Role of FAM134B in liver cancer
FAM134B'nin karaciğer kanserindeki rolü
- Tez No: 335623
- Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET ÖZTÜRK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Moleküler Tıp, Onkoloji, Tıbbi Biyoloji, Molecular Medicine, Oncology, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2013
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 88
Özet
FAM134B (family with sequence similarity 134, member B) isimli protein laboratuarımızda ilk olarak seviyelerinin artışı hepatosellüler karsinomda hücre yaşlanması, siroz ve mezenkimal benzeri davranış durumları ile bağlantılı olabilecek bir protein olarak dikkat çekti, ve bu tez çalışmasının amacı FAM134B?nin hepatosellüler karsinomdaki rolünü tanımlamaktı. Bu tezdeki çalışmalar ilk olarak normal fare karaciğerinde 8 saatlik tünikamisin uygulamasi ile indüklenen endoplazmik reticulum (ER) stresinin, FAM134B mRNA ve protein seviyelerine önemli bir etkisi olmadığını gösterdi. Daha sonra da tapsigargin, tunikamisin ve DTT gibi indukleyiciler kullanılarak oluşturulan ER stresinin dört hepatosellüler karsinom hücre hattında da FAM134B mRNA ve protein seviyelerine önemli bir etkisi olmadığını gösterdik; tek istisnai durum yüksek doz DTT uygulanan ve hücre ölümü gösteren Snu449 hücreleri idi. Bunların yanısıra, FAM134B protein seviyelerinin PLC hücrelerinde TGF-ß ile indüklenen epitel-mezenkimal geçiş sırasında da artıyor olabileceğini gözlemledik. FAM134B?nin susturulduğu Snu449 hücrelerinin kültürde farklı bir morfolojiye sahip olduklarını, ve hareket kabiliyetlerini yitirdiklerini gözlemledik. Fakat en önemlisi, FAM134B?nin susturulduğu Snu449 hücreleri, tapsigargin ve adriamisin uygulamasına olan dirençlerini çok ciddi bir şekilde kaybettiler, ve bu iki ilacın da ER membranındaki kalsiyum pompalarının çalışmasına engel oldukları biliniyor. FAM134B?nin susturulduğu hücreler aynı zamanda serum yetersizliği, TGF-ß, tunikamisin ve alkol uygulamalarına olan dirençlerinde de kayıp gösterdiler, fakat 5-FU, camptotesin ve hidrojen peroksite olan dirençlerinde ciddi bir değişim gözlenmedi. Bu sonuçlar, FAM134B?nin hücre ölümüne neden olabilecek (özellikle de kalsiyum dengesinin bozulması gibi) birçok durumda hücrenin hayatta kalma mekanizmasında önemli bir rol oynayabileceğini gösteriyor.
Özet (Çeviri)
The family with sequence similarity 134, member B (FAM134B) protein initially caught attention in our laboratory through demonstrating elevated levels possibly associated with senescent, cirrhotic, and mesenchymal-like states in hepatocellular carcinoma (HCC), and the aim of this thesis work was to identify the role of FAM134B in HCC. The work in this thesis initially demonstrated that the induction of endoplasmic reticulum (ER) stress in normal mice livers with 8 hours of tunicamycin treatment did not significantly alter the levels of FAM134B mRNA or protein. We then demonstrated that induction of ER stress in four HCC cell lines using several ER stress inducers such as thapsigargin, tunicamycin or DTT did not cause a significant increase in the levels of FAM134B mRNA or protein, with the exception of high dose DTT treatment of Snu449 cells which also demonstrated apoptosis. We also observed that FAM134B protein levels may be elevated during epithelial-to-mesenchymal transition (EMT) in PLC cells induced by TGF-ß treatment. Snu449 cells in which FAM134B was silenced demonstrated an altered morphology in cell culture, and appeared to lose their migratory capabilities. Most significantly though, FAM134B-silenced Snu449 cells demonstrated a dramatic loss of resistance to treatment with thapsigargin and adriamycin, which are both known to inhibit the calcium pumps on the ER. The knockdown cells also demonstrated loss of resistance to serum starvation, TGF-ß treatment, tunicamycin and alcohol treatment, but no significant difference was observed in resistance to 5-FU, camptothecin and hydrogen peroxide. These results implicated that FAM134B may play a role that is essential for survival under several forms of cytotoxic threat, especially those that disturb calcium homeostasis.
Benzer Tezler
- Identification and characterisation of two endoplasmic reticulum protein isoforms encoded by senescence-associated FAM134B gene
Hücre yaşlanmasıyla ilintli FAM134B geni tarafından kodlanan iki endoplasmik retikulum protein izoformunun belirlenmesi ve karakterizasyonu
NİLGÜN TAŞDEMİR
Yüksek Lisans
İngilizce
2008
Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET ÖZTÜRK
- Biological functions of FAM134B and its associaction with cancer
FAM134B'nin biyolojik işlevleri ve kanserle ilişkisi
UMUR KELEŞ
Doktora
İngilizce
2020
BiyokimyaDokuz Eylül ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HATİCE GÜNEŞ ÖZHAN
PROF. DR. MEHMET ÖZTÜRK
- Tüm ekzom dizileme yöntemi ile şizofreniye yol açabilecek aday genlerin belirlenmesi
Using whole-exome sequencing to identify candidate genes for schizophrenia
VEYSEL DOĞAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2016
PsikiyatriBülent Ecevit ÜniversitesiRuh Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÖMER ŞENORMANCI
- Nefs tezkiyesinde namazın rolü
Role of prayer (namaz) one one's own purification of personality
ABDÜLHAMİT TEK
Yüksek Lisans
Türkçe
1999
DinAnkara ÜniversitesiTemel İslam Bilimleri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ETHEM CEBECİOĞLU
- Pediatrik rinosinüzitlerde allerjik zemin
Role of the allergy in pediatric rhinosinusitis
VACİD MUHAMMED AHMET
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1999
Kulak Burun ve Boğazİstanbul ÜniversitesiKulak Burun Boğaz Ana Bilim Dalı
PROF. DR. CENGİZ YAĞIZ