Geri Dön

Sert çekirdeklilerde bakteriyel kansere neden olan Pseudomonas syringae pathovarlarının klasik ve moleküler yöntemlerle tanısı

Classical and molecular diagnosis of Pseudomonas syringae pathovars causing bacterial canker on stone fruits

  1. Tez No: 307521
  2. Yazar: DAMLA ERTİMURTAŞ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. HATİCE ÖZAKTAN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Ziraat, Agriculture
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2012
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ege Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 82

Özet

Bu tez çalışmasında; Ege Üniversitesi Bitki Koruma Bölümü Bakteriyoloji laboratuarı stoklarında bulunan, daha önce şeftali ve kiraz gibi sert çekirdekli meyve ağaçlarında bakteriyel kanser belirtilerinden izole edilmiş Pseudomonas syringae pathovarlarının, LOPAT (levan oluşumu, oxidase, patateste pektolitik aktivite, arginin dehidrolaz, tütünde aşırı duyarlılık reaksiyonu testi), GATTa testleri (jelatinin hidrolizi, aesculinin hidrolizi, tyrosin aktivitesi, tartaric acid), karbon kaynaklarında asit oluşumu testi (mannitol, sorbitol, inositol, erythritol, tartaric acid, lactic acid, tyrosin) gibi klasik yöntemlerin yanı sıra; patojenisite ve patolojik temelli fitotoksinlerinin dikkate alındığı in vitro' da syringomycin üretiminin ve buz çekirdeği oluşturma aktivitesinin (INA) saptanması gibi tanılama yöntemleri ile tanısı yapılmıştır. Bu testleri geçen Pseudomonas syringae pv. syringae (Pss) ve Pseudomonas syringae pv. morsprunorum (Psm) izolatlarının, ayrıca, moleküler yöntemlerle de kesin tanısı gerçekleştirilmiştir. Pss' nin syringomycin sentezinden sorumlu syrB geni ve Psm' nin coronatine sentezinden sorumlu cfl geninin moleküler tanısı, klasik PCR testi ile yapılmıştır. P. syringae pathovarlarının ayırt edilmesinde kullanılan cts, gapA, gyrB ve rpoD genlerinin sekans analizleri de A.B.D. Oregon State Üniversitesi Biyolojik Bilimler Fakültesi Moleküler Biyoloji laboratuarında yapılmıştır. Klasik ve moleküler tanılama testleri sonucunda, testlenen 15 P. syringae pathovarının 9' unun Pss olduğu sonucuna varılmıştır.

Özet (Çeviri)

In this thesis; Pseudomonas syingae pathovars which previously were isolated from the bacterial canker simptoms on stone fruits, such as peach, cherry, and kept in Bacteriology lab stocks in Department of Plant Protection of Ege University, were identified based on in addition to some classical methods such as LOPAT (levan, oxidase, potato rot pectolytic activity, arginin dihydrolase, hypersensitive reaction on tobacco leaves), GATTa tests (gelatin liquefaction, aesculin hydrolysis, tyrosinase activity, utilization of tartaric acid), utilization of carbon sources (mannitol, sorbitol, inositol, erythritol, tartaric acid, lactic acid, tyrosin), pathogenicity and taken into account based on pathological phytotoxin that which was production of syringomycin, ice nucleation activity (INA) were used for the identification. Pseudomonas syringae pv. syringae (Pss) and Pseudomonas syringae pv. morsprunorum (Psm) isolates were also identified by molecular methods. After conventional and pathogenicity tests resulted, molecular diagnosis of Pss strains were based on syrB gene which is responsible for synthesis of syringomycin and Psm strains were based on cfl gene which is responsible for synthesis of coronatine, were performed using PCR test. Also, cts, gapA, gyrB ve rpoD genes sequence analysis which were performed in Molecular Biology lab of Faculty of Biological Science, Oregon State University, U.S.A. were used to distinguish for P. syringae pathovars. As a result of classical and molecular diagnostic methods; were identified out 9 of 15 P. syringae pathovars as Pss.

Benzer Tezler

  1. Kuzey Doğu Anadolu bölgesinde yetiştirilen sert çekirdekli meyve ağaçlarında hastalık oluşturan bakteriyel patojenlerin tanısı

    Identification of bacterial organisms from stone fruits grown in North Eastern Anatolia region of Turkey

    ARZU ALÂ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    ZiraatAtatürk Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    DOÇ.DR. FİKRETTİN ŞAHİN

  2. Şeftali, nektarin ve kayısılarda şarka hastalığına dayanıklılık ıslahı üzerine araştırmalar

    Researches on resistance breeding of sharka disease in peach, nectarine and apricots

    CEREN ÜNEK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    BiyoteknolojiÇukurova Üniversitesi

    Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYZİN KÜDEN

  3. Malatya İlinde yetiştirilen sert çekirdekli meyve ağaçlarındaki virusların tanılanması üzerinde araştırmalar

    Studies on the identification of viruse in stone fruit trees growing in malatya province

    İBRAHİM ÖZER ELİBÜYÜK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1998

    ZiraatAnkara Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. GÜRSEL ERDİLLER

  4. Ceyhan ovası topraklarının potansiyel arazi kullanım planlaması

    Potential land use planning of Ceyhan plain soils

    EVREN ERKOCU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    ZiraatÇukurova Üniversitesi

    Toprak Bilimi ve Bitki Besleme Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SUAT ŞENOL

  5. Yüzüncü Yıl Üniversitesi kampüs alanı topraklarının detaylı toprak etüd, haritalanması ve arazi kullanım planlaması

    The Detailed survey an mapping of the soils of the Yüzüncü Yıl Campüs area and land use planning

    HİKMET GÜNAL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1995

    ZiraatÇukurova Üniversitesi

    PROF.DR. URAL DİNÇ