Surveillance of prion protein (PrP) gene polymorphisms in Turkish native sheep breeds
Türkiye yerli koyun ırklarında prion protein (PrP) geni polimorfizmlerinin taranması
- Tez No: 313755
- Danışmanlar: PROF. DR. İNCİ TOGAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Middle East Technical University
- Yıl: 2012
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Skrapi, koyun ve keçilerin merkezi sinir sistemini etkileyen bulaşıcı ve ölümcül bir hastalıktır. Mevcut çalışmada, 14 yerli Türk Koyun ırkının (n=655) örnekleri, PrP gen polimorfizmleri (136, 141, 154 ve 171. kodonlardaki) baz alınarak incelenmiş ve klasik ve atipik skrapi risk seviyeleri belirlenmiştir.Önceki çalışmalar ile karşılaştırıldığında, Türkiye'deki koyunların 13 adet klasik skrapi alleli ve 14 adet atipik skrapi alleli ile en yüksek PrP genetik çeşitliliğine sahip oldukları bulunmuştur. Hem klasik skrapiye yatkın hem de yabani allel olan ARQ alleli, Türkiye koyun ırklarında en yaygın allel olarak bulunmuştur. Klasik skrapiye en yatkın allel olan VRQ alleli ise düşük frekanslarda 5 yerli koyun ırkında (Çine Çaparı, Dağlıç, Kıvırcık, Karayaka ve Gökçeada) tespit edilmiştir. Yeni ve daha önce rastlanmamış bir allel (TL141HQ) Sakız ırkında ilk defa sunulan bu çalışmada saptanmıştır.Türkiye yerli koyun ırklarında, klasik skrapi ile ilişkili genotiplerin çoğu R3 risk grubuna dahil olurken sıfır (0) ve bir (1) risk gruplarına dahil olan atipik skrapi ile ilişkili genotipler en yaygın olarak görülmüştür. Başka bir deyişle, genel olarak, Türkiye koyunlarının orta seviye klasik skrapi riskine ve düşük atipik skrapi riskine sahip oldukları bulunmuştur.Sunulan çalışmada elde edilen veriler, Türkiye'de klasik skrapi kontrolü için bir yetiştirme programının oluşturulmasına yardım edebilir ve ülkedeki hem hayvan hem de halkın sağlığı için faydalı olacaktır. Buna ek olarak, mevcut çalışmanın sonuçları Avrasya'daki PrP gen polimorfizm verilerinin coğrafi dağılımındaki boşluğu dolduracaktır.
Özet (Çeviri)
Scrapie is an infectious fatal disease of sheep and goats which affects the central nervous system. In the present study, samples of 14 native Turkish sheep breeds (n=655) were analyzed with respect to their polymorphisms of PrP gene (at codons: 136, 141, 154 and 171) and their classical and atypical scrapie risk levels were identified.Turkish sheep are found to have the highest PrP genetic variability with 13 classical scrapie alleles and 14 atypical scrapie alleles compared to all previous studies. Classical scrapie-susceptible and wild-type ARQ allele was found as the most frequent allele in Turkish sheep examined. The most classical scrapie-susceptible allele, VRQ was detected at low frequencies in 5 of the breeds (Çine Çaparı, Dağlıç, Kıvırcık, Karayaka and Gökçeada). One novel allele (TL141HQ) was observed in Sakız breed for the first time in this study.It was found that most of the classical scrapie genotypes belong to R3 risk group, whereas atypical scrapie genotypes belonging to zero (0) and one (1) risk groups were frequently seen in sheep analyzed. In other words, Turkish sheep is found to have intermediate risk of classical scrapie and low atypical scrapie risk, in general.The data from the current study may help to establish a breeding program for classical scrapie control in Turkey and will be beneficial for both the animal and public health in the country. In addition, the outcomes of the study will fill the gap which is present in the geographic distribution data of PrP gene polymorphisms in Eurasia.
Benzer Tezler
- Karbapenem dirençli enterobacteriaceae suşlarında direnç genetiğinin belirlenmesi ve yeni kullanıma giren antibiyotiklerin dirençli suşlar üzerinde etkinliğinin değerlendirilmesi
Determination of resistance genes in carbapenem-resistant enterobacteriaceae strains and evaluation of the effectiveness of newly introduced antibiotics against resistant strains
MEHMET ALİ AŞAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2025
Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiFırat ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KUTBEDDİN DEMİRDAĞ
- Santral sinir sistemi enfeksiyonu tanısı ile izlenen hastaların değerlendirilmesi, 19 (on dokuz) yıllık tek merkez deneyimi
Evaluation of patients with the diagnosis of central nervous system infection, a single center experience of 19 (nineteen) years
DİLŞAT TEPE
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2025
Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiKaradeniz Teknik ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ FİRDEVS AKSOY
- Diyabetes mellitus hastalarında hipertansiyon, hiperlipidemi, mikrovasküler ve makrovasküler komplikasyon oranı ve diyabetus mellitus kontrolu
Hyperlipidemia, hypertansion, microvasculer and macrovasculer complication rates (İndidences) and diabetes mellitus control of patients with diabetes mellitus
UTKU DÖNEM DİLLİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2010
Endokrinoloji ve Metabolizma HastalıklarıKaradeniz Teknik Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HALİL ÖNDER ERSÖZ
- Novel approaches to radar signal deinterleaving and geolocation in the framework of optimization and deep learning
Radar sinyal ayrıştırma ve konum bulma için optimizasyon ve derin öğrenme tabanlı yeni yaklaşımlar
MUSTAFA ATAHAN NUHOĞLU
Doktora
İngilizce
2025
Elektrik ve Elektronik Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiElektronik ve Haberleşme Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HAKAN ALİ ÇIRPAN
- Otomatik vezne makinaları (ATMs) ve uygulamaları
Autamated teller machines (ATMs) and applications
A. C. BANU ÇAĞLAR
Yüksek Lisans
Türkçe
1994
BankacılıkMarmara ÜniversitesiBankacılık Ekonomisi ve İşletmeciliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. METE DOĞRUER