Designing sequenced characterized amplified region (SCAR) markers from direct sequencing of rapd bands for cultured fish
Kültür balıkları için rapd bantlarından doğrudan dizileme yöntemi ile dizisi karakterize edilmiş (SCAR) yeni markör dizaynı
- Tez No: 295544
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. İREM UZONUR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2011
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Fatih Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Bölümü
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 90
Özet
?Rastgele Çoğaltılmış Polimorfik DNA? (RAPD)'i kapsayan PCR tabanlımetotlar kültür edilmiş balık materyallerinin tür tayini, karakterizasyon ve kalitekontrolü gibi uygulamalarında etkili bir biçimde kullanılmıştır. Buna rağmen, RAPDmarkörlerin üretiminde ve güvenilir bir şekilde kullanımında önemli bir boşluk yeralmaktadır. RAPD analizlerinde, genom üzerinde farklı bölgelere bağlanan kısa rastgeleprimerler kullanılır, ancak bazen metodun tekrarlanabilirliğine ve üretilebilirliğine engelolacak yanlış eşleşmeler yapabilirler. Bu problemlerin üstesinden gelebilmek için,RAPD bantları kullanılarak daha uzun ve özel primerler geliştirilmiştir. Bu uzunprimerler, özellikle genomun işaretlenmiş bölgelerindeki çeşitliliği takip edebilmek içinkullanışlı olan Dizisi Karakterize Edilmiş Çoğaltılmış Bölge (SCAR)'ı meydana getirir.Bu çalışmada, gerçek zamanlı RAPD PZR ile elde edilen RAPD bantlarının,pahalı ve zaman gerektiren bir metot olan geleneksel klonlama yöntemi kullanılmadan,doğrudan dizi analizi ve primer dizaynı yapılarak SCAR markörlere dönüştürülmüştür.Bu strateji, RAPD PZR tabanlı markörlerin geliştirilmesini desteklemektedir.
Özet (Çeviri)
PCR based methods including ?Randomly Amplified Polymorphic DNA?(RAPD) can be effectively used for authentication, characterization and quality controlof the cultured fish material. Nevertheless, a significant gap exists between the quickgeneration of RAPD markers and their reliable use. Short random primers used in theRAPD analysis usually anneal with multiple sites in different regions of the genome,and thus they may amplify several genetic loci, however sometimes causing mismatchesresponsible from lack of repeatability and reproducibility of the method. To overcomethese problems, longer and more specific primers have been developed from theanonymous RAPD bands. These longer primers generate a ?Sequenced CharacterizedAmplified Region? (SCAR), which can be particularly useful to follow the variability ofthe marked region of the genome.In this study, RAPD bands that are obtained from real-time RAPD PCR areconverted into SCAR markers by direct sequencing of the RAPD products and primerdesign, avoiding the costly and time-consuming conventional cloning step. This strategyencourages the development of RAPD PCR-based markers.
Benzer Tezler
- Alüviyal sahalarda sahaya özel zemin davranış analizi
Site response analysis on the alluvial fields
EBRU ÜÇKUN
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
İnşaat MühendisliğiSakarya Üniversitesiİnşaat Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ERTAN BOL
- Primer hiperlipidemili hastaların değerlendirilmesi ve ailevi hiperkolesterolemili çocuklarda mutasyon taraması
Evaluation of patients with primary hyperlipidemia and mutation screening in children with familial hypercholesterolemia
HAYRETTİN HAKAN AYKAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2010
Endokrinoloji ve Metabolizma HastalıklarıHacettepe ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ALİ DURSUN
- Empedans değişimi üzerinden mikroorganizma tayini yapmayı hedefleyen sensör sistemi çalışması
Sensor system study targeted to microorganism detection under impedance change
SEVİLAY BURCU ŞAHİN
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
Biyolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NEVİN GÜL-KARAGÜLER
- Durum wheat metallothionein mutants and their biophysical characterization
Makarnalık buğday metallotionin mutantları ve biyofiziksel karakterizasyonu
CEREN SAYGI
- Yapay Zeka'nın robot görmesi üzerine uygulanması
An Application of robot vision in artificial intelligence
FUNDA PEHLİVAN
