Screening of new drug candidates with antitumor assays
Anti tümör deneyleriyle yeni ilaç adaylarının taranması
- Tez No: 305852
- Danışmanlar: PROF. DR. BARKIN BERK, PROF. DR. IŞIL AKSAN KURNAZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2012
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Yeditepe Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Bölümü
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 74
Özet
İlaç geliştirme süreci, keşif ve araştırma, klinik öncesi çalışmalar, klinik çalışmalar ve onay olmak üzere dört ana fazdan oluşur. Keşif ve araştırma süreci boyunca ele alınan temel konulardan biri sentezlenmiş ya da taranmış bileşiklerin farmokolojik aktivitelerinin belirlenmesidir. Çalışmamız sırasında Yeditepe Üniversitesi Eczacılık Fakültesi tarafından sentezlenen, 4-(1,3-dioksiisoindolin-2-yl) benzensülfonomid ve 4-(4,5,6,7-tetrafloro-1,3-dioksiizoindolin-2-yl) benzensulfonamid kimyasal yapısındaki talidomid türevleri, 4-fenilpiperidin türevi olan sigma reseptör ligandları, 1-(naftalin-2-ylmetil) yapısındaki piperazin türevleri, SH-SY5Y insan nöroblastoma hücre hattı, HT29 insan kolon kanseri hücre hattı, MDA-MB-231 insan meme kanseri hücre hatları kullanılarak anti-tümor akitivitelerinin belirlenmesi için taranmıştır. Bileşiklerin sitotoksik etkileri sağlıklı fare fibroblast hücresi olan L929 hücre hattı üzerinde MTT deneyleri ile taranmıştır. Elde edilen sonuçlar bu üç gruptan bazı bileşiklerin klinik kullanımlar için uygun olarak nitelendirilebilecek önemli antitumor aktiviteye sahip olduğunu göstermiştir. Bu ilaç adaylarının etki mekanizmasını anlamak için, hücrelere uygulandıktan sonra hücrelerin DNAsındaki çeşitli genlerin ekspresyon seviyeleri incelenmiştir. Bu aşamada ön çalışma olarak p21, cyclinD-1, c-fos and elk-1 gibi belli başlı hücre döngüsü genlerinin PZR analizlerine odaklanılmıştır. Ancak moleküler mekanizmaların detaylı bir şekilde anlaşılabilmesi için daha kapsamlı moleküler analizler gerekmektedir. Bu aşamada ön çalışma olarak p21, cyclinD-1, c-fos and elk-1 gibi belli başlı hücre döngüsü genlerinin PZR analizlerine odaklanılmıştır. Ancak moleküler mekanizmaların detaylı bir şekilde anlaşılabilmesi için daha kapsamlı moleküler analizler gerekmektedir.
Özet (Çeviri)
Drug development process consists of discovery and research, preclinical studies, clinical trials and approval phases. During discovery and research process, one of the main issues is pharmacological activity determination of either synthesized, proposed or screened compounds. During our study, selected candidates having chemical structures that were 4-(1,3-dioxoisoindolin-2-yl) benzenesulfonamide and 4-(4,5,6,7-tetrafluoro-1,3-dioxoisoindolin-2-yl) benzenesulfonamide structured thalidomide derivatives, 4-phenylpiperidine derivatives for sigma receptor ligands, 1-(naphthalen-2-ylmethyl) piperazine derivatives synthesized in Yeditepe University, Faculty of Pharmacy were screened for their anti-tumor activity by using SH-SY5Y human neuroblastoma cell line, HT29 human colon cancer cell line, MDA-MB-231 human breast cancer cell line. As a healthy control, cytotoxic effects of compounds were assed using L929 mouse fibroblast cell line by MTT experiment. The results showed that some compounds belonging to all three of these groups have significant anti-tumor activity that may qualify them to be suitable candidates for clinical use. In order to understanding the mode of action of these putative drug candidates, examination of expression levels of different genes in cells? DNA after the exposure has been carried out; our preliminary work has at this stage concentrated on RT-PCR analysis of common cell cycle-related genes such as p21, cyclin D1, c-fos and elk-1. However, further detailed molecular analysis will be required to get an in-depth understanding of the molecular mechanisms.
Benzer Tezler
- Sanal tarama ve çok boyutlu moleküler modelleme yöntemleri ile p53-MDM2 potansiyel inhibitörlerinin belirlenmesi
Identification of p53-MDM2 potential inhibitors with virtual screening and multidimensional molecular modeling methods
GÜLŞAH AYDIN
Doktora
Türkçe
2020
Kimyaİstanbul Teknik ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MİNE YURTSEVER
PROF. DR. SERDAR DURDAĞI
- HIV-1 proteaz enziminin inhibitörleriyle etkileşimi esnasındaki konformasyonel değişikliklerin teorik incelemesi ve yeni analogların tasarımı
Theoretical investigation on conformational changes of HIV-1 protease enzyme during interaction with its inhibitors and design of new analogues
MERVE SENEM AVAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
Eczacılık ve FarmakolojiHacettepe ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. VİLDAN ADAR
- Prediction of drug response in cancer using hybrid deep neural networks
Hibrit derin sinir ağları ile kanserde ilaç yanıt tahmini
BURAKCAN İZMİRLİ
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve KontrolHacettepe ÜniversitesiBilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. TUNCA DOĞAN
- Rekombinant olarak üretilecek Helicobacter pylori Fabl'nın ilaç hedefi olarak değerlendirilmesi
Evaluation of recombinant Helicobacter pylori Fabl as a drug target
RECEPCAN ATLI
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
BiyomühendislikYıldız Teknik ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DİLEK TURGUT BALIK
- Yapay öğrenme bazlı hesaplamalı modelleme ile geniş çaplı kanser hücre hattı ilaç yanıt tahmini
Comprehensive cancer cell line drug response prediction by machine learning based computational modelling
UMUT ONUR ÖZCAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve KontrolHacettepe ÜniversitesiBiyoenformatik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. TUNCA DOĞAN