Direnç mutasyonları gösteren HBV mutantlarının belirlenmesi ve bu mutantların çeşitli antivirallere karşı direnç profillerinin in vitro fenotipleme yöntemi ile karakterizasyonu
Determination of novel HBV mutants and characterization of their resistance profiles against different antivirals using in vitro phenotyping method
- Tez No: 301051
- Danışmanlar: PROF. DR. A. MİTHAT BOZDAYI
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2011
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Biyoteknoloji Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 80
Özet
Dünya populasyonunun üçte biri hepatit B virüsüne maruz kalmıştır. HBV infeksiyonu tüm dünyada ve Türkiye'de epidemiyolojik bir problemdir. İlaç direncinin gelişimi antivirallerin uzun vadeli etkinliğini önemli ölçüde sınırlamaktadır. Sıklıkla oluşan ilaca dirençli hepatit B virüsü mutantları, tedavi başarısızlığına ve karaciğer hastalığında ilerlemeye sebep olur.Çalışmamızda kliniğe başvurmuş serumlarında HBV virüsü tespit edilmiş hastaların, hepatit B virüsü polimeraz gen bölgesinin dizi analizi yapıldı ve mutasyon çeşitlerine göre listelendi. Hasta serumlarından elde edilen HBV DNA, HBV tüm genom olacak şekilde çoğaltıldı ve bir TA vektörüne klonlandı. Elde edilen klonların viral polimeraz bölgesindeki mutasyonlar DNA dizi analizi yöntemiyle tanımlandı. Bulunan mutasyonların ilaç direnç profilleri hücre kültüründe in vitro fenotipleme deneyleriyle belirlendi. In vitro fenotipleme deneyi ile elde edilen klonlardaki test edilecek mutasyonları taşıyan HBV genomlarının Huh7 hücre kültürlerinde ekspresyonları yapıldı. Bu HBV varyantlarına karşı değişik antivirallerin ekspresyonu baskılama aktiviteleri test edildi ve tespit edilen mutasyon paternlerinin antiviral direnç profilleri ortaya çıkarıldı.
Özet (Çeviri)
One third of the world?s population has been exposed to hepatitis B virus (HBV). HBV infection is an epidemiological problem throughout the world, including Turkey. Development of drug resistance is a major limitation to the effectiveness of antivirals Drug resistant hepatitis B virus mutants frequently arise, leading to treatment failure and progression to liver disease.In this study, sequencing analysis of the polymerase gene region of HBV extracted from serum samples of the patients who had been admitted to our clinics has been done. HBV DNA extracted from serum samples of the patients has been amplified as HBV full genome and cloned into a TA vector. Mutations in the HBV polymerase region of the clones have been identified by DNA sequencing method. Resistance profiles of the identified mutations have been clarified in cell culture using in vitro phenotyping assay. Expression of HBV genomes bearing mutations to be tested in in vitro phenotyping assays have been done in Huh7 cell cultures. The suppression activity of different antivirals on these HBV variants has been tested and antiviral resistance profile of these mutation patterns has been clarified.
Benzer Tezler
- HBV infeksiyonunun lamivudin ile tedavisinde direnci belirleyen üç mutasyon paterninin moleküler karakterizasyonu
Molecular characterization of three mutation patern which determine resistance in treatment of HBV infection with lamivudine
FİKRET AYDEMİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2004
GastroenterolojiAnkara ÜniversitesiTemel Hepatoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MİTHAT BOZDAYI
- SBÜ Ankara Eğitim ve Araştırma Hastanesi Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Kliniği tarafından takipli HIV ile enfekte olgularda antiretroviral tedavi değişiklikleri ve nedenlerinin retrospektif irdelenmesi
A retrospective investigation of antiretroviral treatment changes and causes in hiv-infected cases followed by The Department of Infectious Diseases and Clinical Microbiology of SBÜ Ankara Training and Research Hospital
HÜSEYİN ESMER
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiSağlık Bilimleri ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Bakteriyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATMA ŞEBNEM ERDİNÇ
UZMAN ŞERİFE ALTUN DEMİRCAN
- Influenza nöraminidaz inhibitörlerine karşı fenotipik direnç araştırması
Phenotypic detection of resistance against influenza neuraminidase inhibitors
MERVE TULUNOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
Mikrobiyolojiİstanbul ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. OSMAN ŞADİ YENEN
- Gram negatif bakterilerde plazmid aracılı kinolon direnci varlığının araştırılması
Investigation of the presence of plasmid mediated quinolone resistance in gram negative bacteria
PELİN TAŞKIN
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
MikrobiyolojiMarmara ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MÜNEVVER UFUK HASDEMİR
- Computational approaches to study drug resistance mechanisms
İlaç direnç mekanizmaları için işlemsel yaklaşımlar
ZOYA KHALID
Doktora
İngilizce
2017
BiyolojiSabancı ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
Prof. Dr. İSMAİL ÇAKMAK