Direnç mutasyonları gösteren HBV mutantlarının belirlenmesi ve bu mutantların çeşitli antivirallere karşı direnç profillerinin in vitro fenotipleme yöntemi ile karakterizasyonu
Determination of novel HBV mutants and characterization of their resistance profiles against different antivirals using in vitro phenotyping method
- Tez No: 301051
- Danışmanlar: PROF. DR. A. MİTHAT BOZDAYI
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Hepatit B virüsü, Hepatitis B virus
- Yıl: 2011
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Biyoteknoloji Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Dünya populasyonunun üçte biri hepatit B virüsüne maruz kalmıştır. HBV infeksiyonu tüm dünyada ve Türkiye'de epidemiyolojik bir problemdir. İlaç direncinin gelişimi antivirallerin uzun vadeli etkinliğini önemli ölçüde sınırlamaktadır. Sıklıkla oluşan ilaca dirençli hepatit B virüsü mutantları, tedavi başarısızlığına ve karaciğer hastalığında ilerlemeye sebep olur.Çalışmamızda kliniğe başvurmuş serumlarında HBV virüsü tespit edilmiş hastaların, hepatit B virüsü polimeraz gen bölgesinin dizi analizi yapıldı ve mutasyon çeşitlerine göre listelendi. Hasta serumlarından elde edilen HBV DNA, HBV tüm genom olacak şekilde çoğaltıldı ve bir TA vektörüne klonlandı. Elde edilen klonların viral polimeraz bölgesindeki mutasyonlar DNA dizi analizi yöntemiyle tanımlandı. Bulunan mutasyonların ilaç direnç profilleri hücre kültüründe in vitro fenotipleme deneyleriyle belirlendi. In vitro fenotipleme deneyi ile elde edilen klonlardaki test edilecek mutasyonları taşıyan HBV genomlarının Huh7 hücre kültürlerinde ekspresyonları yapıldı. Bu HBV varyantlarına karşı değişik antivirallerin ekspresyonu baskılama aktiviteleri test edildi ve tespit edilen mutasyon paternlerinin antiviral direnç profilleri ortaya çıkarıldı.
Özet (Çeviri)
One third of the world?s population has been exposed to hepatitis B virus (HBV). HBV infection is an epidemiological problem throughout the world, including Turkey. Development of drug resistance is a major limitation to the effectiveness of antivirals Drug resistant hepatitis B virus mutants frequently arise, leading to treatment failure and progression to liver disease.In this study, sequencing analysis of the polymerase gene region of HBV extracted from serum samples of the patients who had been admitted to our clinics has been done. HBV DNA extracted from serum samples of the patients has been amplified as HBV full genome and cloned into a TA vector. Mutations in the HBV polymerase region of the clones have been identified by DNA sequencing method. Resistance profiles of the identified mutations have been clarified in cell culture using in vitro phenotyping assay. Expression of HBV genomes bearing mutations to be tested in in vitro phenotyping assays have been done in Huh7 cell cultures. The suppression activity of different antivirals on these HBV variants has been tested and antiviral resistance profile of these mutation patterns has been clarified.
Benzer Tezler
- HBV infeksiyonunun lamivudin ile tedavisinde direnci belirleyen üç mutasyon paterninin moleküler karakterizasyonu
Molecular characterization of three mutation patern which determine resistance in treatment of HBV infection with lamivudine
FİKRET AYDEMİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2004
GastroenterolojiAnkara ÜniversitesiTemel Hepatoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MİTHAT BOZDAYI
- Akdeniz ve Ege bölgesi'nden örneklenen Bemisia tabaci popülasyonlarının biyotiplerinin ve insektisit direnç mutasyon frekanslarının belirlenmesi
Determination of biotypes and insecticide resistance mutation frequencies in Bemisia tabaci populations sampled from the Mediterranean and Aegean regions
ÖMER YÜZER
Doktora
Türkçe
2025
GenetikMuğla Sıtkı Koçman ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ALPER TONGUÇ
- Influenza nöraminidaz inhibitörlerine karşı fenotipik direnç araştırması
Phenotypic detection of resistance against influenza neuraminidase inhibitors
MERVE TULUNOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
Mikrobiyolojiİstanbul ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. OSMAN ŞADİ YENEN
- Klinik streptococcus pneumonıae izolatlarında makrolid direnç mekanizmalarının araştırılması
Investigation of macrolide resistance mechanisms in clinical streptococcus pneumoniae isolated
PINAR SAĞIROĞLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2009
MikrobiyolojiMarmara ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MÜNEVVER UFUK HASDEMİR
- Kandidemi Etkeni Olan Candida parapsilosis İzolatlarının Tüm Genom Analizi ile Klonal İlişkilerinin ve Direnç Genlerinin Değerlendirilmesi
Whole-Genome Analysis of Candida parapsilosis Isolates Causing Candidemia: Assessment of Clonal Relatedness, Antifungal Resistance Genes and Virulence Factors
ESRA TAVUKCU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2026
MikrobiyolojiSağlık Bilimleri ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İPEK MUMCUOĞLU