Geri Dön

Zeytin (Olea europaea) bitkisinden karbonik anhidraz enzimini kodlayan genin klonlanması

Cloning of gene encoding carbonic anhydrase enzyme from olive (Olea europaea)

PDF İndir

  1. Tez No: 297079
  2. Yazar: MUNİSE YURTSEVER
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. ŞENAY VURAL KORKUT
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2011
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Yıldız Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 120

Özet

Karbonik anhidraz (CA), çinko içeren bir metalloenzimdir. CO2 ve HCO3- arasında geri dönüşümlü (CO2 + H2O ? HCO3? + H+) reaksiyonunu gerçekleştirir ve hayvanlarda, bitkilerde, arke bakterilerde ve öbakterilerde yaygın olarak bulunur. Farklı evrimsel yollarla gelişmiş 5 farklı CA ailesi vardır: ?, ß, ?, ? ve ?. CA'lar pH düzenlenmesi, CO2 transferi, iyon değişimi, solunum, biyosentez ve fotosentez gibi birçok farklı biyolojik süreçte yer alır. Ayrıca CA transkriptinin farklı abiyotik streslere yanıt olarak anlatımında artış görülür.Bu çalışmada soğuk stresine maruz bırakılmış zeytin bitkilerinden ß-karbonik anhidraz 392 bp uzunluğunda bir cDNA fragmanı klonlandı. Klonlanan cDNA'nın dizini NCBI veritabanında bulunan Oleae europeae kontig dizini ile yüksek oranda benzerlik gösterdi. Kontig dizin bilgisi kullanılarak 3' ve 5' uçları için primerler tasarlandı. Tam uzunlukta cDNA klonlamak için önce 3' RACE reaksiyonları yapıldı ve 1150 bp'lik bir fragman elde edildi. Bu fragman klonlanarak dizin analizi yaptırıldı. BLASTN ve BLASTP analizleriyle tütün ve domates kloroplast CA'ları ile pamuk ve bezelye ß-CA'larına %75 üzerinde benzerlik gösterdiği saptandı. İki primer birlikte kullanılarak genomik DNA'dan PCR yapıldı. Yaklaşık 900 bp'lik bir fragman elde edilerek klonlandı ve dizin analizi yaptırıldı. Genomik klonların dizinleri cDNA dizinine %95-96 benzerlik gösterdi.

Özet (Çeviri)

Carbonic anbydrase (CA) is a zinc-containing enzyme that catalyzes the reversible hydration of carbon dioxide (CO2 + H2O ? HCO3- + H+) and is widely distributed in animals, plants, archaebacteria, and eubacteria. There are five evolutionarily unrelated CA families: ?, ß, ?, ? and ?. CAs are involved in a variety of biological processes including pH regulation, CO2 transfer, ion exchange, respiration, biosynthesis, and photosynthetic CO2 fixation. Expression of CA transcript is differentially up regulated in response to various abiotic stresses.In this study 392bp fragment of ß-CA cDNA was cloned from leaves of olive exposed to cold stres. The sequence of cloned fragment shared significant homology with a region of Oleae europeae contig sequence of ß-carbonic anhydrase which is found in NCBI databases. Forward and reverse primers were designed using sequence information of the contig. Firstly 3?RACE reactions performed to clone full length cDNA and a fragment about 1150 bp was obtained. The fragment was cloned and sequenced. The sequence showed more than 75% similarity to tobacco and tomato chloroplast CA and cotton and pea ß-CAs in BLASTN and BLASTP analysis. Genomic DNA PCR was performed using forward and reverse primers and a fragment of 900 kb was synthesized. The genomic fragment was cloned and sequenced. The sequence of genomic clones showed 95-96% to the sequence of the cDNA clone.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    244417

    Bitkilerde CBF/DREB transkripsiyon faktörlerini kodlayan gen homologlarının zeytin (Olea europaea) bitkisinden izolasyonları

    Isolation of homologues of genes encoding CBF/DREB transcription factors in plants from olive (Olea europaea) plant

    GİZEM HACIMUTO

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    BiyolojiYıldız Teknik Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. ŞENAY VURAL KORKUT

  2. Tez No

    329646

    Zeytin (Olea europaea L.) yaprağından ß-glukozidaz enzimini kodlayan genin klonlanması

    Cloning of gene encoding ß-glucosidase enzyme from olive (Olea europaea) leaves

    GİZEM ÇAVUŞOĞLU DOLMA

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    BiyolojiYıldız Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. ŞENAY VURAL KORKUT

    DOÇ. DR. NEHİR ÖZDEMİR ÖZGENTÜRK

  3. Tez No

    243862

    Olea europaea cv Gemlik (zeytin) bitkisine ait cDNA kütüphanesinin hazırlanması ve sonuçların bioinformatik analiz yöntemleri ile değerlendirilmesi

    Construction of cDNA library from Olea europaea cv Gemlik (olive) and evaluation of the results by bioinformatic analysis methods

    FATMA ORUÇ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    BiyomühendislikYıldız Teknik Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. NEHİR ÖZDEMİR

  4. Tez No

    606675

    Farklı antepfıstığı (Pistacia vera L.) ve zeytin (Olea europaea) çeşitlerinin bor (B) noksanlığına karşı duyarlılığının belirlenmesi

    Determination of the sensitivity of the different pistachio (Pistachio vera L.) and olive (olea europaea) varieties to boron (B) deficiency

    SADETTİN BOZGEYİK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    ZiraatÇukurova Üniversitesi

    Tiyatro Yönetmenliği Ana Sanat Dalı

    PROF. DR. AYFER ALKAN TORUN

  5. Tez No

    781628

    Molecular and bioinformatic identification of two sterol methyltransferases which are involved in plant sterol biosynthesis in olive (Olea europaea L.)

    Bitki sterol biyosentezinde görev alan iki sterol metiltransferaz geninin moleküler ve biyoinformatik olarak zeytin (Olea europaea L.) genomunda tanımlanması

    KÜBRA ÖZTÜRK

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    BiyolojiÇanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. KEMAL MELİH TAŞKIN

Geri Dön