Schizophrenia: Another emphasis of ERBB4 and NRG1 impact on disease development
Şizofreni: ERBB4 ve NRG1 etkisinin hastalık gelişimi üzerine yeni bir kanıtı
- Tez No: 312111
- Danışmanlar: DOÇ. DR. HİLMİ ÖZÇELİK, PROF. A. NAZLI BAŞAK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2012
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 113
Özet
En sık görülen ruhsal bozukluklardan biri olan şizofreni, kompleks bir hastalıktır; Mendel tipi kalıtım göstermez. ERBB4-NRG1 aksının rolünün bulunmasıyla, bu genlerin şizofrenideki hem bağımsız, hem de interaktif etkilerini gösteren birçok çalışma yayınlandı; fakat bu çalışmaların çoğunun sonuçları birbirini doğrulamadı. Bugüne kadar yayınlanmış olan 21 genom-çapı ilişkilendirme çalışmasının (GWAS) hiçbirinde bu iki gene ait SNP'ler anlamlı olarak gösterilemedi. Bu çalışma, üç GWAS'A ait verileri (CATIE, GAIN ve nonGAIN) kullanarak, şizofreniye neden olan moleküler yolaklarda görev alan ERBB4 ve NRG1 gibi genlerin genetik rolünü bulmak için yenilikçi bir in silico analiz yöntemi geliştirmeyi hedeflemektedir. Bu amaçla çalışma kapsamında, üç veri setinde de ERBB4 ve NRG1 genlerinin şizofreni ile ilişkilendiren bölgeleri, iki farklı haplotip-analiz yöntemi kullanılarak tanımlandı: Haplotip-tabanlı lojistik regresyon modeli ve Haploview yazılımı. Aynı yöntemler kullanılarak, daha önceki çalışmalarda, bu iki genin şizofreni ile ilişkilendirilen bölgeleri en az iki veri setinde doğrulandı. İlk defa bu çalışmada tanımlanan bölgelerin işlevsel etkilerini bulmak için, bu bölgelere bağlanan transkripsiyon faktörleri tanımlandı. ERBB4 ve NRG1 genlerinin bu bölgelerine bağlanan transkripsiyon faktörlerinin şizofreniye yatkınlık yaptığı ya da hastalıkta koruyucu etkisi olduğu gözlemlendi. Bu çalışma, ilk defa, GWAS veri setlerinde in silico ve biyoinformatik tabanlı işlevsel analiz yöntemleri kullanarak, intronik varyasyonların şizofreni üzerinde etkisini tanımlamaktadır. Tez kapsamında kullanılan yöntemlerin, intronik değişimlerin işlevlerini anlamak açısından yüreklendirici sonuçlar verdiği gösterilmiştir.
Özet (Çeviri)
Schizophrenia, which is one of the most commonly reported illnesses among all psychiatric disorders, is defined as a complex disease; this implicates that it does not show a simple Mendelian pattern of inheritance. The discovery of the role of ERBB4-NRG1 axis has led to many publications, which studied the independent as well as interactive effects of ERBB4 and NRG1, associated with schizophrenia. However, most of these findings could not be validated in other studies. Also the all 21 genome-wide association studies in schizophrenia, published so far, could not identify any of ERBB4 and NRG1 SNPs as significant. This study exploits three publicly available genome-wide association study datasets: CATIE, GAIN and nonGAIN and aims to establish an innovative analysis methodology to highlight genetic significance of genes, such as ERBB4 and NRG1 that play crucial roles in molecular pathways leading to schizophrenia. In the framework of this study, novel regions of the ERBB4 and NRG1 genes associated with schizophrenia were identified in three large GWAS datasets using two different haplotype analyses, haplotype-based logistic regression and Haploview. Using the same methodology, previously associated ERBB4 and NRG1 blocks were validated. To predict the functional effects of novel blocks, transcription factors that bind to these regions were identified. This is the first study to perform an in silico and bioinformatics-based functional analysis of variants located within introns in schizophrenia subjects from GWAS datasets. The methodology exploited in this thesis gives promising results that facilitate our further understanding of the functional role of intronic variants.
Benzer Tezler
- Kentsel mekan sürekliliği/süreksizliği ve güvenlik ihtiyacı ilişkisi
Başlık çevirisi yok
CEREN KAHRAMAN
Yüksek Lisans
Türkçe
1998
Mimarlıkİstanbul Teknik ÜniversitesiMimarlık Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HASAN ŞENER
- Toplum ruh sağlığı merkezinde ve poliklinikte takip edilen remisyondaki şizofreni hastalarının içselleştirilmiş damgalanma ve çocukluk çağı travmaları açısından değerlendirildiği karşılaştırmalı bir çalışma
A comperative study on internalized stigma and childhood trauma of schizophrenia patients in remission who are followed in community mental health center and hospital clinic
EREN EZGİ GEVHER
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2018
Psikiyatriİzmir Katip Çelebi ÜniversitesiRuh Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NABİ ZORLU
- Şizofreni ve şizoafektif bozukluğun açık göz rengi ile ilişkisi
The relationship beetwen schizoprenia and schizoaffective disorder andlight eye color
BARAN SİYLİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2020
PsikiyatriPamukkale ÜniversitesiPsikiyatri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYŞE NUR İNCİ KENAR
- Şizofreni hastalarında metabolik sendrom, bilişsel fonksiyonlar ve d vitamini düzeylerinin birbirleri ile ilişkileri ve sağlıklı kontroller ile karşılaştırılması
Metabolic syndrome in patients wi̇th schizophrenia , cognitive functions and vitamin d levels in comparison with another relationship between healthy and controls
MUSTAFA ŞAHİN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2016
Psikiyatriİzmir Katip Çelebi ÜniversitesiPsikiyatri Ana Bilim Dalı
UZMAN SERHAN IŞIKLI
- Şizofreni hastalarında serum glial fibriller asidik protein (GFAP), serpına3, ıl-33 düzeyleri ve tedaviye dirençle ı̇lişkisi
Serum glial fibrillary acidic protein (GFAP), serpina3, il-33 levels in schizophrenia patients and their relationship with treatment resistance
TUĞÇE ÖZDEMİR TEKELİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
BiyokimyaAnkara ÜniversitesiTıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SERENAY ELGÜN ÜLKAR