Geri Dön

Arpa (Hordeum vulgare L.) kültür varyetelerinde transpozon ve kromozom analizleri

Transposon and chromosome analysis on barley (Hordeum vulgare L.) culture varieties

PDF İndir

  1. Tez No: 316458
  2. Yazar: SEVGİ MARAKLI
  3. Danışmanlar: PROF. DR. NERMİN GÖZÜKIRMIZI
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2012
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 102

Özet

Retrotranspozonlar genom içinde hareket edebilen elementlerdir. Hareketleri gelişim boyunca farklılık göstermektedir. Değişik dokularda retrotranspozon hareketlerindeki farklılık incelenmesine karşın gelişim süresinde hareket farklılığını inceleyen çalışmalar sınırlıdır. Bu çalışmada, arpada bitkisinde (Hordeum vulgare L. cv. Tokak 157/37) gelişim sırasında IRAP (?Inter Retrotransposon Amplified Polymorphism?) tekniği kullanılarak embriyo, kök ve yapraklarda BARE1 (Barley Retroelement 1) ve BAGY2 (Barley Gypsy Element 2) retrotranspozon hareketleri ve Revers Transkriptaz Polimeraz Zincir Reaksiyonu (?RT-PCR?) ile gen anlatım profilleri incelendi. Retrotranspozonlar moleküler düzeyde incelendikten sonra retrotranspozonların kromozomal düzeydeki etkileri arpa kromozomlarında analiz edildi.BARE1 ve BAGY2 retrotranspozonlarının hareketliliğini incelemek amacıyla DNA ve RNA izolasyonu yapıldı. Örnekler, 10 günlük kök ve yapraklardan alındı. Elde edilen DNA'lar kalıp olarak kullanıldı. BARE1 ve BAGY2 retrotranspozonları için ikişer farklı primer ile IRAP-PCR yapıldı. PCR ürünleri poliakrilamit jel elektroforezinde ayrıldı ve incelendi. İzole edilen RNA'lar ise, cDNA oluşturulmak üzere kalıp olarak kullanılarak gen anlatım profilleri açısından araştırıldı.Arpa kromozomlarının incelenmesi amacıyla, çimlendirilen arpa tohumları Carnoy fiksatifi (3:1, etanol:asetik asit) içerisine konuldu. Kök uçları daha sonra preparat yapımında kullanıldı. Metafaz evresinin gözlenmesi amacı ile preparatlar DAPI (4?,6-diamidin-2-fenilindol) ile boyanıp floresan mikroskopta incelendi.

Özet (Çeviri)

Retrotransposons are genetic elements that can move within the genome. Their movements show difference during development. Although retrotransposon movements were investigated in various tissues, studies on retrotransposon movements during development are limited. In this study, BARE1 (Barley Retroelement 1) and BAGY2 (Barley Gypsy Element 2) retrotransposon movements in barley (Hordeum vulgare L. cv. Tokak 157/37) embryo, root and leaves were investigated during development by using IRAP (Inter-Retrotransposon Amplified Polymorphism) technique and gene expression profiles by Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction (RT-PCR). After retrotransposons were investigated at molecular level, retrotransposons effects at chromosomal level were analysed barley chromosomes.DNA and RNA isolations were performed to examine BARE1 and BAGY2 retrotransposons movements. Samples were obtained from 10-day-old barley root and leaves. The resulting DNAs were used as template. IRAP-PCR for BARE1 and BAGY2 retrotransposons was carried out by using two different primers for each. PCR products were separated and analysed by Polyacrylamide Gel Electrophoresis (PAGE). Isolated RNAs used as template to synthesize cDNA were investigated in terms of gene expression profiles.Barley seeds were put into Carnoy fixative (3:1, ethanol:acetic acid) to investigate barley chromosomes. Root tips were then used for preparation. To observe metaphase phase, preparations were stained with DAPI (4',6-diamidino-2-phenylindole) and investigated by a fluorescence microscope.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    149759

    Sodyum klorürün bazı arpa (Hordeum vulgare L.) kültür çeşitlerinde minarel beslenme ve protein metabolizması üzerine etkileri

    Effects of sodium chloride on mineral nutrition and protein metabolism in some barley (Hordeum vulgare L.) cultivars

    BENGÜ TÜRKYILMAZ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    BiyolojiEge Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. AVNİ GÜVEN

  2. Tez No

    284499

    Arpa (Hordeum vulgare L.) çeşitlerinin hekzavalent krom stresine karşı toleransının belirlenmesi

    Determination of chromium tolerance of barley (Hordeum vulgare L.) cultivars to hexavalent chromium stress

    BEHİYE URUŞAK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    BiyolojiAfyon Kocatepe Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MUSTAFA YILDIZ

  3. Tez No

    514941

    Bazı arpa ( Hordeum vulgare L. ) genotiplerinde kurağa dayanım yönünden transpirasyon hızı ve su kullanım etkinliklerinin belirlenmesi

    Determination of transpiration rate and water use efficiency in terms of drought resistance in some barley( Hordeum vulgare L. ) genotypes

    HASAN DOĞAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    ZiraatDicle Üniversitesi

    Tarla Bitkileri Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MEHMET YILDIRIM

  4. Tez No

    338158

    Arpa (Hordeum vulgare L.) embriyo kültürüne uygulanan farklı 2,4-d dozlarının rejeneratif sürgünlerde kromozom yapısına etkisi

    The effect of different 2,4-d doses on chromosomal structure of regenerants in barley (Hordeum vulgare L.) embryo culture

    BERK BENLİOĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    BiyoteknolojiAnkara Üniversitesi

    Tarla Bitkileri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AHMET MURAT ÖZGEN

  5. Tez No

    346574

    Arpa (Hordeum vulgare L.) doku kültüründe sukkula retrotranspozon hareketlerinin belirlenmesi

    Determination of sukkula retrotransposon movements in barley (Hordeum vulgare L.) tissue culture

    GÖNÜL KARTAL ALAÇAM

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    Genetikİstanbul Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NERMİN GÖZÜKIRMIZI

Geri Dön