Bazı Orthrias (Çöpçü balığı) türlerinin biyoinformatik ve deneysel karakterizyonu
Some Orthrias (Scavenger fish) species experimental and bioinformatics characterization
- Tez No: 310344
- Danışmanlar: DOÇ. DR. FİLİZ SUSUZ ALANYALI
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2012
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Anadolu Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 95
Özet
Taksonomi, biyolojinin genişlemesinde büyük bir payı olan ve bir bütün olarak biyoloji bilimi içinde dengenin kurulmasına yardımcı olan bir bilim koludur. Bu çalışmada Türkiye'de belirli havzalarda Orthrias cinsi türlerinin morfolojik ve moleküler veriler kullanılarak tanımlanması amaçlanmıştır. Yeni morfolojik karakterler tanımlanarak morfotipler elde edilmiş ve bu morfotipleri temsil eden örneklerin mitokondri DNA'sı cox1 ve 18S rRNA gen bölgelerinin dizisi çıkarılmıştır. Yapılan deneysel karakterizasyon sonucunda elde edilen genlerin cox1 ve 18S rRNA genleri olduğu belirlenmiştir. Ancak gen bankasında Orthrias türleri cox1 ve 18S rRNA genlerine ait dizi bilgileri mevcut olmadığından, karşılaştırılamamıştır. Gen bankası analizinde, Orthrias türlerinin içinde bulunduğu aile olan Balitoridae ailesi üyelerine benzerlik gösterdiği belirlenmiştir. Bu çalışmada cox1 geninin 650 bç'lik kısmının DNA barkodu olarak kullanılabileceği belirlenmiştir. Elde edilen tüm sonuçlar morfolojik sistematik çalışmalarının genetik temelli çalışmalarla desteklenmesi gerekliliğini ortaya koymaktadır.Glutatyon-S-transferaz (GST) ve Katalaz enzimleri canlılarda endojen ve ekzojen bileşiklerin detoksifikasyonu sağlarlar. OaGSTz ve OaCat'nın kirletici unsurlar altında mRNA miktarının zamana bağlı değişimi, yarı-kantitatif RT-PZR yöntemiyle analiz edilmiştir. Histopatolojik çalışmalar ışık ve elektron mikroskobik seviyede gerçekleştirilmiştir.
Özet (Çeviri)
Taxonomy is a field of science having a great role in the development of biology as well as contributing to the stabilization of the field as a whole. In this study, it was aimed to describe Certain basins in Turkey species of the genus Orthrias on the basis of morphological and molecular findings. Morphotypes are described from an analysis of new morphological characters and 18S rRNA and Cox1 gene of mtDNA is sequenced representing each morphotype. Gens which were obtained as a result of experimental characterization were determined as cox1 and 18S rRNA. However, as no sequence information of cox1 and 18S rRNA of Orthrias species was available at the gene bank, they weren?t compared. In the analysis of gene bank, it was determined that family showed similarity to Balitoridae, a family including Orthrias species. In this study, it was determined that 650 bp of cox1 gen can be used as a DNA barcode. All the results obtained proved that studies of systematic morphological should be supported with genetic based studies.Enzymes of Glutathione-S-transferase (GST) and Catalase help to detoxificate effects of endogen and exogenous toxic compounds in living organisms. Change in expression of OaGSTz and OaCat mRNA level under the stresses with time intervals was analyzed with semi-quantitative RT-PCR method. Histopathological examinations were conducted on light and electron microscopic levels.
Benzer Tezler
- Systematic and some ecological characteristics of the widespreat fish in the upper territory of the river Gediz
Gediz nehri üst havzalarında yayılış gösteren balıkların sistematik ve bazı ekolojik özellikleri
M. ALTUĞ ATALAY
Yüksek Lisans
İngilizce
2000
Su ÜrünleriSüleyman Demirel ÜniversitesiSu Ürünleri Temel Bilimleri Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. FAHRETTİN KÜÇÜK
- Dicle Nehri'nde su, sediment ve bentik bazı canlı organizmalardaki ağır metal birikiminin araştırılması
Investigation on the concentrations of heavy metals in water, sediment and some benthic organisms living from the Tigris River
HÜLYA KARADEDE
- Amanos dağ dereleri (35˚ 15' - 36˚ 20' D 36˚ 05' - 36˚ 40' K) balık faunası ve bazı habitat özelliklerinin belirlenmesi
Some habitat properties of fish fauna in the Amanos mountain streams (35˚ 15' - 36˚ 20' E 36˚ 05' - 36˚ 40' N)
EMEL OKUR
Yüksek Lisans
Türkçe
2004
BiyolojiMustafa Kemal ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
Y.DOÇ.DR. ŞÜKRAN YALÇIN ÖZDİLEK
- İznik gölü balıklarının taksonomisi ve Cyprinus carpio Linnaeus, 1758 (sazan), Rutilus frisii Nordmann, 1840 (akbalık) ve Atherina boyeri Risso, 1810 (gümüş balığı)'nın biyo-ekolojik yönden incelenmesi
Taxonomy of İznik lake fishes and investigation of the bio-ecological dimension of Cyprinus carpio Linnaeus, 1758 (carp), Rutilus frisii Nordmann, 1840 (black sea roach) and Atherina boyeri Risso, 1810 (big-scaled sand-smelt)
SANİYE CEVHER ÖZEREN
- Mert ırmağı (Samsun) balıklarının taksonomik ve faunistik yönden araştırılması
The investigation in point of taxonomic and faunatic of the river Mert (Samsun) fishes
SELMA HELLİ UĞURLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2000
BiyolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. NAZMİ POLAT