çalışma 2009 - 2011 yılları arasında Yeditepe Üniversitesi Hastanesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı'na başvuran hastalardan alınan örnekler kullanılarak gerçekleştirilmiştir. Toplamda 139 adet örnek çalışılmış ve 139 adet suş izole edilmiştir. Bu suşlar, hastalardan alınan abse, ağız sürüntsü, balgam, BAL (Bronkoalveolar Lavaj), idrar ve idrar sondası, kan kültürü, kateter, kulak akıntısı ve sürüntüsü, trakeal aspirat, steril vücut sıvısı örneklerinden elde edilmiştir. Çalışmada kültür yöntemi ile tanımlanan Candida ve Aspergillus türleri, moleküler yöntemlerle tanımlanmıştır, bu iki yöntemin sonuçları karşılaştırılmıştır. Çalışmamızda Aspergillus cinsine ait Aspergillus flavus (Link, 1809), Aspergillus fumigatus (Fresen, 1863), Aspergillus niger (Tiegh, 1867), Aspergillus terreus (Thom, 1918) ile Candida cinsine ait Candida albicans ((C.P. Robin) Berkhout 1923), Candida glabrata ((H.W. Anderson) S.A. Mey. & Yarrow, 1978), Candida parapsilosis ((Ashford) Langeron & Talice, 1932), Candida tropicalis ((Castell.) Berkhout, 1923), Candida dubliniensis (D.J. Sullivan, Western., K.A. Haynes, Dés.E. Benn. & D.C. Coleman, 1995), Candida krusei ((Castell.) Berkhout, 1923) türleri izole edilmiştir. Sybr green boyası ile panfungal PCR yapılarak öncelikle cins düzeyinde Aspergillus ve Candida ayrımı yapılmıştır. Daha sonra Taqman PCR ile 4 farklı Candida türü (Candida albicans, Candida glabrata, Candida tropicalis ve Candida parapsilosis) tanımlanmıştır. Kültür yöntemi ile tanımlanan 57 adet Candida albicans; 12 adet C. glabrata; 21 adet C. parapsilosis; 17 adet C. tropicalis suşlarının tamamı Taqman PCR ile de doğrulanmıştır ve bu iki yöntem ile yapılan identifikasyon sonuçları arasındaki uyumun %100 olduğu belirlenmiştir.Ayrıca Candida türlerinin kolorimetrik bir yöntem ile 7 farklı antifungale (Flukonazol, Kaspofungin, Vorikonazol, Amfoterisin B, Posakonazol, İtrakonazol ve 5-Flusitosin) karşı duyarlılık deneyleri yapılmıştır. Kaspofungine dirençli bir suşa rastlanmazken, en fazla direnç azol grubu antifungallerde saptanmıştır.

Özet (Çeviri)

In this study, specimen, collected from the patients who applied to Medical Microbiology Laboratory of Yeditepe University Hospital between 2009-2011 were evaluated. 139 specimen were studied and 139 strains were isolated. These strains were isolated from abscesses, oral swabs, sputum, BAL (Bronchoalveolar lavage), urine, and urinary catheter, blood cultures, catheter, ear discharge and swabs, tracheal aspirates, sterile body fluid samples. In the study Aspergillus flavus (Link, 1809), Aspergillus fumigatus (Fresen, 1863), Aspergillus niger (Tiegh, 1867), Aspergillus terreus (Thom, 1918) species, which were belong to Aspergilus genus and Candida albicans ((C.P. Robin) Berkhout 1923), Candida glabrata ((H.W. Anderson) S.A. Mey. & Yarrow, 1978), Candida parapsilosis ((Ashford) Langeron & Talice, 1932), Candida tropicalis ((Castell.) Berkhout, 1923), Candida dubliniensis (D.J. Sullivan, Western., K.A. Haynes, Dés.E. Benn. & D.C. Coleman, 1995), Candida krusei ((Castell.) Berkhout, 1923) species which were belong to Candida genus were isolated. Primarily panfungal PCR was made by Sybr green dye to distinguish Candida and Aspergillus at species level. Then four different Candida species (Candida albicans, Candida glabrata, Candida tropicalis ve Candida parapsilosis) have been identified by Taqman PCR. 57 Candida albicans, 12 C. glabrata, 21 C. parapsilosis, 17 C. tropicalis; which were defined by culture method confirmed by Taqman PCR. The results of identification with these two methods were found 100% compatible.In addition, antifungal susceptibility of Candida species against 7 different antifungals (Fluconazole, Caspofungin, Voriconazole, Amphotericin B, Posaconazole, Itrakonazole ve 5-Flucytosine) determined by colorimetric method. Caspofungin resistant strains were not found, the most resistance was determined to azole antifungals .

Benzer Tezler

  1. Tez No

    359180

    Febril nötropenik hastalarda fungal etkenlerin varlığının farklı mikrobiyolojik yöntemlerle araştırılması

    Investigation of the presence of fungal agents in febrile neutropenic patients with different microbilogical methods

    AHU SÖNMEZ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    MikrobiyolojiGaziantep Üniversitesi

    Temel Tıp Bilimleri Bölümü

    DOÇ. DR. FAHRİYE EKŞİ

  2. Tez No

    268001

    Sistemik mikoz tanısında kültür ve kültür dışı yöntemlerin karşılaştırılması ve kitin antijeninin saptanması için ELISA yöntemi geliştirlmesi

    Comporison of the culture and non-culture methods and development of an ELISA technique for the determination of chitin antigen in the diagnosis of systemic mycoses

    BURÇE YALÇIN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    MikrobiyolojiGazi Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEMRA KUŞTİMUR

  3. Tez No

    225339

    Deneysel kandida albikans endoftalmili tavşan gözlerinde intravitreal ve oral moksifloksasin uygulamasının göz içi sıvılara geçişinin ve antifungal etkisinin değerlendirilmesi

    Evaluation of antifungal activity and intraocular fluid penetration of intravitreally and orally administered moxifloxacin in eyes with endophthalmitis due to candida albicans in an experimental rabbit model

    SEDAT ARIKAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    Göz HastalıklarıGazi Üniversitesi

    Göz Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ŞENGÜL ÖZDEK

  4. Tez No

    374850

    Barınak köpeklerinde solunum yolu enfeksiyonlarının klinik, bakteriyolojik analizi ve antibakteriyel tedavi seçeneklerinin belirlenmesi

    Clinical and bacteriological analysis of respiratory tract infections and determination of antibacterial treatment modalities in sheltered dogs

    SERKAN İRFAN KÖSE

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Veteriner HekimliğiSelçuk Üniversitesi

    İç Hastalıkları (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET MADEN

  5. Tez No

    820351

    Evaluation of biological activities ofMmelia azedarach species and its importance in phytotherapy

    Melia azedarach türünün biyolojik aktivitelerinin değerlendirilmesi ve fitoterapideki önemi

    KHAWLA ABDALLA MOHAMED ESWIEI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    Eczacılık ve Farmakolojiİstanbul Üniversitesi

    Farmakognozi Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ESRA EROĞLU ÖZKAN

Geri Dön