Transgenik domates bitkisinde (Solanum lycopersicum cv. UC82MA 35S::ATHB7) kuraklığa dayanıklılık sağlayan ATHB7 geninin ekspresyon profilinin araştırılması
Analysing expression pattern of drought tolerant ATHB7 gene in transgenic tomato plant (Solanum lycopersicum cv. UC82MA 35S::ATHB7)
- Tez No: 291785
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. NESLİHAN SARUHAN GÜLER
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Ekspresyon profili, Transkripsiyon faktörü, HDZip, Lösin fermuar, ATHB7, Transgenik domates bitkileri, Expression pattern, Transcription factor, HDZip, Leucine zipper, ATHB7, Transgenic tomato plants
- Yıl: 2011
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Rize Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 76
Özet
Bir homeodomain lösin fermuar geni kodlayan ATHB7, Arabidopsis homeobox transkripsiyon faktör ailesine üyedir ve ekspresyonu kuraklık koşulları altında up-regüle olur. Bu çalışmada; ATHB7 geninin (800 bç cDNA) şu ana kadar genomunda ATHB7 ortoloğu bir gen tespit edilmemiş olan domates bitkisine entegrasyonu ve transgenik domates bitkilerindeki ekspresyon profili karakterize edilmiştir.Bu amaçla, gen aktarımı yapılmış olası transgenik domates hatları ve izogenik kontrol Solanum lycopersicum UC82MA kültivarı, hedef genin (ATHB7) varlığı ve ifadesi bakımından analiz edildi. Birbirinden bağımsız 4 farklı jenerasyona ait (T0, T1, T2, T6) 4 olası transgenik domates hattından genomik DNA izole edildi ve genin 425bç'lik kısmı, ATHB7 spesifik primer çifti kullanılarak çoğaltıldı. Elde edilen sonuçlar bitkilerden 48'inin transgeni taşıdığını ortaya koydu. Bunun ışığında, ilgilenilen genin karşılaştırmalı ekspresyonprofilini elde etmek için, transgenik bitkilerin RNA kalıpları kullanılarak cDNA sentezlendi. qRT-PZR analizi ile, spesifik transkriptlerin amplifikasyonu sonucu, farklı hatlara ait yaprak dokularındaki farklı ekspresyon seviyeleri belirlendi. ATHB7 genine ait ekspresyon profilinin transgenik hatlarda belli bir ölçüde değişkenlik arz ettiği saptandı.Bu sonuçlar, ATHB7 geninin domates genomuna entegrasyonunu ve genomda uygun şekilde ekspres edildiğini kanıtlamaktadır. Buna dayanılarak, transgenin tek kopyasını taşıyan ve güçlü ekspresyon profili sergilediği düşünülen 6 transgenik hat (hatlar 164, 165A, 167, 204, 19 ve 59) ileriki fizyolojik analizlerde kullanılmak üzere seçilmiştir.
Özet (Çeviri)
ATHB7; coding a homeodomein leucinezipper (HD-Zip I) gene which is a member of the homeobox transcription factor family in Arabidopsis, shows up-regulation, during water deficit conditions.In this study; the integration and expression pattern of ATHB7 (8OO bp cDNA) was characterized in transgenic tomato plant genome where no ATHB7 hortologous gene has been identified no date. For this purpose, by using isogenic control Solanum lycopersicum cv. UC82 and putative transgenic tomato lines, the verification of the integration and expression of the gene of interest ?ATHB7?; transformed plants were analyzed. Genomic DNA from 4 different generations (T0, T1, T2, T6) and 4 independent putative transgenic tomato lines were isolated and a part of the gene (425 bp) amplified by using ATHB7 spesific primer pair. The observed results showed that 48 of them had that ATHB7 transgene correctly. By the light of this, cDNA was constructed from RNA templates of transgenic tomato plants and to observe relative expression patterns of ATHB7; ampli ? cation of the speci ? c transcripts were determined by the qRT-PCR. Different levels of expression of the different lines in the leaf tissues were observed. The expression of the ATHB7 gene in the transgenic lines, varied to some extent.These results suggest that the ATHB7 gene has been integrated into tomato genome and can be expressed properly in the transgenic plants.Therefore, six transgenic lines (164, 165A, 167, 204, 19 and 59), which contain a single copy of the transgene and have a moderate to strong level of expression of the transgene was selected, for further physiological analysis.
Benzer Tezler
- CRISPR/Cas9 sistemi kullanılarak solanum lycopersıcum'da yağ asidi sentez yolağında yer alan genlerin susturulması
Silencing of genes involved in fatty acid synthesis pathway in solanum lycopersicum using CRISPR/Cas9 system
SİBEL BAHADIR
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
BiyoteknolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUSA KAVAS
- Pichia pastoris mayalarından rekombinant ekspanzin üretiminin optimizasyonu
Optimization of recombinant expansin production from Pichia pastoris yeast
ASLİYE KARAASLAN
Doktora
Türkçe
2017
BiyoteknolojiHarran ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HASAN VARDİN
- CRISPR/CAS9 sistemi kullanılarak domates (Solanum lycopercium) bitkisinde CCDC124 geninin susturulması
Utilizing the CRISPR/CAS9 system to silence the CCDC124 gene in tomato (Solanum lycopercium)
HİLAL CİVELEK
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyoteknolojiGebze Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. UYGAR HALİS TAZEBAY
PROF. DR. YELDA ÖZDEN ÇİFTÇİ
- Domates bitkisinde biyoteknolojik çalışmalar ve GDO tanısı
Biotechnological studies in tomato plant and GDO diagnosis
MUKADDES DURMUŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
BiyoteknolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ YILMAZ KAYA
- MiR396 knockout via crispr to enhance expression levels of growth regulating factors (GRFS) in tomato
CRISPR ile MiR396 susturularak domates bitkisinde büyümeyi düzenleyici faktörlerin (GRFS) ifadelerinin artırılması
ALİ BURAK YILDIZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
BiyolojiGebze Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YELDA ÖZDEN ÇİFTÇİ