Geri Dön

İnsan karbonik anhidraz III (CAIII) promotorunun klonlanması ve genin ekspresyon profilinin analizi

Cloning of carbonic anydrase III (CAIII) promoter and expression analysis of gene profile

  1. Tez No: 300050
  2. Yazar: DERYA OKUYAN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. FERAY KÖÇKAR
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2011
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Balıkesir Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 105

Özet

İnsan Karbonik Anhidraz III geni (CAIII), karbonik anhidraz ailesinin diğer üyelerinden düşük CO2 hidrataz aktivitesi ve sülfanamid inhibitörlerine karşı direnç gösterme özellikleriyle ayrılır. 8.kromozomun q22 bölgesine lokalize olan CAIII geni kasa spesifiklik göstererek erkeklerde ve fetüslerde yüksek seviyelerde ifade olmaktadır.İnsan CAIII geninin farklı hücre serilerinde ekspresyon profili için semi qantitatif RT-PZR çalışmaları yapılmıştır. Bu amaçla Kolon Karsinom Hücre Hattı HT-29, Osteosarkom Hücre hatıı MG63 ve Saos-2, Karaciğer Kanser hücre hattı Hep3B, HUVEC, Meme Kanser hücre hattı MCF-7, Prostat Kanseri hücre hattı PC3 ve DU-145'ndan CAIII'ün ekspresyon seviyesine bakılmış ve sadece HT-29, MG63, Saos-2 ve HUVEC hücre hatlarında mRNA düzeyinde ekspre olduğu bulunmuştur. Sitokinlerin CAIII'ün ekspresyon seviyesinde etkisini belirlemek amaçlı seçilen sitokinler, TGF-ß, TNF-?, IL-1?, IL-6 ve IFN-?, HT-29 hücre hattına uygulanmış ve zamana bağlı değişimi belirlemek için gerçek zamanlı qRT-PZR çalışmaları yapılmıştır. CAIII proteinin HT-29 hücre hattında protein düzeyinde ifadesi de western blot tekniği ile gösterilmiştir. CAIII'ün transkripsiyonel aktivitesinin belirlenmesi amaçlı, İnsan CAIII geninin promotor bölgesi -939/+86 bç'lik bölgeden genomik PZR yöntemiyle PGEMT-easy içine klonlanmıştır. Transkripsiyonel aktivitesinin belirlenmesi amaçlı lusiferaz haberci vektör içine alt klonlanmıştır. Ayrıca olası transkripsiyon faktörleri bağlanma bölgeleri biyoinformatik olarak analiz edilmiştir.

Özet (Çeviri)

Human Carbonic Anhydrase III (CAIII), differs from other membres of the family of Ccarbonic anhydrase with lower CO2 hidratation activity and resistance to classical CA sulphonamides inhibitors. CAIII gene localized to the 8. Chromozome at q22 region is specifically high expressed in muscles in males and fetuses.The expression profile of human CAIII gene was carried out by semi quantitative RT-PCR analysis in different cell lines. The mRNA expression of CAIII was determined from HT-29 (Colon carcinoma cells), MG63 (Ostosarcoma cells), Saos-2 (Osteosarcoma cells), HUVEC (Endothelial cells) although there is no expression was detected in MCF7 (Breast carcinoma cells), PC3 (Prostate carcinoma cells), DU145 (Prostate carcinoma cells) and Hep3B (Hepatoma cells cell lines. In order to the determine the effect of cytokines on the CAIII expression, TGF-ß, TNF-?, IL-1? IL-6 and IFN-? cytokines were chosen and applied to HT-29 cells. Then, Real-Time qRT-PCR were carried out so as to determine the selected cytokines on the time dependent chances at mRNA level of CAIII. In addition, the presence of CAIII protein was demonstrated by western blot analysis. In order to determine transcriptional activity of CAIII promoter, -936/+86bp CAIII promotor region was amplified by PCR based approached and cloned into pGEM-T easy vector. In addition, the putative transcription factor binding motifs were analysed bioinformatically in the CAII promoter.

Benzer Tezler

  1. İnsan karbonik anhidraz III geninin transkripsiyonel regülasyonu

    Transcriptional regulation of human carbonic anhydrase III gene

    DERYA OKUYAN ALTAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    BiyokimyaBalıkesir Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FERAY KÖÇKAR

  2. Bazı tıbbi bitkilerin biyolojik aktivitelerinin incelenmesi ve aktif fenolik bileşiklerin analizi

    Investigation of biological activities of some medical plants and analysis of active phenolic compounds

    FATMA GÜLRUY AYDIN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Eczacılık ve FarmakolojiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Farmakognozi Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ EMİR ALPER TÜRKOĞLU

    DR. ÖĞR. ÜYESİ TURGUT TAŞKIN

  3. Yeni sekonder sülfonamidlerin sentezi ve in vitro karbonik anhidraz izoenzimleri üzerine inhibisyon aktivitelerinin incelenmesi

    Synthesis of novel secondary sulfonamides and their in vitro carbonic anhydrase isozymes inhibition effects

    TANER GÖKÇEN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Biyokimyaİstanbul Teknik Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. TURAN ÖZTÜRK

    DOÇ. DR. AHMET C. GÖREN

  4. Bazı doğal maddelerin insan karbonik anhidraz I ve II izoenzimleri üzerindeki inhibitör etkilerinin incelenmesi

    Investigation of the inhibitory effects of some natural substances on human carbonic anhydrase I and II isoenzymes

    TUNAY ÇELİK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    BiyokimyaAğrı İbrahim Çeçen Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ KADİRİYE URUÇ PARLAK

  5. Synthesis and carbonic anhydrase I-II activity studies of 1,2,3-triazolyl-1,3-dioxoisoindoline sulfonamides

    1,2,3-triazolil-1,3-dioksoizoindolin sülfonamidlerin sentez ve karbonik anhidraz I-II aktivite çalışmaları

    CHNAR TAHER MAHMOOD KAKA KHAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2021

    KimyaSakarya Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUSTAFA ARSLAN