Çanakkale ilinde pırasa sarı çizgi virüsü (Leek yellow stripe virus; LYSV)'nün biyolojik ve moleküler karakterizasyonu
Biological and molecular characterization of leek yellow stripe virus (LYSV) in Canakkale province
- Tez No: 309566
- Danışmanlar: PROF. DR. SAVAŞ KORKMAZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2012
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 56
Özet
Bu çalışmada Çanakkale il ve ilçelerinden 2009-2010 üretim yılı içinde bir sörvey çalışması yürütülerek Pırasa sarı çizgi virüsü (Leek yellow stripe virus; LYSV)'ne benzer simptom gösteren pırasa bitkilerinden 77 örnek toplanmıştır. Toplanan örnekler LYSV'nin varlığını belirlemek amacı ile DAS-ELISA ve RT-PCR analizleri ile test edilmiştir. DAS-ELISA ve RT-PCR testleri sonucunda 77 örnekten 51 tanesi LYSV ile infekteli bulunmuştur. İnfekteli bulunan örnekler içerisinden elde edildiği ilçeler göz önünde bulundurularak belirli sayıda izolat biyolojik özelliklerini belirlemek amacı ile değişik gösterge bitkilere mekanik inokulasyon yöntemi ile inokule edilmiş, moleküler özelliklerini belirlemek amacı ile kılıf protein genleri klonlanarak nükleik asit dizilimleri belirlenmiştir. Klonlama ve sekans analizi yapılan LYSV izolatlarına özgü kılıf protein genlerinin nükleotid dizilimleri gen bankasında bulunan ve dünyanın farklı üretim bölgelerinden LYSV izolatlarının CP genleriyle karşılaştırılmıştır. Bu karşılaştırmalar sonucunda ülkemiz LYSV izolatlarının CP genlerinin nükleotid düzeyinde % 97-98, dünya izolatları ile % 77-95 oranında bir benzerliğe sahip olduğu bulunmuştur. Yapılan filogenetik analizler sonucunda ise Çanakkale izolatlarının dünyanın farklı bölgelerindeki izolatlarla farklı düzeylerde genetik ilişki gösterdiği saptanmıştır. Ayrıca bu izolatlar Western blot analizi yöntemiyle kılıf proteinleri analiz edilmiştir. Western blot analizi çalışmalarında tüm izolatlara özgü 34 kDa ağırlığında kılıf proteini elde edilmiştir.
Özet (Çeviri)
In this study, a survey was conducted in Canakkale Province and subprovince in leek plants that shows Leek yellow stripe virus-like symptoms in year 2009-2010. A total of 77 samples were collected from these areas and tested by DAS-ELISA and RT-PCR for the presence of LYSV. As a result of the DAS-ELISA and RT-PCR analysis 51 out of 77 samples were found infected with LYSV. The sap of the infected plant samples were inoculated into LYSV sensitive indicator plants to determine the biological characteristics. Isolates obtained as the pure isolates were grouped based on biological characteristics and locations where they were isolated. The coat protein genes of some isolates representing each group were cloned and sequenced. Isolates were further characterized here and the sequences obtained from LYSV isolates of Canakkale were compared with known sequences from other parts of the world to determine the genetic differences and evolutionary relationships among LYSV isolates from Canakkale and the other parts of the world. Comparison of CP genes revealed that CP gene of LYSV isolates from Canakkale Province and subprovince showed 97-98 % and isolates with the world 77-95 % identity in their nucleotide sequences, respectively. Phylogenetic analysis of the CP gene sequences showed that LYSV isolates from Canakkale provinces and subprovinces different level of genetic relationship with LYSV isolates from world. In this case the method isolates proteins were analyzed by Western blot analysis. Western blot analysis studies specific to all isolates were obtained from 34 kDa coat protein.
Benzer Tezler
- Otel işletmelerinde çalışanların örgütsel güven ve iş tatminleri arasındaki ilişki: Çanakkale örneği
Examining organizational trust and job satisfaction of employees in hotel enterprises: Çanakkale province example
BURCU GÜÇLÜ
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
TurizmÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiTurizm İşletmeciliği Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ MESUT BOZKURT
- Bazı pırasa çeşit ve hatlarının derin dondurulmaya uygunlukları üzerine bir araştırma
Başlık çevirisi yok
BERRİN EMENLİ
- Dereyalak Köyü (Eskişehir) çevresindeki agat ve opal oluşumlarının jeolojisi ve ekonomik önemi
Geology and economic of the agate and opals of dereyalak (Eskişehir)
UĞUR ARZOĞULLARI
Yüksek Lisans
Türkçe
2007
Jeoloji MühendisliğiÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiJeoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. AYTEN ÇALIK
- Küreselleşmenin kalkınma açısından yoksulluğa etkisi: Yükselen ekonomiler ve Türkiye örneği
The effect of globalization on poverty from development angle: Emerging economies and Turkey cases
SEVCAN AYDIN
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
EkonomiÇanakkale Onsekiz Mart Üniversitesiİktisat Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ MESUT SAVRUL
- Sakin şehir uygulamasının yerel ekonomik kalkınma üzerine etkisi; Seferihisar örneği
The effect of the earth city implementation on local economic development: Seferihisar sample
HASAN ALİ CAN TABAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
EkonomiÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiÇalışma Ekonomisi ve Endüstri İlişkileri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÖZGÜR TOPKAYA