Östrojen reseptör alfa (ESR1) gen promotörünün metilasyon analizi
The methylation analysis of estragen receptor alpha (ESR1) gene promoter
- Tez No: 316937
- Danışmanlar: PROF. DR. NİHAN ERGİNEL-ÜNALTUNA
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Genetik, Moleküler Tıp, Genetics, Molecular Medicine
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2012
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 103
Özet
Amaç: Obezite, yağ dokusunda trigliseridin aşırı miktarda depolanması sonucu oluşur. Yağ dokusunda trigliserid depolanması ve yıkımında önemli rol alan östrojen reseptör alfa (ER?)'yı kodlayan gen olan ESR1'in obez bireylerdeki yağ dokusunda anlatımının azaldığı bilinmektedir. Bu çalışmada, obez bireylerin yağ dokusunda gözlenen azalmış ESR1 gen anlatımında, ESR1 gen promotor metilasyonunun sorumlu olup olmadığının araştırılması amaçlanmıştır. ESR1 gen promotor metilasyonunun, yağ dokusuna özgü olup olmadığını araştırmak amacı ile periferik kan örneklerinde de ESR1 promotor metilasyonunun incelenmesi planlanmıştır. Ayrıca, TEKHARF çalışma populasyonunda ESR1 rs2175898 gen polimorfizminin çeşitli kardiyovasküler risk faktörleri (obezite, dislipidemi ve hipertansiyon) ile ilişkilendirilmesi de amaçlanmıştır.Yöntem: Bu çalışmaya dahil edilen, obez olan ve olmayan 23 bireyin subkutan/omental yağ doku ve periferik kan örneklerinden DNA ve RNA izolasyonu yapılmıştır. ESR1 geninin A, C, E2 ve F promotor bölgeleri Metilasyon Spesifik-PZR yöntemi ile, mRNA düzeyleri ise Kantitatif-PZR yöntemi ile ölçülmüştür. ESR1 gen polimorfizmi hibridizasyon probları kullanılarak genotiplenmiştir. Tüm istatistiksel analizler SPSS (10.0) programı kullanılarak yapılmıştır.Bulgular: Obez bireylerin yağ dokusunda ESR1 gen promotor bölge metilasyonlarının incelenmesi sonucunda, promotor A'da %33.3, promotor C ve E2'de %100 oranında metilasyon tespit edilirken, promotor F'de metilasyon gözlenmemiştir. Obez bireylerin yağ dokusunda ESR1 mRNA düzeyinin anlamlı derecede azaldığı belirlenmiştir (p< 0.05). Fakat promotor metilasyonu ile gen ekspresyon düzeyi arasında herhangi bir ilişki gözlenmemiştir. Genotipleme analizlerine göre ise, TEKHARF çalışma grubundaki erkek bireylerde rs2175898 gen polimorfimi ile hipertansiyon arasında koruyucu yönde bir ilişki saptanmıştır (p
Özet (Çeviri)
Aim: Obesity is the consequence of excessive storage of triglycerides in adipose tissue. It is known that the expression of ESR1, the gene which codes for estrogen receptor alpha (ER?), which play important role in storage and hydrolizes of triglycerides, decreased in adipose tissue of obese individuals. In this study, it was aimed to investigate whether promoter methylation of ESR1 gene is responsible for this decreasement of ESR1 expression level in adipose tissues of obeses. It was also planned to analyze ESR1 promotre methylation in peripherial blood samples in order to quest whether ESR1 promoter methylation is specific for the adipose tissue. In addition, association between ESR1 rs2175898 polymorphism and various cardiovascular risk factors (obesity, dyslipidemia and hypertension) through TARF study population was intended.Methods: DNA and RNA samples were yielded from subcutaneus/omental adipose tissue and peripheral blood of 23 obese and non-obese individuals. Promoter regions, A, C, E2 and F of ESR1 gene, were analyzed by methylation specific PCR and mRNA levels were measured by quantitative RT-PCR. All statistical analyses were performed by SPSS (10.0).Results: According to analyzes of ESR1 gene promoter methylation in adipose tissue, methylation rations were found 33,3% for promoter A, 100% for promoter C and E2, while there was not found methylation in promoter F. ESR1 mRNA level was found to be significantly decreased in adipose tissues of obese individuals (p
Benzer Tezler
- Fibromiyalji hastalarında östrojen reseptör alfa (ESR1) gen polimorfizmlerinin analizi
Analysis of estrogen receptor alpha (ESR1) gene polymorphisms in fibromyalgia
HABİBE SEMA ARSLAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
GenetikGaziosmanpaşa ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. SERBÜLENT YİĞİT
- Menopoz sonrası kadınlarda, Osteokalsin, Östrojen reseptör, Kollajen1-A1 ve Kalsitonin reseptör genlerindeki polimorfizmlerin osteoporoz ile ilişkisi
Association of Osteocalcin, Estrogen receptor1, Collagen1-A1 and Calcitonin receptor gene polimorphisms with osteoporosis in postmenopausal women
ŞENGÜL TURAL
Doktora
Türkçe
2011
Tıbbi BiyolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NURTEN KARA
- Identification of modulatory functions of TP53, estrogen signaling, and 14q32.31 mirna cluster on chrna5 knock-down expression profile and development of syneRgy APP
Tp53, östrojen sinyal yolaği, ve 14q32.31 miRNA grubu'nun CHRNA5 deplesyon ifade profili üzerine etkilerinin belirlenmesi ve syneRgy uygulamasının geliştirilmesi
AYŞE GÖKÇE KEŞKÜŞ
Doktora
İngilizce
2021
Biyoistatistikİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiDisiplinlerarası Sinir Bilimleri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÖZLEN KONU KARAKAYALI
- Over rezerv testlerini değerlendirirken FSH ve AMH diskordansı bulunan olgularda FSHR ve ER gen polimorfizmlerinin araştırılması
FSHR and ER gene polymorfism research among women diagnosed with FSH and amh discordance during ovary reserve evaluation
GÖRKEM AKTAŞ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Kadın Hastalıkları ve DoğumSelçuk ÜniversitesiKadın Hastalıkları ve Doğum Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖZLEM SEÇİLMİŞ
- qPCR validation of in vivo diagnostic importance and regulation by estrogen for CHRNA5 isoform expression in breast cancer
Meme kanserinde CHRNA5 isoform ifadesinin ın vıvo tanısal önemi ve östrojenle düzenlenmesinın qpcr ile doğrulanması
EMİNE SILA ÖZDEMİR
Yüksek Lisans
İngilizce
2014
Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ÖZLEN KONU