Designing sequenced characterized amplified region (SCAR) markers from direct sequencing of rapd bands for cultured fish
Kültür balıkları için rapd bantlarından doğrudan dizileme yöntemi ile dizisi karakterize edilmiş (SCAR) yeni markör dizaynı
- Tez No: 295544
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. İREM UZONUR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Dicentrarchus labrax, RAPD-PCR, Sparus aurata, Dicentrarchus labrax, RAPD-PCR, Sparus aurata
- Yıl: 2011
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Fatih Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Bölümü
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
?Rastgele Çoğaltılmış Polimorfik DNA? (RAPD)'i kapsayan PCR tabanlımetotlar kültür edilmiş balık materyallerinin tür tayini, karakterizasyon ve kalitekontrolü gibi uygulamalarında etkili bir biçimde kullanılmıştır. Buna rağmen, RAPDmarkörlerin üretiminde ve güvenilir bir şekilde kullanımında önemli bir boşluk yeralmaktadır. RAPD analizlerinde, genom üzerinde farklı bölgelere bağlanan kısa rastgeleprimerler kullanılır, ancak bazen metodun tekrarlanabilirliğine ve üretilebilirliğine engelolacak yanlış eşleşmeler yapabilirler. Bu problemlerin üstesinden gelebilmek için,RAPD bantları kullanılarak daha uzun ve özel primerler geliştirilmiştir. Bu uzunprimerler, özellikle genomun işaretlenmiş bölgelerindeki çeşitliliği takip edebilmek içinkullanışlı olan Dizisi Karakterize Edilmiş Çoğaltılmış Bölge (SCAR)'ı meydana getirir.Bu çalışmada, gerçek zamanlı RAPD PZR ile elde edilen RAPD bantlarının,pahalı ve zaman gerektiren bir metot olan geleneksel klonlama yöntemi kullanılmadan,doğrudan dizi analizi ve primer dizaynı yapılarak SCAR markörlere dönüştürülmüştür.Bu strateji, RAPD PZR tabanlı markörlerin geliştirilmesini desteklemektedir.
Özet (Çeviri)
PCR based methods including ?Randomly Amplified Polymorphic DNA?(RAPD) can be effectively used for authentication, characterization and quality controlof the cultured fish material. Nevertheless, a significant gap exists between the quickgeneration of RAPD markers and their reliable use. Short random primers used in theRAPD analysis usually anneal with multiple sites in different regions of the genome,and thus they may amplify several genetic loci, however sometimes causing mismatchesresponsible from lack of repeatability and reproducibility of the method. To overcomethese problems, longer and more specific primers have been developed from theanonymous RAPD bands. These longer primers generate a ?Sequenced CharacterizedAmplified Region? (SCAR), which can be particularly useful to follow the variability ofthe marked region of the genome.In this study, RAPD bands that are obtained from real-time RAPD PCR areconverted into SCAR markers by direct sequencing of the RAPD products and primerdesign, avoiding the costly and time-consuming conventional cloning step. This strategyencourages the development of RAPD PCR-based markers.
Benzer Tezler
- İki katlı pamuk ipliklerinden dokunan kumaşlarda örgüye bağlı olarak maksimum atkı sıklığının değişimi üzerinde bir araştırma
Başlık çevirisi yok
MELTEM ASLI NARTER
Yüksek Lisans
Türkçe
1985
Tekstil ve Tekstil MühendisliğiEge ÜniversitesiTekstil Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GÜNGÖR BAŞER
- A Decision support system for planning standby garbage collection trucks
Yedek çöp toplama kamyonlarının planlanması için bir karar destek sistemi
GÜLSER HACISALİHOĞLU
Yüksek Lisans
İngilizce
1987
Endüstri ve Endüstri MühendisliğiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiEndüstri Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HALİM DOĞRUSÖZ
- 1981 Türkiye tarımsal yapısının önemli bileşenleri ve tarımsal bölgelerin elde edilmesi
Principle components of Turkey's agricultural structure and to determine agricultural rigions in 1981
İHSAN KARABULUT
- Mimarlıkta rasyonel ve irrasyonel biçimlendirmenin ekonomik göstergelere bağlı olarak değişimi ve bu değişimin 11. yüzyıldan 19. yüzyıla kadar Türk ve Avrupa uygarlıklarında örneklenmesi
The Change of rational and irrational styles in architecture duetotho economicaldata and the illustration of this change on the Turkish and European Civilizations between 11th and 19th centuries
AYŞE ZEYNEP ONUR
- Mevcut kaplıca yerleşmelerinin iyileştirilmesini etkileyen faktörler ve Yeni Kaplıca örneği
Adjustment principles of spas in Turkey, Yeni Kaplıca being the sample
DOĞAN ÜMİT YÜCEL