Geri Dön

Yüzeyde güçlendirilmiş Raman spektroskopisi tekniği kullanılarak hedef DNA dizi tayini

Detection of target DNA sequence by using surface enhanced Raman spectroscopy technique

PDF İndir

  1. Tez No: 334749
  2. Yazar: MEHMET ŞÖFÖROĞLU
  3. Danışmanlar: PROF. DR. İSMAİL HAKKI BOYACI
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Gıda Mühendisliği, Biotechnology, Food Engineering
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2013
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 82

Özet

Bu çalışma kapsamında yüzeyde güçlendirilmiş Raman spektroskopisi (YGRS) tekniği kullanılarak hassas deoksiribonükleik asit (DNA) biyosensörü geliştirilmesi üzerine çalışılmıştır. Bu amaçla farklı özelliklere sahip iki manyetik partikül (Altın kaplı manyetik küre ve silika kaplı 3-aminopropiltrietoksisilan (APTS) modifiyeli manyetik nanopartikül) kullanılmıştır. Bunların yanında, YGRS etiketi olan 5,5-dithiobis (2-Nitrobenzoik asit) (DTNB) ile kaplanarak YGRS aktif hal getirilen ve bu sayede hedef dizilim varlığının saptanmasına olanak sağlayan altın nanoçubuklar kullanılmıştır. Çalışmada ilk adım olarak kullanılacak tüm partiküllerin yüzey modifikasyonlarını en düzgün şekilde yapabilmek ve ardından kurgulanan sistemden en iyi şekilde yararlanabilmek adına deney basamaklarındaki parametrelerin optimizasyonu yapılmıştır. Ardından genetik modifiye organizmaların (GMO) hızlı, seçici ve hassas bir şekilde analiz edilebilmesi amacıyla `sandviç analizi' olarak bilinen sistem uygulanmıştır. Bu sisteme göre hedef dizilime spesifik problarla modifiye edilmiş manyetik partikül, hedef dizilimin ortamdan seçici olarak ayrımına olanak sağlarken; DTNB ile kaplanmış altın nanoçubuklar ise DTNB molekülüne ait olan simetrik NO2 gerilmesine ait bant üzerinden gidilerek hedef dizilimin tayinine olanak sağlamaktadır. GMO analizine yönelik geliştirilen sisteme ait oluşturulan kalibrasyon eğrisinde 50-1000 nM aralığında çalışılmış ve elde edilen bant şiddetleri arasındaki R2 değeri 0,955 olarak bulunmuştur.

Özet (Çeviri)

Within the scope of this study, development of a sensitive deoxyribonucleic acid (DNA) biosensor by using surface enhance Raman spectroscopy (SERS) technique was studied. For this purpose two kinds of magnetic nanoparticles (Gold coated magnetic sphere and silica coated 3-aminopropyltriethoxysilane (APTS) modified magnetic nanoparticle) were used. Besides all these, gold nanorods which were become SERS active by coating with one of the SERS label molecule 5,5-dithiobis (2-Nitrobenzoic acid) (DTNB) and thus enables the detection of target sequences were used. In the first step of the study, all of the parameters in each step were optimized to ensure proper surface modifications for the nanoparticles and get the most out of the edited system. After that a system that is called `sandwich assay? was applied for rapid, selective and sensitive detection of genetic modified organisms (GMO). According to the system magnetic particles coated with target specific probes were enabled selective seperation of the target sequence from the media and DTNB coated nanorods made it possible to detect target sequence by following the symmetric NO2 stretching band that incident to DTNB molecule. To obtain calibration curve from the system that developed for GMO analysis, it was studied between 50-1000 nM target sequence molarities and R2 between the band intensities was 0,955.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    389416

    A novel AAO based sers substrate for characterization for characterization of proteins

    Yüzeyce güçlendirilmiş raman spektroskopisi ile protein karakterizasyonu için AAO şablonlar ile altlik üretimi

    ZEHRA BERİL AKINCI

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2013

    Biyolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Malzeme Bilimi ve Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUSTAFA KAMİL ÜRGEN

  2. Tez No

    346093

    Yüzeyde güçlendirilmiş Raman spektroskopisi kullanılarak ağır metal tayinine yönelik yeni sistemlerin geliştirilmesi

    Development of novel methods for the detection of heavy metal ions by using swurface enhanced Raman spectroscopy

    HAVVA TÜMAY TEMİZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    Gıda MühendisliğiHacettepe Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İSMAİL HAKKI BOYACI

  3. Tez No

    382729

    Multilayer plasmonic substrates for surface enhanced Raman spectroscopy

    Çok katmanlı plazmonik alttaşların yüzeyde güçlendirilmiş Raman spektroskopisi

    AYSUN ATAKİŞİ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2013

    Fizik ve Fizik MühendisliğiFatih Üniversitesi

    Fizik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. KURTULUŞ GÖLÇÜK

  4. Tez No

    416495

    Use of gold nanoparticle containing poly (allylamine hydrochloride)/ poly (acrylic acid) multilayer films as sers substrates

    Altın nanoparçacık içeren poli (allilamin hidroklorür)/ poli (akrilik asit) çok katmanlı filmlerin ygrs alttaşı olarak kullanılması

    BİRSU KÖLEMEN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2015

    KimyaOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. GÜLAY ERTAŞ

    YRD. DOÇ. DR. İREM EREL GÖKTEPE

  5. Tez No

    831672

    Multiscale modeling and simulations of polyelectrolyte multilayers and polyelectrolyte complexes

    Çok katmanlı polielektrolitler ve polielektrolit komplekslerin çok ölçekli modelleme ve simülasyonları

    ERHAN ÖZDEMİR

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    KimyaOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜLAY ERTAŞ

    DR. ÖĞR. ÜYESİ EROL YILDIRIM

Geri Dön