İnsan endojen retrovirus H (HERV-H)'ın genomik analizi
Genomic analysis of human endogenous retrovirus H (HERV-H)
- Tez No: 316366
- Danışmanlar: PROF. DR. NERMİN GÖZÜKIRMIZI
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2012
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 89
Özet
Endojen retrovirüsler (ERV'ler) ve ERV benzeri diziler insan genomunun %8'ini oluşturmaktadır. ERV lokuslarının bilinmeyen bir kısmı transkripsiyona uğrar ve böylece insan transkriptomuna katılır. Bu bölgelerin küçük bir kısmı işlevsel proteinleri kodlar. ERV'lerin normal ve hastalıklı biyolojik süreçlerdeki rolü daha belirlenmediği için transkripsiyonu yapılan ERV lokusları ilgi çekmektedir. Bu çalışmada, insan endojen virüs H'ın (HERV-H) LTR7A (450 bç), LTR7B (464 bç) ve LTR7C (471 bç) bölgelerinin PZR ile analizi ve popülasyon arasındaki karşılaştırması amaçlanmıştır. Farklı etnik kökenli 20 bireyde alınan kan örnekleri, genomdaki entegrasyon bölgesi varyasyonlarının belirlenmesi için kullanılmıştır. Elde edilen genomik DNA'lar, HERV-H geninin LTR bölgelerini kapsayan 6 primer çifti ile incelenmiştir. ?Inter-retrotransposon amplified polymorphism? (IRAP) yöntemi polimorfizm analizleri için uygulanmıştır. Tüm bireylerde polimorfizm gözlenmiştir. Elde edilen bulguların, HERV-H'in insan popülasyonlarındaki değişimlerinin ve genoma olan etkilerinin anlaşılmasına katkı sağlaması beklenmektedir.
Özet (Çeviri)
Endogenous retroviruses (ERVs) and ERV-like sequences comprise 8% of the human genome. An unknown proportion of ERV loci are transcribed and thus contribute to the human transcriptome. A small proportion of these loci encode functional proteins. As the role of ERVs in normal and diseased biological processes is not yet known, transcribed ERV loci are of particular interest. In this study, we aimed to analyse LTR7A (450 bp), LTR7B (464 bp) and LTR7C (471 bp) parts of human endogenous retroviruses (HERV-H) with PZR and compare in between the population. Blood samples obtained from 20 individuals of different etnic origin were used for determination of the integration region variations at genome. Isolated genomic DNAs were screened using 6 primers pairs covering LTR regions of HERV-H gene. Inter-retrotransposon amplified polymorphism (IRAP) technique was performed for polymorphism analyses. İt wos observed polymorphism patterns in all individuals. Findings obtained are expected to contribute to understanding of the effects of HERV-H to the variation in human populations and the genome.
Benzer Tezler
- Multipl skleroz hastalığı etiyopatogenezinde, insan endojen retrovirüs-w (Herv-w)' nın rolü
The role of human endogeneus retrovirus-w (Herv-w) in the etiopathogenesis of multiple sclerosis disease
ZEKERİYA TAŞKIN
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
GenetikNecmettin Erbakan ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BAHADIR FEYZİOĞLU
- Normal ve diyabetik insan plasentalarinda syncytin proteninin dağilimi ve muhtemel görevleri
Distribution and potential roles of syncytin protein in normal and diabetic human placentas
GÜL BİKEM SOYGÜR
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
Histoloji ve EmbriyolojiAkdeniz ÜniversitesiHistoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. RAMAZAN DEMİR
- İnsan genomunda retrotranspozon ve endojen retrovirüs analizleri
Retrotransposon and endogenous retrovirus analysis in human genome
BUKET ÇAKMAK GÜNER
Doktora
Türkçe
2018
Genetikİstanbul ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NERMİN GÖZÜKIRMIZI
- Analysis of the mitotic kinase functions by chemical genetics approaches
Mitotik kinaz fonksiyonlarinin kimyasal genetik yaklaşimlarla i̇ncelenmesi
MEHMET ERGÜVEN
Yüksek Lisans
İngilizce
2019
BiyokimyaDokuz Eylül ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUHAMMED KASIM DİRİL
- Prostat kanserli hastalarda oksidan-antioksidan durum ve paraoksonazın bu duruma etkisinin araştırılması
Prostat kanserli hastalarda oksidan-antioksidan durum ve paraoksonazin bu duruma etkisinin araştirilmasi
NURİ ORHAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2011
BiyokimyaDüzce ÜniversitesiTıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. RAMAZAN MEMİŞOĞULLARI