Geri Dön

Klinik örneklerden izole edilen acınetobacter baumannıı izolatlarının epidemiyolojik özelliklerinin değerlendirilmesi

Evaluation of epidemiologic features of acinetobacter baumannii isolated from clinical samples

PDF İndir

  1. Tez No: 326529
  2. Yazar: HAKAN KESKİN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. F. ALPER TEKELİ
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Acinetobacter baumannii, karbapenemaz, moleküler epidemiyoloji, PFGE, sınıf 1 integron, Acinetobacter baumannii, carbapenemase, molecular epidemiology, PFGE, class 1 integron
  7. Yıl: 2012
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ankara Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 147

Özet

Klinik Örneklerden İzole Edilen Acinetobacter baumannii İzolatlarının Epidemiyolojik Özelliklerinin DeğerlendirilmesiAcinetobacter baumannii hastanelerde özellikle de yoğun bakım ünitelerinde mortalite ve morbiditeyi arttıran, hastane kaynaklı enfeksiyonların önemli bir nedenidir. Bu non-fermentatif, oksidaz negatif, gram negatif, aerobik kokobasil pnömoni, bakteriyemi, idrar yolu enfeksiyonu, yara enfeksiyonu ve menenjit gibi çeşitli fırsatçı enfeksiyondan izole edilebilir.Bu çalışmanın amacı Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi İbn-i Sina Hastanesi Merkez Bakteriyoloji laboratuvarına Nisan 2010-Aralık 2011 tarihleri arasında gönderilen kültür örneklerinde üreyen 160 hastaya ait 201 örnekten izole edilen Acinetobacter izolatlarının, klonal ilişkilerini ve epidemiyolojik özelliklerini değerlendirmektir.A. baumannii izolatlarının tanımlanması ve antibiyotik paternleri Vitek 2 (bioMérieux.S.A.Fransa) ve BD Phoenix (Becton Dickinson, ABD) sistemi ile yapıldı. Çalışmada antimikrobiyal ajan olarak amikasin, siprofloksasin, tetrasiklin, sulbaktam/ampisilin, trimetoprim/sülfametaksazol, seftazidim, gentamisin, imipenem, levofloksasin, meropenem, piperasilin/tazobaktam, sefaperazon/sulbaktam, sefepim, kolistin kullanıldı. A. baumannii antimikrobiyallerin çoğuna dirençli olarak bulundu, kolistin en duyarlı ajan olarak saptandı ve çalışma periyodu sırasında toplanan 201 izolatın 189 tanesi kolistin duyarlı bulundu. Bununla birlikte, A. baumannii izolatlarının beta-laktam antibiyotiklere dirençli oldukları belirlendi. Çalışmamızda Acinetobacter suşlarının ampisilin-sulbaktamla karşılaştırıldığında sefaperazon-sulbaktama daha duyarlı olduğu görüldü. Levofloksasin, siprofloksasin, amikasin ve gentamisine duyarlılık test edilen izolatlarda sırasıyla %2,5, %3, %32 ve %7,5 olarak saptandı.Karbapenem direncine neden olan enzimatik mekanizmalar ve integron taşıyıcılığı PZR yöntemiyle araştırıldı. MBL üretimine neden olan genlere ait sonuçlar negatif bulunurken OXA genleri değişik oranlarda (OXA-51 %100; OXA-23 %91,5; OXA-58 %7; OXA-24 %2) pozitif olduğu görüldü. Türkiye'de sık görülmesi nedeniyle PER-1 taşıyıcılığına bakıldı. Dirence neden olan genlerin gösterilmesi ve izolatlar arasında yayılımını sağlayabildiği için sınıf 1 integron varlığına bakıldı, %55,7 oranında pozitif bulundu.Acinetobacter izolatlarının klonal ilişkisi epidemiyolojik tiplendirmenin altın standardı olarak tanımlanan PFGE yöntemi ile araştırıldı. Acinetobacter baumannii izolatlarının ApaI ile kesilen genomik DNA'sına yapılan PFGE analizi ile dört farklı ana klon görüldü. Ortak bir salgın izolatı saptanmadı. Genotip A'da izolatlarda % 93 (n=27) diğer ana genotiplerde %100 oranında OXA-23 saptandı.Bu çalışma ile A. baumannii karbapenem direncinde OXA-51 ile birlikte bulunan OXA genlerinin önemli bir rol oynadığı gösterildi; çoklu antibiyotik direncinin bu bakteri ile olan enfeksiyonlarda hala önemli bir problem olduğu, dirence neden olan genler ve bu genlerin transferinde rol alan integronlara ilişkin epidemiyolojik veriler sunuldu. Beta-laktam direncine neden olan çeşitli enzimatik mekanizmalar ve izolatlar arasındaki epidemiyolojik ilişkiler araştırıldı.Sonuç olarak çoklu ilaç dirençli A. baumannii izolatlarının hastanemizde de oldukça yaygın olduğu görüldü, bu bakterinin sahip olduğu direnç mekanizmalarına yönelik saptayabildiğimiz epidemiyolojik verilerin hastanemizde ileriye yönelik araştırmalar ve tedavi yöntemleri açısından yararlı olabileceği düşünüldü. Hastanemizde bu çalışmanın devamı olarak enzimatik olmayan direnç mekanizmaları da araştırılıp hastalara ilişkin risk faktörleri de belirlenerek beta laktam ve karbapenem direncinden sorumlu izolatlara ilişkin epidemiyolojik veriler daha da kapsamlı bir şekilde ortaya konabilir.

Özet (Çeviri)

Evaluation of epidemiologic features of Acinetobacter baumannii isolated from clinical samplesAcinetobacter baumannii is a significant cause of hospital acquired infections which raises the rate of mortality and morbidity in health care settings, especially in Intensive Care Units. This non-fermantative, oxidase-negative, gram-negative aerobic cocobacillus may be isolated from various opportunistic infections such as pneumonia, bacteremia, urinary track infection, wound infection and meningitis.The aim of this study was to evaluate the clonal relationship and epidemiologic features of 201 Acinetobacter strains, isolated from various specimens of hospitalized patients between April 2010 and December 2011, at the clinical microbiology laboratuary of Ankara University Medical Faculty of İbn-i Sina Hospital.Identification of isolated A. baumannii and antibiotic susceptibility patterns were performed by Vitek 2 (bioMérieux.S.A,France) and BD Phoenix (Becton Dickinson, ABD) systems. In this study, amikacin, ciprofloxacin, tetracycline, sulbactam/ampiciline, trimethoprim/sulfamethoxazole, ceftazidime, gentamicin, imipenem, levofloxacin, meropenem, piperacillin/tazobactam, cefoperazone/sulbactam, cefepime and colistin were used as antimicrobial agents. It was seen that A. baumannii was resistant to many of the antimicrobials however colistin was the most susceptible agent against Acinetobacter isolates and 189 of 201 collected samples during the study period were found susceptible to colistin. In addition, it was determined that A. baumannii isolates were resistant to beta-lactam antibiotics. In our study when we compared ampicilin-sulbactam and cefoperazon-sulbactam , it was seen that cefoperazon-sulbactam was more susceptible. The susceptibilities of levofloxacin, ciprofloxacin, amicasin and gentamicin found as %2,5, %3, %32 and %7,5 respectively.Enzymatic mechanisms and integron carrier elements causing carbapenem resistance were searched by the PCR method. The genes encoding metallo beta-lactamases (MBL) production were absent, while OXA genes were present in different rates (OXA-51 %100; OXA-23 %91,5; OXA-58 %7; OXA-24 %2). Because PER-1 is common in Turkey, its presence was analysed. Class 1 integrons were examined based on the ability to capture genes causing resistance, it was found present at the rate of %55,7.The clonal relationship of Acinetobacter isolates was analysed by the pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) method, which is defined as the gold standard of epidemiological typing. In the PFGE analysis of A. baumannii isolates four different major clons were found. No common epidemic isolates were found. OXA-23 was determined in Genotype A isolates at a rate of %93? (n=27) and in other genotypes %100.With this study, it is shown that OXA genes especially together with OXA-51 has a significant role in A. baumannii carbapenem resistance; the multi-drug antibiotic resistance is still a major problem in infections with this bacteria. Genes causing resistance and epidemiological data relevant to integrons having a role in the transfer those genes were presented. Various enzymatic mchanisms causing beta-lactam resistance and epidemiological relationship between isolates have been observed.As a result, it is obvious that multidrug resistant A. baumannii isolates also quite common in our hospital. The epidemiologic data relevant to resistance mechanisms caused by this bacteria is supposed to be helpful for the prospective studies and treatment methods of our hospital. As a continue of this study, in our hospital, non enzymatic mechanisms may be researched and risk factors of patients can be determined to evaculate their relationship with Acinetobacter clones, thus a comprehensive epidemiologic data relevant to those isolates with beta-lactam and carbapenem resistance can be presented.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    667213

    Acinetobacter baumannii klinik suşlarının fenotipik ve genotipik özelliklerinin araştırılması

    Investigation of phenotypic and genotypic characteristics of acinetobacter baumannii clinical isolates

    NEZAHAT KOŞAR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıHitit Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AYŞE SEMRA GÜRESER

  2. Tez No

    803438

    2018-2021 yılları arasında hastanemiz yoğun bakım ünitelerinden gönderilen kan kültürü ve alt solunum yolu örneklerinden izole edilen gram negatif bakterilerin antibiyotik duyarlılık verileri ve direnç profiline COVİD-19 pandemisinin etkisi

    The effect of the COVİD-19 pandemic on the antibiotic susceptibility data and resistance profile of gram-negative bacteria isolated from blood cultures and lower respiratory tract samples sent from the intensive care units of OUR hospital between 2018-2021

    DİDEM ÖZKAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    MikrobiyolojiSağlık Bakanlığı

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AYFER BAKIR

  3. Tez No

    535883

    Klinik kaynaklı acinetobacter baumannii izolatlarında patotip- rezistotip-genotip kümelenmesi varlığının araştırılması

    Investigation of pathotype, resistotype and genotype clustering in acinetobacter baumannii isolates of clinical origin

    İNCİ DENİZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Moleküler TıpYeditepe Üniversitesi

    Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. İBRAHİM ÇAĞATAY ACUNER

  4. Tez No

    229712

    Anesteziyoloji ve Reanimasyon Yoğun Bakım Ünitesi'nde yatan hastalardan izole edilen acinetobacter kökenlerinin moleküler epidemiyolojisi

    Molecular Epidemiology of Acinetobacter spp. isolated from patients admitted in the Anesthesia and Reanimation Intensive Care Unit

    UĞUR DİNÇ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    MikrobiyolojiKaradeniz Teknik Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. GÜLÇİN BAYRAMOĞLU

  5. Tez No

    347721

    Acinetobacter baumannii suşlarında OXA-23 ve OXA-58 tipi genişlemiş spektrumlu Beta laktamaz varlığının araştırılması ve PFGE yöntemi ile klonal yakınlığının incelenmesi

    Detection of extended spectrum Beta lactamase type OXA-23 ve OXA-58 from the acinetobacter baumannii species and investigation of clonal relationship by PFGE

    ŞERAFETTİN KEYİK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    MikrobiyolojiSelçuk Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. UĞUR ARSLAN

Geri Dön