Amsacta mooreı entomopoksvirüs'e ait AMV197'nin trans-aktivasyonu ve konak seçiciliğindeki rolü
Trans-activation of AMV197 belong to amsacta moorei and its role in the host range of virus
- Tez No: 332067
- Danışmanlar: PROF. DR. ZİHNİ DEMİRBAĞ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Mikrobiyoloji, Biology, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2013
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Karadeniz Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 68
Özet
Daha önce yapılan çalışmalarda Amsacta moorei entomopoksvirüs'e ait AMV197 kodlu açık okuma zincirinin serin/treonin protein kinaz (pk) kodladığı belirlenmiştir ve virüs genomundaki bu gen yeşil floresan protein (GFP) geni ile yer değiştirilerek rekombinant virüs (Am-pk/gfp) oluşturulmuştu. Bu çalışmalara dayanılarak PK'ın virüsün replikasyonunda ve gen regülasyonunda rol oynadığı düşünülmüştür. Konak hücrenin ve virüs proteinlerinin virüs replikasyonundaki rolünü anlayabilmek için bu yüksek lisans tezinde protein kinaz (pk) geninin trans-aktivasyonunda rol alan proteinlerin belirlenmesi ve rekombinant virüs ve yaban tip virüsün enfeksiyonlarının farklı konaklarda karşılaştırılması hedeflenmiştir. pk geninin trans-aktivasyonunda rol oynayan proteinlerin belirlenmesi için South-Western Hibridizasyon deneyi gerçekleştirildi. Çalışma sonucunda işaretli proba bağlanabilen beş farklı protein bandı (50, 38, 35, 27 ve 16 kDa) belirlendi. Sonuçlar, pk'nın transa-ktivasyonunda rol oynayan proteinlerin virüs kökenli değil hücre kökenli olduğunu gösterdi. pk geninin virüs genomundan silinmesinin farklı konaklarda replikasyonu nasıl etkilediğini belirlemek için rekombinant virüs ve yaban tip virüsün farklı böcek hücrelerindeki (Lymantria dispar, Ld652 (kontrol); Bombyx mori, Bm; Spodoptera frugiperda, Sf9) DNA replikasyonları Slot-Blot Hibridizasyon yöntemiyle ve enfektivitesi End Point Dilution Assay (EPDA) ile karşılaştırıldı. Yapılan çalışmalar sonucunda, konak faktörlerinin pk genini kontrol ederek virüs replikasyonun da etkili olduğu sonucuna varıldı.
Özet (Çeviri)
Previous researches suggests that Amsacta moorei entomopoxvirus open reading frame AMV197 encodes a serine/threonine protein kinase, and a recombinant virus (Am-pk/gfp) was created by changing this gene with green fluorescent protein. Based on these studies it is thought that pk plays an important role in virus replication and gene regulation. In order to understand the the role of pk gene in host specificity and virus proteins in the virus replication, I have studied the transactivators of AMV197 and compared wild type and recombinant virüs replication in various cell lines. In order to determine proteins that has role in the transactivation of pk, South-western hybridization assay was performed. This study showed that cell proteins (50, 38, 35, 27 ve 16 kDa) play role in the transactivation of pk. In order to determine the role of pk in virus replication, wild type and recombinant virus were assayed in different cell lines (Lymantria dispar, Ld652 (control); Bombyx mori, Bm; Spodoptera frugiperda, Sf9) for virus yield and DNA replication. Slot-Blot Hybridization and End Point Dilution Assay (EPDA) showed that host factores play importans role during virus replication.
Benzer Tezler
- Amsacta moorei entomopoksvirüs protein kinaz geninin karakterizasyonu ve fonksiyonel analizi
Functional analysis and characterization of protein kinase gene (AMV197) of Amsacta moorei entomopoxvirus
HACER MURATOĞLU
Doktora
Türkçe
2010
BiyolojiKaradeniz Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZİHNİ DEMİRBAĞ
- Amsacta Moorei entomopoxvirus protein kinazlarının viral proteinlerle etkileşimlerinin belirlenmesi
Determination of protein protein interactions among protein kinases of amsacta moorei entomopoxvirus (AMEV) and protein kinases with the other proteins of AMEV
MEHTAP DANIŞMAZOĞLU
Doktora
Türkçe
2017
BiyolojiKaradeniz Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. REMZİYE NALÇACIOĞLU
- Amsacta moorei entomopoksvirüse ait AMV133 kodlu açık okuma zincirinin homolog rekombinasyonla silinmesi ve rekombinant virüs oluşturulması
Detection of AMV133 orf of Amsacta moorei entomopoxvirus by homolog recombination and consruction of recombinant virus
İNCİ CEVHER
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
BiyolojiKaradeniz Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. REMZİYE NALÇACIOĞLU
- Amsacta moori entomopoksvirüse ait AMV133 kodlu açık okuma zincirinin moleküler analizi
Molecular analysis of orf AMV133 encoded by Amsacta moorei entomopoxvirus
EMİNE DEMİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2009
BiyolojiKaradeniz Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZİHNİ DEMİRBAĞ
- Amsacta moorei entomopoxvirus (AMEV) muhtemel kaspaz orf'si̇ni̇n (AMV063) fonksi̇yonel anali̇zi̇
Functional analysis of putative amsacta moorei entomopoxvirus (AMEV) caspase orf (AMV063)
FUNDA BİLGİLİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
BiyoteknolojiKaradeniz Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HACER MURATOĞLU