Geri Dön

Keratokonjonktivit yapan adenovirusların genotip prevalansı

Genotype prevalance of adenoviruses causing keratoconjunctivitis

PDF İndir

  1. Tez No: 310028
  2. Yazar: BEGÜM NALÇA ERDİN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. AYÇA ARZU SAYINER
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: adenovirus, genotip, keratokonjonktivit
  7. Yıl: 2012
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 60

Özet

Adenoviruslar insanda solunum sisteminde, gözde, üriner sistemde ve gastrointestinal sistemde enfeksiyonlara neden olabilmektedirler. Bunlar arasında en sık rastlanan keratokonjonktivitlerdir. Keratokonjonktivite sıklıkla genotip 3, 4, 8, 19 ve 37 neden olur. Adenovirus keratokonjonktivitleri çok bulaşıcıdır ve epidemilere neden olabilir. Bu yüzden tanının hızlı ve doğru yapılması önemlidir. Tanıda sıklıkla hızlı, duyarlı ve özgül bir yöntem olan PCR kullanılmaktadır. Genotipin belirlenmesi, spesifik tiplerle klinik tablo arasındaki ilişkiyi belirlemek ve virusun coğrafi dağılımını takip edebilmek açısından önemlidir. Bu konuda başta A.B.D ve Japonya kökenli olmak üzere yapılmış bir çok çalışma olmakla birlikte Türkiye ile ilgili veriler sınırlıdır. Bu çalışmada 2006-2010 yılları arasında Dokuz Eylül Üniversitesi Hastanesi'ne başvuran keratokonjonktivitli olgulardaki adenovirusların genotip prevalansının belirlenmesi amaçlanmıştır.Dokuz Eylül Üniversitesi Hastanesi Moleküler Mikrobiyoloji Laboratuvarı'na, 2006 Ocak ve 2010 Ağustos ayları arasında viral konjonktivit / keratokonjonktivit ön tanısı ile gönderilen 488 konjonktiva sürüntüsünden PCR ile adenovirus DNA pozitif bulunan 213 örnek (%44) çalışma grubunu oluşturmuştur. Bunlardan 101 tanesi (%47) randomize olarak seçilerek DNA dizi analizi ile genotiplendirilmiştir. Genotiplendirme için viral hexon geninin ?Hypervariable Region 7? (HVR-7) bölgesini de içeren ve genotipe göre farklılık gösteren 605-629 nükleotidlik fragman PCR ile saptanmış, elde edilen amplikonların sekans analizi yapılarak, referans ?Gen-Bank? dizileriyle birlikte filogenetik ağaç yardımıyla değerlendirilmiştir. Genotiplendirme çalışmaları Erasmus Üniversitesi Viroloji Departmanı'nda gerçekleştirilmiştir.Örneklerde 3, 4, 8, 11, 19, 22 ve 37 olmak üzere 7 adenovirus genotipi saptanmıştır. 101 örneğin %66.3'ünde genotip 8 ve %24.7'sinde genotip 4 bulunmuştur. Diğer beş genotip, örneklerin %8.9' unu oluşturmuştur. Genotip 8, 2008 dışındaki tüm yıllarda en sık saptanan genotip olurken, 2008 yılında en sık genotip 4'e rastlanmıştır.Genotip 8, 2006 ve 2010 yılları arasında merkezimizde en sık rastlanan genotip olmuştur. Daha önce yapılan çalışmalarda da genotip 8'in birçok ülkede hem sporadik enfeksiyonlar hem de salgınlar sırasında en sık rastlanan genotip olduğu bildirilmiştir. Türkiye'de oküler örneklerde adenovirus genotiplerini belirleyen iki adet çalışma vardır. Bu çalışmalarda incelenen örnek sayıları azdır ve çalışmalardan biri salgın incelemesidir. Her iki çalışmada da genotip 8 en sık saptanan genotip olmuştur.Çalışmamız bu konuda Türkiye'de yapılan ve yaklaşık 5 yıllık bir dönemde değişiklikleri inceleyen ilk kapsamlı çalışmadır. Çalışmanın kısıtlılıkları, tek merkezli olması ve hastaneye başvuran olguları değerlendirmesidir. Türkiye'de adenoviruslara bağlı göz enfeksiyonlarının epidemiyolojisini değerlendirmek için daha geniş kapsamlı çalışmalara ihtiyaç vardır.

Özet (Çeviri)

Adenoviruses are common human pathogens that cause infections in eye, urinary system and gastrointestinal system. Keratoconjunctivitis is the most common type of adenoviral infection which is usually related to genotype 3, 4, 8, 19 and 37. Rapid and accurate diagnosis of adenoviral keratoconjunctivitis is necessary since it is very contagious and can cause epidemics. PCR is the most-preferred diagnostic method due its rapid, sensitive and specific nature. Genotyping of the adenovirus is also required in order to determine the relation between a specific type and clinical presentation and follow the geographical distribution of the virus. Many studies, especially from Japan and USA, have been published related to the topic, yet there is very limited data about ocular adenoviral infections in Turkey. This study aimed to determine the adenovirus genotypes among the patients with keratoconjunctivitis followed in Dokuz Eylül University Hospital between 2006 and 2010.Between January 2006 and August 2010, 488 conjunctival swab samples of patients with a diagnosis of viral conjunctivitis / keratoconjunctivitis have been sent to the Molecular Microbiology Laboratory of Dokuz Eylül University Hospital to be tested for adenoviruses. Forty-four percent of these samples (213 of 488) have been found to be positive for the adenoviral DNA with PCR and generated the study group. Forty-seven percent of (101 of 213) positive samples were randomly chosen and genotyped by sequence analysis. Fragment of the hexon gene made up of 605-629 nucleotides, containing ?Hypervariable Region 7? (HVR-7), has been targeted for the sequencing. Amplicons and the reference Gen-Bank sequences were analyzed by a phylogenetic tree. Genotyping studies were carried out in Erasmus University Virology Department.Seven genotypes including 3, 4, 8, 11, 19, 22 and 37 were determined in the samples of the study. Type 8 was the dominant genotype detected in 67 samples (66.3%) while the second common genotype was 4 which determined in 25 (24.7%) of the samples. Other five genotypes were isolated in 8.9% of the samples. Genotype 8 was the most common type detected during the five-year period, except 2008, in which genotype 4 was the dominant type.Genotype 8 was found to be the most common genotype between 2006 and 2010 in our center. Genotype 8 has been reported as the predominant genotype worldwide in both sporadic infections and during epidemics. There are two published studies about the adenovirus genotypes in ocular infections in Turkey. Although, sample size is very small and one of them is an investigation of an epidemic, genotype 8 is also the predominant genotype in both of the studies.In conclusion, this is the first comprehensive study, providing data related to genotypes of adenoviruses that cause ocular infections and their variations during a five-year period in Turkey. Main limitations of the study are that it evaluated a single center and only patients applying to the hospital. Further studies are needed to understand the epidemiology of adenoviral ocular infections in Turkey.Key words : adenoviruses, genotype, keratoconjunctivitis

Benzer Tezler

  1. Tez No

    33386

    Kontakt lens entolerans ve komplikasyonları

    Başlık çevirisi yok

    O. MURAT AKSOY

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1989

    Göz HastalıklarıÇukurova Üniversitesi

    Göz Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. T. REHA ERSÖZ

  2. Tez No

    377979

    Ultraviyole B ışınına maruz bırakılan rat gözlerinde retinol palmitatın fotokeratit oluşumunu önleyici etkisinin değerlendirilmesi

    The evaluation of the preventive effect of retinol palmitate on phototoxic keratitis formation on ultraviolet B exposed rat eyes

    MEHMET CANER FİLİZAY

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    Göz HastalıklarıKırıkkale Üniversitesi

    Göz Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. NESRİN BÜYÜKTORTOP GÖKÇINAR

  3. Tez No

    846274

    The role of oxidative stress factors in the pathophysiology of Ocular Rosacea, analysis of tears and other materials

    Oküler Rosacea patofizyolojisinde oksidatif stres faktörlerinin rolü, gözyaşı ve diğer materyallerin analizi

    NİLÜFER YEŞİLIRMAK

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    BiyokimyaGazi Üniversitesi

    Tıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NESLİHAN BUKAN

    PROF. DR. JEAN-LOUIS BOURGES

  4. Tez No

    624070

    Keratokonjonktivit ön tanılı hastalardan izole edilen adenovirüs suşlarının alt tiplendirilmesi

    Subtyping of adenovirus strains isolated from patients pre-diagnosed with keratoconjunctivitis

    AYFER GÜNER

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    MikrobiyolojiMarmara Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYŞEGÜL KARAHASAN

  5. Tez No

    434447

    Vernal keratokonjonktivit hastalarındaki korneal değişikliklerin korneal topografi ile değerlendirilmesi

    Evaluation of Corneal Changes of Patients Diagnosed with Vernal Keratoconjunctivitis with Corneal Topography

    ALİ HAKİM REYHAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Göz HastalıklarıAdıyaman Üniversitesi

    Göz Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. ŞEMSETTİN BİLAK

Geri Dön