Geri Dön

Tüm eksom dizileme yöntemi ile arteriovenöz malformasyonlarda somatik mutasyon incelenmesi

Somatıc mutatıon analysıs ın arterıovenous malformatıons by total exome sequencıng

PDF İndir

  1. Tez No: 301258
  2. Yazar: BARAN YILMAZ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. TÜRKER KILIÇ
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Nöroşirürji, Neurosurgery
  6. Anahtar Kelimeler: AVM, Ekzom, Mutasyon, Arteriovenöz malformasyonlar, Malformasyonlar, Serebrovasküler bozukluklar, Vasküler hastalıklar, AVM, Exome, Mutation, Arteriovenous malformations, Abnormalities, Cerebrovascular disorders, Vascular diseases
  7. Yıl: 2011
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Marmara Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Nöroşirürji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Serebrovasküler malformasyonlar, arteriovenöz malformasyonlar(AVM), kavernöz malformasyonlar(CM), venöz anjiomlar(VA) ve kapiller telanjiektaziler olmak üzere dört tiptir. AVM'ler semptom oluşturan en sık vasküler malformasyonlardır.AVM'lerin moleküler patogenezlerinin anlaşılmasında azımsanmayacak yol kat edilmiş olsa da, elde edilen bulgular, bu malformasyonların oluşum ve gelişim nedenlerinin aydınlatılması konusunda henüz çok yetersizdir.Bu çalışmada, AVM'lerin patofizyolojisinde rol aldığı düşünülen ve gelişme sırasında defekti olan genlerin fonksiyonlarını yerine getirememelerinden kaynaklanan bu hastalıkta, total ekzom dizileme yöntemi kullanılarak, genom içerisinde RNA ifadelenmesi ve dolayısıyla protein üretimde görevleri olan ekzomlardan mutasyon olanları belirlenmiştir.Çalışmada, Marmara Üniversitesi Nöroşirurji Anabilim Dalı ve Marmara Üniversitesi Nörolojik Bilimler Enstitüsü bünyesinde yapılan ameliyatlarla cerrahi olarak çıkarılmış AVM dokuları ve bu hastalara ait kan örnekleri kullanılarak eşleştirilmiş dizileme yapılmıştır.Sonuçların two-tailed Fischer's exact test ile istatistiksel analiziyle p<10-4 olan somatik mutasyon olan genler belirlendi. Bu genler, ZGPAT, QTRT1, ANO7, HMHA1, HSPG2, SIGLEC1, ADAMTSL4, CROCC ve LAMA5'dir.Belirlenen genlerin fonksiyonel araştırmaları ve model transgenik hayvan çalışmalarından elde edilecek bulguların değerlendirilmesi ile AVM'nin moleküler patogenezinin aydınlatılması konusunda önemli yol katedileceği beklenebilir.

Özet (Çeviri)

Arteriovenous malformations(AVM), cavernous malformations(CM), venous anjiomas(VA) and capillary telengiectasias are four types of cerebrovasküler malformations. AVM?s are the most common symptomatic vascular malformations.The knowledge about molecular pathogenesis of AVM?s has been improving, however, it is still inadequate to identify the factors in development of AVM?s.Descriptive studies about expression of many molecules in angiogenesis and also some functional studies are unable to explain the mechanism of molecular pathogenesis of AVM?s.In this study, we identified the putative somatic mutations in genes that have role in pathophysiology of AVM?s. Total exome sequencing analysis has been used in idetifying the mutated genes.We performed whole exome capture and Illumine sequencing on AVM-blood pairs from subjects who were operated in Marmara University Department of Neurosurgery and Institute of Neurological Sciences.For somatic mutation discovery, positions in both AVM and blood DNA were evaluated by two-tailed Fisher?s exact test p<10-4. The genes are ZGPAT, QTRT1, ANO7, HMHA1, HSPG2, SIGLEC1, ADAMTSL4, CROCC and LAMA5.Functional researchs and transgenic animal model studies about these genes that have somatic mutations will make significant progress in enlightening the molecular pathogenesis of AVM?s.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    452560

    Tüm ekzom dizileme yöntemi ile şizofreniye yol açabilecek aday genlerin belirlenmesi

    Using whole-exome sequencing to identify candidate genes for schizophrenia

    VEYSEL DOĞAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    PsikiyatriBülent Ecevit Üniversitesi

    Ruh Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ÖMER ŞENORMANCI

  2. Tez No

    576260

    Progresif miyoklonik epilepsilerde tüm ekzom dizileme yöntemi ile ilişkili genlerinin araştırılması

    Investigation of genes in progressive myoclonic epilepsies with all whole exome sequencing

    GAREN HARYANYAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Genetikİstanbul Üniversitesi

    Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SİBEL AYLİN UĞUR İŞERİ

  3. Tez No

    741120

    Kalıtsal retinal distrofilerde genetik etiyolojinin tüm ekzom dizileme yöntemi ile retrospektif araştırılması

    Retrospective investigation of genetic etiology in inherited retinal dystrophies by whole exome sequencing

    ZÜLAL KELEŞ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    GenetikDokuz Eylül Üniversitesi

    Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYFER ÜLGENALP

  4. Tez No

    812506

    Adenomyozis tanılı bireylere sahip bir ailede tüm ekzom dizileme yöntemi ile aday varyantların tanımlanması

    Identification of candidate variants by whole exome sequencing in a family with individuals diagnosed with adenomyosis

    SEVCAN AYDIN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Genetikİstanbul Üniversitesi

    Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FEYZA NUR TUNCER KILINÇ

  5. Tez No

    870407

    Dört major ALS geni dışlanmış“ailesel amiyotrofik lateral skleroz olgularında”tüm ekzom dizileme yöntemi ile patojenik varyasyonların araştırılması

    Investigation of pathogenic variations by whole exome sequencing in familial amyotrophic lateral sclerosis cases excluding four major ALS genes

    VİLDAN ÇİFTÇİ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    GenetikAkdeniz Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SİBEL KARAÜZÜM

    PROF. DR. AYŞE NAZLI BAŞAK

Geri Dön